More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_05691 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_14831  putative isoamylase  50.37 
 
 		 668 aa  751    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451746  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15221  putative isoamylase  50.94 
 
 		 677 aa  764    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0893  alpha amylase domain-containing protein  56.36 
 
 		 686 aa  827    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0763625  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0577  alpha amylase domain-containing protein  66.67 
 
 		 692 aa  973    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2094  alpha amylase domain-containing protein  66.14 
 
 		 701 aa  949    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.159475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1420  alpha amylase domain-containing protein  51.53 
 
 		 677 aa  764    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13761  putative isoamylase  59.97 
 
 		 689 aa  916    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17491  putative isoamylase  56.42 
 
 		 686 aa  833    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05691  putative isoamylase  100 
 
 		 704 aa  1459    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15081  putative isoamylase  51.02 
 
 		 677 aa  754    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  46.88 
 
 		 694 aa  630  1e-179  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  43.56 
 
 		 706 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  42.49 
 
 		 705 aa  573  1.0000000000000001e-162  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3784  glycogen debranching enzyme GlgX  45.33 
 
 		 693 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  45.35 
 
 		 696 aa  571  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  43.52 
 
 		 708 aa  560  1e-158  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  45.11 
 
 		 693 aa  559  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  42.71 
 
 		 695 aa  550  1e-155  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3070  glycogen debranching enzyme GlgX  40.99 
 
 		 686 aa  542  1e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0162429 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  43.05 
 
 		 694 aa  535  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  43.05 
 
 		 694 aa  535  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  39.63 
 
 		 721 aa  494  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  41.29 
 
 		 724 aa  482  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  39.83 
 
 		 697 aa  478  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0893  glycogen debranching enzyme GlgX  38.29 
 
 		 693 aa  471  1.0000000000000001e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.409319  normal  0.933748 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  38.87 
 
 		 706 aa  462  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  40.8 
 
 		 721 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  42.21 
 
 		 720 aa  456  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  40.09 
 
 		 671 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  38.39 
 
 		 774 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4442  glycogen debranching enzyme GlgX  40.85 
 
 		 723 aa  454  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  36.51 
 
 		 729 aa  449  1e-125  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  39.27 
 
 		 704 aa  450  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  39.53 
 
 		 752 aa  451  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  35.73 
 
 		 718 aa  447  1.0000000000000001e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  38.35 
 
 		 709 aa  446  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  39.16 
 
 		 711 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  39.39 
 
 		 751 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  37.73 
 
 		 733 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3027  glycogen debranching enzyme GlgX  37.73 
 
 		 733 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  39.41 
 
 		 711 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1322  glycogen debranching enzyme GlgX  37.73 
 
 		 733 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831141  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1332  glycogen debranching enzyme GlgX  37.95 
 
 		 733 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  39.92 
 
 		 729 aa  436  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  39.33 
 
 		 712 aa  439  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  39.81 
 
 		 719 aa  439  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  38.08 
 
 		 709 aa  439  1e-121  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  37.55 
 
 		 722 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  37.78 
 
 		 756 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  39.51 
 
 		 715 aa  438  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  37.47 
 
 		 706 aa  436  1e-121  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  38.33 
 
 		 726 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  38.93 
 
 		 701 aa  435  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  38.33 
 
 		 723 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  38.84 
 
 		 707 aa  434  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  38.02 
 
 		 720 aa  434  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  37.47 
 
 		 758 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  36.97 
 
 		 755 aa  433  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  37.98 
 
 		 708 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  37.47 
 
 		 758 aa  433  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1249  glycogen debranching enzyme GlgX  37.57 
 
 		 735 aa  436  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  38.55 
 
 		 714 aa  434  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  39.36 
 
 		 720 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  38.77 
 
 		 712 aa  432  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  38.27 
 
 		 708 aa  429  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  38.44 
 
 		 706 aa  429  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  39.09 
 
 		 779 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  38.83 
 
 		 712 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  38.4 
 
 		 714 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  38.84 
 
 		 727 aa  430  1e-119  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  38.4 
 
 		 714 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  38.4 
 
 		 714 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  38.26 
 
 		 723 aa  431  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2983  glycogen debranching enzyme GlgX  39.08 
 
 		 718 aa  431  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602894  normal  0.0199459 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4049  glycogen debranching enzyme GlgX  38.53 
 
 		 766 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.928409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43578  predicted protein  36.1 
 
 		 765 aa  429  1e-118  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0789627  normal  0.106596 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  37.97 
 
 		 710 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  37.48 
 
 		 701 aa  426  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  39.02 
 
 		 711 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  42.04 
 
 		 707 aa  428  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  38.66 
 
 		 722 aa  429  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  39.17 
 
 		 716 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3936  glycogen debranching enzyme GlgX  38.53 
 
 		 766 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659462  normal  0.365741 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  38.08 
 
 		 721 aa  425  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  39.03 
 
 		 716 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  38.13 
 
 		 733 aa  424  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1471  glycogen debranching enzyme GlgX  38.07 
 
 		 683 aa  425  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  39.02 
 
 		 711 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2933  glycogen debranching enzyme GlgX  37.01 
 
 		 752 aa  424  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  37.92 
 
 		 710 aa  419  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  39.06 
 
 		 718 aa  420  1e-116  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  37.8 
 
 		 738 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  40.69 
 
 		 716 aa  422  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  37.93 
 
 		 1537 aa  422  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  37.71 
 
 		 722 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  37.31 
 
 		 718 aa  422  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  37.71 
 
 		 720 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2795  glycogen debranching enzyme GlgX  37.83 
 
 		 779 aa  421  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0466072  decreased coverage  0.00000490674 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  37.21 
 
 		 720 aa  420  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  37.71 
 
 		 720 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.257674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>