More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2859 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2859  glycogen debranching enzyme GlgX  100 
 
 		 690 aa  1428    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  61.84 
 
 		 706 aa  850    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4442  glycogen debranching enzyme GlgX  55.41 
 
 		 723 aa  776    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  44.56 
 
 		 721 aa  555  1e-156  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  46.15 
 
 		 697 aa  551  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  45.64 
 
 		 706 aa  548  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  45.63 
 
 		 708 aa  546  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  44.11 
 
 		 705 aa  547  1e-154  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3784  glycogen debranching enzyme GlgX  42.61 
 
 		 693 aa  538  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  45.09 
 
 		 694 aa  541  9.999999999999999e-153  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  44.43 
 
 		 694 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  44.43 
 
 		 694 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  46.08 
 
 		 724 aa  534  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43578  predicted protein  43.73 
 
 		 765 aa  531  1e-149  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0789627  normal  0.106596 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  47.58 
 
 		 696 aa  528  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  42.17 
 
 		 729 aa  522  1e-147  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0893  glycogen debranching enzyme GlgX  41.52 
 
 		 693 aa  520  1e-146  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.409319  normal  0.933748 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  41.97 
 
 		 718 aa  512  1e-144  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  46.62 
 
 		 693 aa  513  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  45.68 
 
 		 695 aa  509  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  40.86 
 
 		 774 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  42.41 
 
 		 714 aa  480  1e-134  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  41.75 
 
 		 726 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3070  glycogen debranching enzyme GlgX  43.01 
 
 		 686 aa  476  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0162429 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  41.07 
 
 		 710 aa  473  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  40.39 
 
 		 712 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  41.07 
 
 		 715 aa  466  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5114  glycogen debranching enzyme GlgX  41.6 
 
 		 708 aa  462  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.84007  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  41.3 
 
 		 710 aa  464  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  45.39 
 
 		 1537 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1471  glycogen debranching enzyme GlgX  42.84 
 
 		 683 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  41.2 
 
 		 730 aa  459  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  40.27 
 
 		 718 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  40.08 
 
 		 752 aa  458  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2795  glycogen debranching enzyme GlgX  40.17 
 
 		 779 aa  457  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0466072  decreased coverage  0.00000490674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  40.95 
 
 		 706 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  42.88 
 
 		 745 aa  458  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  42.22 
 
 		 720 aa  456  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  40.77 
 
 		 712 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  46.92 
 
 		 711 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  43.81 
 
 		 708 aa  452  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  40.3 
 
 		 706 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  40.3 
 
 		 712 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1350  glycogen debranching protein GlgX  45.9 
 
 		 776 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  41.47 
 
 		 671 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  41.18 
 
 		 701 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_19757  predicted protein  40.51 
 
 		 715 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.13703  normal  0.0212411 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  40.74 
 
 		 712 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  41.71 
 
 		 721 aa  454  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  40.67 
 
 		 709 aa  449  1e-125  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  41.87 
 
 		 701 aa  451  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  39.75 
 
 		 721 aa  451  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  40.75 
 
 		 714 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  40.75 
 
 		 714 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  39.76 
 
 		 707 aa  451  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  41.29 
 
 		 716 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3835  glycogen debranching enzyme GlgX  43.29 
 
 		 673 aa  451  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.124257  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  42.55 
 
 		 703 aa  449  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  41.76 
 
 		 720 aa  450  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  40.75 
 
 		 714 aa  451  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  42.86 
 
 		 711 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  44.56 
 
 		 704 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  41.91 
 
 		 758 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1601  glycogen debranching protein GlgX  41.35 
 
 		 701 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  41.91 
 
 		 758 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  39.94 
 
 		 709 aa  448  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  38.61 
 
 		 708 aa  449  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  46.05 
 
 		 691 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  40.62 
 
 		 721 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  43.02 
 
 		 711 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  40.71 
 
 		 716 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1973  glycogen debranching enzyme GlgX  40.47 
 
 		 721 aa  444  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0990735  hitchhiker  0.000349089 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  40.31 
 
 		 756 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3037  glycogen debranching enzyme GlgX  37.45 
 
 		 730 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  41.87 
 
 		 723 aa  446  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6785  glycogen debranching enzyme GlgX  44.1 
 
 		 718 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  41.18 
 
 		 755 aa  444  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  43.43 
 
 		 751 aa  442  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  41.13 
 
 		 723 aa  446  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13830  glycogen debranching enzyme GlgX  41.01 
 
 		 720 aa  439  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844349  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  41.78 
 
 		 779 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1782  glycogen debranching enzyme GlgX  41.49 
 
 		 688 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  40.29 
 
 		 727 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  40.43 
 
 		 727 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  41.58 
 
 		 704 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  40.03 
 
 		 719 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2449  putative glycosyl hydrolase  41.43 
 
 		 688 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  40.97 
 
 		 711 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  40.98 
 
 		 701 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  44.69 
 
 		 729 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3083  glycogen debranching enzyme GlgX  37.1 
 
 		 730 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  44.59 
 
 		 727 aa  440  9.999999999999999e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1112  glycogen debranching enzyme GlgX  41.29 
 
 		 688 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758297  normal  0.439261 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  41.19 
 
 		 738 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2983  glycogen debranching enzyme GlgX  40.68 
 
 		 718 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602894  normal  0.0199459 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  42.11 
 
 		 718 aa  437  1e-121  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  40.17 
 
 		 755 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  44.33 
 
 		 719 aa  436  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  40.87 
 
 		 738 aa  439  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  39.92 
 
 		 717 aa  437  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>