More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3315 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  54.83 
 
 
716 aa  740    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  52 
 
 
717 aa  737    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  47.04 
 
 
718 aa  705    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  53.86 
 
 
720 aa  757    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  52 
 
 
717 aa  739    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  53.94 
 
 
713 aa  762    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  71.77 
 
 
711 aa  1019    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0238  glycogen operon protein GlgX  49.71 
 
 
754 aa  665    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137822  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1332  glycogen debranching enzyme GlgX  48.63 
 
 
733 aa  649    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4166  glycogen debranching enzyme GlgX  51.16 
 
 
693 aa  669    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.830683  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  51.14 
 
 
727 aa  732    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6085  glycogen debranching enzyme GlgX  51.33 
 
 
705 aa  659    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0291933  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  51.43 
 
 
727 aa  738    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  55.92 
 
 
707 aa  789    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6323  glycogen debranching enzyme GlgX  49.93 
 
 
704 aa  645    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431119  normal  0.149748 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  53.08 
 
 
706 aa  759    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  53.35 
 
 
704 aa  744    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1206  glycogen debranching enzyme GlgX  49.63 
 
 
692 aa  661    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  52.49 
 
 
757 aa  701    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  54.78 
 
 
706 aa  789    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  51.29 
 
 
719 aa  733    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  50.57 
 
 
723 aa  713    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2449  putative glycosyl hydrolase  51.07 
 
 
688 aa  680    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1672  glycogen debranching enzyme GlgX  48.43 
 
 
691 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.574762  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7031  glycogen debranching protein GlgX  51.56 
 
 
708 aa  659    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261677  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  50 
 
 
733 aa  664    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1249  glycogen debranching enzyme GlgX  49.41 
 
 
735 aa  655    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  51.69 
 
 
715 aa  749    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2010  glycogen debranching enzyme GlgX  51.4 
 
 
788 aa  731    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  100 
 
 
711 aa  1456    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  52.68 
 
 
701 aa  744    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0505  glycogen debranching protein GlgX  52.61 
 
 
714 aa  733    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299874  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  52.82 
 
 
729 aa  732    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1322  glycogen debranching enzyme GlgX  48.48 
 
 
733 aa  648    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831141  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1070  glycogen debranching enzyme GlgX  46.23 
 
 
802 aa  651    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  70.89 
 
 
712 aa  1013    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1350  glycogen debranching protein GlgX  52.56 
 
 
776 aa  772    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3936  glycogen debranching enzyme GlgX  49.57 
 
 
766 aa  678    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659462  normal  0.365741 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1881  glycogen debranching protein GlgX  51.12 
 
 
691 aa  659    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  50.36 
 
 
733 aa  692    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  50.07 
 
 
720 aa  719    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  53 
 
 
710 aa  742    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  51.86 
 
 
717 aa  738    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  53.09 
 
 
719 aa  750    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  49.11 
 
 
716 aa  673    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  53.85 
 
 
719 aa  743    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  49.86 
 
 
701 aa  697    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3681  glycogen debranching protein GlgX  50.15 
 
 
692 aa  646    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1189  glycogen debranching protein GlgX  48.51 
 
 
688 aa  648    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.50354  normal  0.29921 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  50.5 
 
 
738 aa  723    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2864  putative glycogen operon protein GlgX  50.14 
 
 
739 aa  671    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3213  glycogen debranching protein GlgX  50.78 
 
 
728 aa  694    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3485  glycogen debranching protein GlgX  51.7 
 
 
692 aa  658    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1463  glycogen debranching protein GlgX  48.56 
 
 
692 aa  647    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  51.49 
 
 
721 aa  737    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  54.86 
 
 
727 aa  741    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1333  glycogen debranching protein GlgX  50.96 
 
 
705 aa  657    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0242466  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  50.07 
 
 
722 aa  719    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  52.41 
 
 
714 aa  744    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  56.25 
 
 
715 aa  805    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5488  glycogen debranching enzyme GlgX  51.48 
 
 
708 aa  673    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.168137  decreased coverage  0.0000616357 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  51 
 
 
691 aa  689    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  52.41 
 
 
714 aa  743    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4390  glycogen debranching enzyme GlgX  51.42 
 
 
737 aa  661    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.497261 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  52.19 
 
 
755 aa  700    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1136  glycogen debranching enzyme GlgX  50.35 
 
 
704 aa  662    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55158  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1112  glycogen debranching enzyme GlgX  50.93 
 
 
688 aa  677    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758297  normal  0.439261 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  52 
 
 
717 aa  738    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3835  glycogen debranching enzyme GlgX  53.7 
 
 
673 aa  651    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.124257  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  53.56 
 
 
707 aa  790    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  50.79 
 
 
745 aa  699    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2757  glycogen debranching enzyme GlgX  48.64 
 
 
752 aa  645    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2835  glycogen debranching enzyme GlgX  48.36 
 
 
752 aa  642    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2164  glycogen debranching enzyme GlgX  45.75 
 
 
708 aa  642    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5593  glycogen debranching enzyme GlgX  50.07 
 
 
704 aa  644    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  53.14 
 
 
716 aa  739    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6324  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  50.86 
 
 
691 aa  681    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.24347  normal  0.874434 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  54.74 
 
 
751 aa  778    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6496  glycogen debranching enzyme GlgX  50.96 
 
 
705 aa  657    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0828061  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  51.84 
 
 
718 aa  762    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2937  glycogen debranching enzyme GlgX  49.93 
 
 
703 aa  658    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  53.74 
 
 
1464 aa  762    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2933  glycogen debranching enzyme GlgX  48.1 
 
 
752 aa  642    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  55.98 
 
 
700 aa  747    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  54.82 
 
 
712 aa  780    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1782  glycogen debranching enzyme GlgX  50.79 
 
 
688 aa  680    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3733  glycogen debranching enzyme GlgX  50.14 
 
 
733 aa  689    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.635331  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0269  glycogen debranching enzyme GlgX  53.16 
 
 
733 aa  744    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.537346  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  55.92 
 
 
720 aa  731    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  54.21 
 
 
1537 aa  788    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  50.07 
 
 
720 aa  719    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  52.41 
 
 
714 aa  744    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6824  glycogen debranching enzyme GlgX  50.43 
 
 
739 aa  677    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100045  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  48.48 
 
 
733 aa  647    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  50.35 
 
 
738 aa  713    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  51.41 
 
 
714 aa  744    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  52.25 
 
 
723 aa  762    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2983  glycogen debranching enzyme GlgX  52.96 
 
 
718 aa  662    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602894  normal  0.0199459 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  51.21 
 
 
758 aa  705    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  50.93 
 
 
755 aa  701    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>