More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3070 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  54.26 
 
 		 708 aa  752    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3784  glycogen debranching enzyme GlgX  49.42 
 
 		 693 aa  689    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  51.53 
 
 		 693 aa  712    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  50.95 
 
 		 694 aa  726    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  54.48 
 
 		 706 aa  757    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  53.86 
 
 		 695 aa  739    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  51.91 
 
 		 694 aa  696    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  49.07 
 
 		 705 aa  692    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  51.91 
 
 		 694 aa  696    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  51.46 
 
 		 696 aa  714    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3070  glycogen debranching enzyme GlgX  100 
 
 		 686 aa  1428    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0162429 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  46.5 
 
 		 721 aa  616  1e-175  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0893  glycogen debranching enzyme GlgX  45.66 
 
 		 693 aa  604  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.409319  normal  0.933748 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  42.69 
 
 		 774 aa  600  1e-170  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  44.52 
 
 		 724 aa  566  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0577  alpha amylase domain-containing protein  43.35 
 
 		 692 aa  559  1e-158  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  44.4 
 
 		 729 aa  561  1e-158  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  44.68 
 
 		 718 aa  559  1e-158  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  44.53 
 
 		 697 aa  555  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13761  putative isoamylase  42.92 
 
 		 689 aa  555  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2094  alpha amylase domain-containing protein  42.65 
 
 		 701 aa  546  1e-154  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.159475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05691  putative isoamylase  40.99 
 
 		 704 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14831  putative isoamylase  44.48 
 
 		 668 aa  544  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451746  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1247  glycoside hydrolase family 13 protein  44.06 
 
 		 703 aa  540  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0827  glycogen debranching enzyme GlgX  43.91 
 
 		 705 aa  537  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125239  normal  0.0549007 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1471  glycogen debranching enzyme GlgX  43.13 
 
 		 683 aa  537  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1420  alpha amylase domain-containing protein  42.86 
 
 		 677 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4442  glycogen debranching enzyme GlgX  43.33 
 
 		 723 aa  535  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15081  putative isoamylase  42.99 
 
 		 677 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15221  putative isoamylase  42.35 
 
 		 677 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  41.38 
 
 		 671 aa  528  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  42.76 
 
 		 706 aa  528  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0893  alpha amylase domain-containing protein  41.19 
 
 		 686 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0763625  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17491  putative isoamylase  41.35 
 
 		 686 aa  524  1e-147  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  42.96 
 
 		 710 aa  509  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2983  glycogen debranching enzyme GlgX  42.41 
 
 		 718 aa  509  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602894  normal  0.0199459 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  40.56 
 
 		 714 aa  506  9.999999999999999e-143  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3037  glycogen debranching enzyme GlgX  40.78 
 
 		 730 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  42.7 
 
 		 721 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  42.82 
 
 		 711 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  47.13 
 
 		 712 aa  502  1e-141  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  42.67 
 
 		 711 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  41.65 
 
 		 708 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  43.11 
 
 		 707 aa  504  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3083  glycogen debranching enzyme GlgX  40.37 
 
 		 730 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  43.3 
 
 		 704 aa  502  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  42.2 
 
 		 714 aa  500  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  41.68 
 
 		 720 aa  497  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  41.78 
 
 		 718 aa  498  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  41.8 
 
 		 709 aa  497  1e-139  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  41.39 
 
 		 730 aa  494  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  47.04 
 
 		 707 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  41.05 
 
 		 721 aa  492  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  43.05 
 
 		 701 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  44.94 
 
 		 720 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  44.94 
 
 		 722 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  42.66 
 
 		 715 aa  492  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  41.09 
 
 		 779 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  43.22 
 
 		 720 aa  493  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1601  glycogen debranching protein GlgX  44.06 
 
 		 701 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  44.94 
 
 		 720 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  45.32 
 
 		 723 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  41.57 
 
 		 709 aa  492  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  41.7 
 
 		 711 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  43 
 
 		 708 aa  490  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  42.42 
 
 		 726 aa  489  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2700  glycogen debranching enzyme GlgX  42.02 
 
 		 845 aa  489  1e-137  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  41.36 
 
 		 722 aa  490  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  41.97 
 
 		 713 aa  491  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  45.98 
 
 		 1537 aa  489  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  42.49 
 
 		 703 aa  491  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  41.91 
 
 		 720 aa  489  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  46.71 
 
 		 721 aa  489  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  43.04 
 
 		 706 aa  491  1e-137  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  41.62 
 
 		 715 aa  490  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_19757  predicted protein  40.79 
 
 		 715 aa  488  1e-136  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.13703  normal  0.0212411 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  41.17 
 
 		 710 aa  487  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  41.64 
 
 		 716 aa  487  1e-136  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  41.39 
 
 		 720 aa  486  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  42.08 
 
 		 751 aa  488  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  45.55 
 
 		 712 aa  486  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  42.36 
 
 		 706 aa  484  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  41.37 
 
 		 711 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  40.91 
 
 		 738 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  45.96 
 
 		 700 aa  483  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  39.55 
 
 		 758 aa  480  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  39.27 
 
 		 756 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  41 
 
 		 719 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  39.55 
 
 		 758 aa  480  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  41.09 
 
 		 727 aa  481  1e-134  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  41.32 
 
 		 712 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  41.49 
 
 		 714 aa  482  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  41.49 
 
 		 714 aa  482  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1973  glycogen debranching enzyme GlgX  41.87 
 
 		 721 aa  480  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0990735  hitchhiker  0.000349089 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  41.49 
 
 		 714 aa  482  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  45.03 
 
 		 718 aa  478  1e-133  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  38.71 
 
 		 755 aa  478  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1350  glycogen debranching protein GlgX  46.23 
 
 		 776 aa  477  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  40.87 
 
 		 722 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  41.71 
 
 		 706 aa  478  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>