More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0827 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1247  glycoside hydrolase family 13 protein  88.63 
 
 		 703 aa  1303    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1471  glycogen debranching enzyme GlgX  65.77 
 
 		 683 aa  923    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0827  glycogen debranching enzyme GlgX  100 
 
 		 705 aa  1464    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125239  normal  0.0549007 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  46.84 
 
 		 693 aa  558  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  44.65 
 
 		 706 aa  557  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  44.57 
 
 		 708 aa  553  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  47.11 
 
 		 696 aa  552  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  45.69 
 
 		 694 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  45.69 
 
 		 694 aa  550  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  46.46 
 
 		 695 aa  545  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3070  glycogen debranching enzyme GlgX  43.91 
 
 		 686 aa  537  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0162429 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  43.31 
 
 		 721 aa  533  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  43.91 
 
 		 694 aa  532  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  41.93 
 
 		 705 aa  532  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3784  glycogen debranching enzyme GlgX  44.91 
 
 		 693 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  43.91 
 
 		 724 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  44.92 
 
 		 774 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0893  glycogen debranching enzyme GlgX  41.43 
 
 		 693 aa  518  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.409319  normal  0.933748 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  41.43 
 
 		 729 aa  513  1e-144  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  42.45 
 
 		 718 aa  509  1e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  42.76 
 
 		 697 aa  511  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  40.65 
 
 		 708 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  40.59 
 
 		 706 aa  473  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4442  glycogen debranching enzyme GlgX  41.36 
 
 		 723 aa  470  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  41.46 
 
 		 721 aa  470  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  41.49 
 
 		 715 aa  462  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  38.16 
 
 		 714 aa  461  9.999999999999999e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  40.27 
 
 		 710 aa  459  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  42.19 
 
 		 671 aa  459  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  42.69 
 
 		 710 aa  459  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  38.93 
 
 		 711 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  41.29 
 
 		 717 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  40.8 
 
 		 720 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  38.93 
 
 		 711 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  38 
 
 		 708 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  41.98 
 
 		 717 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  41.31 
 
 		 712 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  41.41 
 
 		 745 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  40.67 
 
 		 712 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  40.8 
 
 		 722 aa  445  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  40.62 
 
 		 729 aa  445  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  41.37 
 
 		 720 aa  445  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  40.78 
 
 		 701 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  42.2 
 
 		 717 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  38.54 
 
 		 720 aa  444  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  41.86 
 
 		 717 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  39.95 
 
 		 726 aa  446  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  40.27 
 
 		 706 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  41.38 
 
 		 719 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  40.03 
 
 		 715 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_19757  predicted protein  39.35 
 
 		 715 aa  440  9.999999999999999e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.13703  normal  0.0212411 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  40.61 
 
 		 712 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43578  predicted protein  39.66 
 
 		 765 aa  441  9.999999999999999e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0789627  normal  0.106596 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  37.74 
 
 		 707 aa  442  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  40.58 
 
 		 704 aa  437  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2859  glycogen debranching enzyme GlgX  41.57 
 
 		 690 aa  436  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  39.89 
 
 		 709 aa  437  1e-121  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  40.53 
 
 		 722 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  43.35 
 
 		 779 aa  439  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  41.28 
 
 		 716 aa  439  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  39.73 
 
 		 751 aa  436  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  40.57 
 
 		 714 aa  437  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  40.88 
 
 		 730 aa  437  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  41 
 
 		 716 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  39.42 
 
 		 718 aa  434  1e-120  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  40.95 
 
 		 727 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  39.3 
 
 		 723 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  40.7 
 
 		 712 aa  432  1e-120  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  43.64 
 
 		 727 aa  435  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2010  glycogen debranching enzyme GlgX  41.33 
 
 		 788 aa  432  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  41.09 
 
 		 706 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  40.44 
 
 		 711 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  44.07 
 
 		 717 aa  434  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  40.75 
 
 		 727 aa  432  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  40.36 
 
 		 755 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  39.73 
 
 		 756 aa  431  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  41.01 
 
 		 720 aa  432  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  39.06 
 
 		 706 aa  430  1e-119  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  40.36 
 
 		 758 aa  429  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  39.75 
 
 		 719 aa  432  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  41.57 
 
 		 757 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2700  glycogen debranching enzyme GlgX  39.03 
 
 		 845 aa  431  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  39.04 
 
 		 711 aa  432  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  38.11 
 
 		 718 aa  427  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  40.3 
 
 		 707 aa  427  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  40.36 
 
 		 758 aa  428  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  38.91 
 
 		 701 aa  426  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  43.4 
 
 		 703 aa  426  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  40.14 
 
 		 733 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  43.76 
 
 		 720 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  39.18 
 
 		 719 aa  426  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  39.68 
 
 		 716 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  40.22 
 
 		 738 aa  429  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  43.76 
 
 		 722 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  40.94 
 
 		 701 aa  426  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  40.22 
 
 		 738 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  41.3 
 
 		 755 aa  427  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  43.76 
 
 		 720 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13830  glycogen debranching enzyme GlgX  39.97 
 
 		 720 aa  424  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844349  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  39.59 
 
 		 721 aa  423  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>