More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0815 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3784  glycogen debranching enzyme GlgX  48.94 
 
 		 693 aa  672    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  52.22 
 
 		 774 aa  813    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  48.23 
 
 		 693 aa  661    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  100 
 
 		 721 aa  1506    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  50.86 
 
 		 708 aa  693    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  48.2 
 
 		 694 aa  646    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  48.46 
 
 		 694 aa  657    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  51 
 
 		 706 aa  697    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  47.68 
 
 		 695 aa  654    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  48.73 
 
 		 705 aa  668    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  48.46 
 
 		 694 aa  657    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  50.72 
 
 		 697 aa  738    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  47.79 
 
 		 671 aa  636    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  48.29 
 
 		 696 aa  650    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0893  glycogen debranching enzyme GlgX  56.58 
 
 		 693 aa  831    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.409319  normal  0.933748 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  47.11 
 
 		 706 aa  630  1e-179  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3070  glycogen debranching enzyme GlgX  46.5 
 
 		 686 aa  616  1e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0162429 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4442  glycogen debranching enzyme GlgX  44.89 
 
 		 723 aa  596  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405829  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  44.96 
 
 		 724 aa  594  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  45.75 
 
 		 729 aa  593  1e-168  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  42.98 
 
 		 718 aa  578  1.0000000000000001e-163  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2859  glycogen debranching enzyme GlgX  44.56 
 
 		 690 aa  555  1e-156  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  44.17 
 
 		 720 aa  546  1e-154  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  42.76 
 
 		 710 aa  545  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  41.59 
 
 		 714 aa  533  1e-150  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  43.3 
 
 		 708 aa  535  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0577  alpha amylase domain-containing protein  42.29 
 
 		 692 aa  532  1e-150  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  43.09 
 
 		 755 aa  535  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  44.04 
 
 		 726 aa  535  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0827  glycogen debranching enzyme GlgX  43.31 
 
 		 705 aa  533  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125239  normal  0.0549007 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  43.97 
 
 		 706 aa  530  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  43.77 
 
 		 708 aa  531  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  42.09 
 
 		 756 aa  526  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  43.02 
 
 		 721 aa  526  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  42.29 
 
 		 1464 aa  528  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1247  glycoside hydrolase family 13 protein  43.65 
 
 		 703 aa  528  1e-148  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  42.74 
 
 		 758 aa  525  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  44.4 
 
 		 707 aa  524  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  42.74 
 
 		 758 aa  525  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  42.49 
 
 		 729 aa  521  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  41.63 
 
 		 751 aa  519  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1471  glycogen debranching enzyme GlgX  43.59 
 
 		 683 aa  517  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  41.39 
 
 		 720 aa  515  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  41.59 
 
 		 712 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  41.95 
 
 		 1537 aa  514  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  42.98 
 
 		 710 aa  515  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  42.66 
 
 		 715 aa  514  1e-144  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  42.17 
 
 		 712 aa  515  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  42.64 
 
 		 779 aa  510  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  41.45 
 
 		 712 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  43.3 
 
 		 718 aa  509  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  41.18 
 
 		 712 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  41.62 
 
 		 720 aa  511  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  41.94 
 
 		 721 aa  509  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  40.22 
 
 		 718 aa  506  9.999999999999999e-143  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2094  alpha amylase domain-containing protein  41.77 
 
 		 701 aa  508  9.999999999999999e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.159475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  42.82 
 
 		 722 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  42.54 
 
 		 711 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43578  predicted protein  40.62 
 
 		 765 aa  508  9.999999999999999e-143  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0789627  normal  0.106596 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  42.49 
 
 		 711 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  42.77 
 
 		 752 aa  508  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  41.33 
 
 		 717 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  41.18 
 
 		 711 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  41.22 
 
 		 719 aa  504  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  42.9 
 
 		 701 aa  505  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  41.36 
 
 		 730 aa  502  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_19757  predicted protein  41.84 
 
 		 715 aa  503  1e-141  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.13703  normal  0.0212411 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13761  putative isoamylase  40.45 
 
 		 689 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  43.31 
 
 		 714 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  41.19 
 
 		 717 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  43.45 
 
 		 714 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  43.31 
 
 		 714 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  41.48 
 
 		 719 aa  501  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  42.56 
 
 		 709 aa  501  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  41.33 
 
 		 717 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  44.34 
 
 		 727 aa  500  1e-140  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  42.29 
 
 		 722 aa  499  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5114  glycogen debranching enzyme GlgX  42.72 
 
 		 708 aa  501  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.84007  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2795  glycogen debranching enzyme GlgX  42.07 
 
 		 779 aa  501  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0466072  decreased coverage  0.00000490674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  41.43 
 
 		 723 aa  501  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  41.43 
 
 		 704 aa  500  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3835  glycogen debranching enzyme GlgX  40.65 
 
 		 673 aa  496  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.124257  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  40.64 
 
 		 727 aa  499  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  40.52 
 
 		 727 aa  498  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  42.6 
 
 		 701 aa  496  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  41.29 
 
 		 733 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  40.92 
 
 		 717 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  42.59 
 
 		 706 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  41.14 
 
 		 757 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  40.51 
 
 		 745 aa  495  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  40.9 
 
 		 709 aa  492  9.999999999999999e-139  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3213  glycogen debranching protein GlgX  41.85 
 
 		 728 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05691  putative isoamylase  39.63 
 
 		 704 aa  494  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  39.89 
 
 		 716 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  39.89 
 
 		 716 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  41.92 
 
 		 712 aa  493  9.999999999999999e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1601  glycogen debranching protein GlgX  42.3 
 
 		 701 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  40.5 
 
 		 711 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  40.97 
 
 		 714 aa  492  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2983  glycogen debranching enzyme GlgX  39.27 
 
 		 718 aa  489  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602894  normal  0.0199459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>