More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3439 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  73.8 
 
 		 693 aa  1051    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  50.61 
 
 		 774 aa  665    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  50.86 
 
 		 721 aa  693    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  56.37 
 
 		 694 aa  797    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  100 
 
 		 708 aa  1468    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  62.54 
 
 		 695 aa  893    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  54.81 
 
 		 694 aa  771    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  55.59 
 
 		 705 aa  810    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  97.45 
 
 		 706 aa  1429    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  54.81 
 
 		 694 aa  771    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  50.52 
 
 		 697 aa  657    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3784  glycogen debranching enzyme GlgX  55.23 
 
 		 693 aa  771    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  72.73 
 
 		 696 aa  1031    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0893  glycogen debranching enzyme GlgX  48.84 
 
 		 693 aa  668    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.409319  normal  0.933748 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3070  glycogen debranching enzyme GlgX  54.26 
 
 		 686 aa  752    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0162429 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  45.86 
 
 		 729 aa  615  1e-175  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  47.82 
 
 		 724 aa  596  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  44.43 
 
 		 718 aa  597  1e-169  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0577  alpha amylase domain-containing protein  45.92 
 
 		 692 aa  583  1.0000000000000001e-165  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2094  alpha amylase domain-containing protein  45.49 
 
 		 701 aa  580  1e-164  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.159475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  45.75 
 
 		 671 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4442  glycogen debranching enzyme GlgX  46.27 
 
 		 723 aa  572  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05691  putative isoamylase  43.52 
 
 		 704 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  43.02 
 
 		 714 aa  558  1e-157  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1247  glycoside hydrolase family 13 protein  46.54 
 
 		 703 aa  556  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  43.28 
 
 		 706 aa  558  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13761  putative isoamylase  42.04 
 
 		 689 aa  555  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0827  glycogen debranching enzyme GlgX  44.57 
 
 		 705 aa  553  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125239  normal  0.0549007 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1471  glycogen debranching enzyme GlgX  46.59 
 
 		 683 aa  551  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  47.08 
 
 		 720 aa  550  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2859  glycogen debranching enzyme GlgX  45.63 
 
 		 690 aa  546  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2983  glycogen debranching enzyme GlgX  45.21 
 
 		 718 aa  543  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602894  normal  0.0199459 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17491  putative isoamylase  41.08 
 
 		 686 aa  538  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0893  alpha amylase domain-containing protein  42.55 
 
 		 686 aa  536  1e-151  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0763625  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43578  predicted protein  42.13 
 
 		 765 aa  538  1e-151  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0789627  normal  0.106596 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  45.48 
 
 		 708 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15221  putative isoamylase  42.62 
 
 		 677 aa  531  1e-149  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  44.08 
 
 		 708 aa  530  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  43.41 
 
 		 726 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  45.61 
 
 		 715 aa  529  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  44.59 
 
 		 720 aa  530  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  48.73 
 
 		 718 aa  526  1e-148  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14831  putative isoamylase  42.46 
 
 		 668 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451746  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  43.87 
 
 		 706 aa  526  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1420  alpha amylase domain-containing protein  41.58 
 
 		 677 aa  528  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  50.7 
 
 		 1537 aa  525  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  46.89 
 
 		 703 aa  525  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  45.53 
 
 		 701 aa  524  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  44.88 
 
 		 710 aa  524  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  44.68 
 
 		 712 aa  524  1e-147  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  43.35 
 
 		 707 aa  519  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1350  glycogen debranching protein GlgX  49.48 
 
 		 776 aa  517  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  44.11 
 
 		 704 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15081  putative isoamylase  42.14 
 
 		 677 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  43.74 
 
 		 714 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  48.7 
 
 		 722 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  44.12 
 
 		 706 aa  514  1e-144  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  43.38 
 
 		 709 aa  510  1e-143  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  48.13 
 
 		 711 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  44.41 
 
 		 701 aa  512  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  43.1 
 
 		 712 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  44.11 
 
 		 730 aa  509  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  43.68 
 
 		 710 aa  511  1e-143  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  47.96 
 
 		 711 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  43.3 
 
 		 751 aa  509  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  44.36 
 
 		 711 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  44.64 
 
 		 709 aa  505  9.999999999999999e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  43.39 
 
 		 712 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  47.55 
 
 		 721 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  42.43 
 
 		 721 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  43.35 
 
 		 711 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  46.31 
 
 		 712 aa  502  1e-141  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  41.76 
 
 		 721 aa  504  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  48.45 
 
 		 720 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  45.05 
 
 		 727 aa  503  1e-141  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  48.45 
 
 		 722 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3037  glycogen debranching enzyme GlgX  45.42 
 
 		 730 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  43.05 
 
 		 715 aa  504  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  47.47 
 
 		 717 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3083  glycogen debranching enzyme GlgX  45.26 
 
 		 730 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  48.45 
 
 		 720 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  43.56 
 
 		 723 aa  503  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  47.22 
 
 		 717 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1249  glycogen debranching enzyme GlgX  43.13 
 
 		 735 aa  500  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  43.12 
 
 		 712 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  42.56 
 
 		 758 aa  499  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_19757  predicted protein  42.19 
 
 		 715 aa  500  1e-140  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.13703  normal  0.0212411 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  44.6 
 
 		 700 aa  499  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  43.06 
 
 		 720 aa  501  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  47.05 
 
 		 717 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  42.42 
 
 		 758 aa  498  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  48.44 
 
 		 707 aa  496  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  42.84 
 
 		 722 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  43.73 
 
 		 706 aa  497  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  47.05 
 
 		 717 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  42.07 
 
 		 756 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  42.42 
 
 		 723 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  42.09 
 
 		 779 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  43.98 
 
 		 714 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  43.98 
 
 		 714 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>