More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0296 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  100 
 
 		 724 aa  1493    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0893  glycogen debranching enzyme GlgX  47.61 
 
 		 693 aa  633  1e-180  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.409319  normal  0.933748 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  48.21 
 
 		 697 aa  624  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  47.38 
 
 		 694 aa  610  1e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  44.16 
 
 		 729 aa  611  1e-173  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  45.32 
 
 		 706 aa  608  1e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  47.5 
 
 		 706 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  47.84 
 
 		 693 aa  598  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3784  glycogen debranching enzyme GlgX  47.42 
 
 		 693 aa  601  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  44.93 
 
 		 721 aa  599  1e-170  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  47.56 
 
 		 708 aa  597  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  48.03 
 
 		 695 aa  598  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  44.4 
 
 		 718 aa  593  1e-168  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  44.6 
 
 		 705 aa  587  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4442  glycogen debranching enzyme GlgX  46.07 
 
 		 723 aa  586  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  47.38 
 
 		 696 aa  587  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  43.22 
 
 		 714 aa  583  1.0000000000000001e-165  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  45.85 
 
 		 694 aa  581  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  45.85 
 
 		 694 aa  581  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3070  glycogen debranching enzyme GlgX  44.52 
 
 		 686 aa  567  1e-160  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0162429 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  46.19 
 
 		 774 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  45.53 
 
 		 730 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  47.3 
 
 		 712 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  46.94 
 
 		 706 aa  560  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  45.96 
 
 		 720 aa  559  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  46.73 
 
 		 671 aa  558  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  47.14 
 
 		 715 aa  556  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  45.06 
 
 		 714 aa  555  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  45.08 
 
 		 1537 aa  550  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  45.6 
 
 		 716 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  44.35 
 
 		 718 aa  550  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  44.04 
 
 		 715 aa  551  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  45.85 
 
 		 716 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  43.2 
 
 		 710 aa  547  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  44.12 
 
 		 704 aa  546  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  45.53 
 
 		 757 aa  547  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  44.57 
 
 		 711 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  46.83 
 
 		 706 aa  548  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1973  glycogen debranching enzyme GlgX  45.48 
 
 		 721 aa  548  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0990735  hitchhiker  0.000349089 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  44.33 
 
 		 755 aa  546  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  44.57 
 
 		 711 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  42.1 
 
 		 708 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  45.01 
 
 		 720 aa  543  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  47.02 
 
 		 722 aa  542  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  43.82 
 
 		 720 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  44.88 
 
 		 779 aa  542  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  43.82 
 
 		 722 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  43.78 
 
 		 707 aa  543  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  43.82 
 
 		 720 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  44.15 
 
 		 713 aa  540  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  48.38 
 
 		 703 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  43.84 
 
 		 751 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5114  glycogen debranching enzyme GlgX  45.44 
 
 		 708 aa  541  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.84007  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  45.23 
 
 		 720 aa  535  1e-151  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  43.04 
 
 		 756 aa  536  1e-151  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  43.92 
 
 		 722 aa  533  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  43.75 
 
 		 714 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2795  glycogen debranching enzyme GlgX  43.68 
 
 		 779 aa  533  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0466072  decreased coverage  0.00000490674 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  43.51 
 
 		 701 aa  533  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  44.06 
 
 		 721 aa  533  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  42.82 
 
 		 710 aa  534  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1601  glycogen debranching protein GlgX  44.94 
 
 		 701 aa  533  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  44.24 
 
 		 717 aa  535  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2859  glycogen debranching enzyme GlgX  46.08 
 
 		 690 aa  535  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  42.8 
 
 		 704 aa  532  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  43.75 
 
 		 714 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  43.75 
 
 		 714 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  44.36 
 
 		 723 aa  532  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  47.06 
 
 		 701 aa  531  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  44.48 
 
 		 707 aa  531  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  44.12 
 
 		 720 aa  531  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13830  glycogen debranching enzyme GlgX  43.1 
 
 		 720 aa  530  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844349  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  42.49 
 
 		 738 aa  531  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  43.38 
 
 		 721 aa  530  1e-149  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  43.08 
 
 		 719 aa  526  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  44.15 
 
 		 719 aa  528  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  44.09 
 
 		 719 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  46.89 
 
 		 727 aa  525  1e-148  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  42.61 
 
 		 721 aa  525  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  43 
 
 		 717 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1471  glycogen debranching enzyme GlgX  44.19 
 
 		 683 aa  527  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  42.74 
 
 		 712 aa  528  1e-148  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  43.85 
 
 		 711 aa  528  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  43.14 
 
 		 752 aa  528  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  46.71 
 
 		 718 aa  522  1e-147  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  42.05 
 
 		 717 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  42.31 
 
 		 738 aa  524  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  45.93 
 
 		 708 aa  524  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  42.19 
 
 		 717 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3083  glycogen debranching enzyme GlgX  40.76 
 
 		 730 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1247  glycoside hydrolase family 13 protein  45.11 
 
 		 703 aa  523  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  42.94 
 
 		 755 aa  524  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  45.07 
 
 		 720 aa  524  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3037  glycogen debranching enzyme GlgX  40.76 
 
 		 730 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  43.99 
 
 		 712 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0827  glycogen debranching enzyme GlgX  43.91 
 
 		 705 aa  519  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125239  normal  0.0549007 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  42.79 
 
 		 758 aa  521  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  42.65 
 
 		 758 aa  519  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  42.05 
 
 		 717 aa  522  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43578  predicted protein  43.36 
 
 		 765 aa  522  1e-146  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0789627  normal  0.106596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>