More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1895 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  55.59 
 
 		 708 aa  810    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  54.6 
 
 		 693 aa  803    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  49.7 
 
 		 774 aa  663    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  48.73 
 
 		 721 aa  668    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  57.53 
 
 		 694 aa  835    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  55.44 
 
 		 706 aa  812    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3784  glycogen debranching enzyme GlgX  63.28 
 
 		 693 aa  943    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  61.3 
 
 		 694 aa  897    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  55.14 
 
 		 695 aa  798    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  100 
 
 		 705 aa  1476    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  61.3 
 
 		 694 aa  897    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  51.92 
 
 		 697 aa  682    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  54.01 
 
 		 696 aa  783    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0893  glycogen debranching enzyme GlgX  48.09 
 
 		 693 aa  667    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.409319  normal  0.933748 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3070  glycogen debranching enzyme GlgX  49.07 
 
 		 686 aa  692    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0162429 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  45.56 
 
 		 729 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  46.04 
 
 		 706 aa  603  1.0000000000000001e-171  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  44.44 
 
 		 718 aa  598  1e-170  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  45.53 
 
 		 714 aa  588  1e-166  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  44.6 
 
 		 724 aa  587  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4442  glycogen debranching enzyme GlgX  43.76 
 
 		 723 aa  585  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  44.77 
 
 		 671 aa  587  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05691  putative isoamylase  42.49 
 
 		 704 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2094  alpha amylase domain-containing protein  42.88 
 
 		 701 aa  563  1.0000000000000001e-159  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.159475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  43.92 
 
 		 720 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0577  alpha amylase domain-containing protein  41.77 
 
 		 692 aa  557  1e-157  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  43.66 
 
 		 706 aa  550  1e-155  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13761  putative isoamylase  41.57 
 
 		 689 aa  551  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2859  glycogen debranching enzyme GlgX  44.11 
 
 		 690 aa  547  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  44.74 
 
 		 715 aa  548  1e-154  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1471  glycogen debranching enzyme GlgX  43.3 
 
 		 683 aa  547  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  43.07 
 
 		 710 aa  543  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1247  glycoside hydrolase family 13 protein  43.06 
 
 		 703 aa  545  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  43.3 
 
 		 709 aa  533  1e-150  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  43.33 
 
 		 726 aa  535  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43578  predicted protein  41.27 
 
 		 765 aa  533  1e-150  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0789627  normal  0.106596 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0827  glycogen debranching enzyme GlgX  41.93 
 
 		 705 aa  532  1e-150  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125239  normal  0.0549007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  41.89 
 
 		 710 aa  533  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  42.9 
 
 		 722 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  41.78 
 
 		 714 aa  534  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  42.17 
 
 		 701 aa  532  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  42.98 
 
 		 708 aa  531  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  41.96 
 
 		 711 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  42.8 
 
 		 712 aa  529  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  43.27 
 
 		 706 aa  531  1e-149  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  42.84 
 
 		 708 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  41.76 
 
 		 704 aa  530  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  42.29 
 
 		 721 aa  529  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  43.33 
 
 		 703 aa  530  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  41.51 
 
 		 715 aa  526  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  43.31 
 
 		 722 aa  528  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  42.18 
 
 		 711 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  41.67 
 
 		 712 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  47.85 
 
 		 721 aa  524  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  46.23 
 
 		 718 aa  520  1e-146  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  39.95 
 
 		 1537 aa  520  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  41.39 
 
 		 712 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  41.7 
 
 		 712 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  41.6 
 
 		 720 aa  521  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  41.27 
 
 		 1464 aa  521  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  42.31 
 
 		 758 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  41.81 
 
 		 709 aa  515  1.0000000000000001e-145  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  43.06 
 
 		 701 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  42.45 
 
 		 758 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  42.76 
 
 		 707 aa  518  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  42.04 
 
 		 751 aa  518  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1973  glycogen debranching enzyme GlgX  42.02 
 
 		 721 aa  515  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0990735  hitchhiker  0.000349089 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  41.32 
 
 		 752 aa  518  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14831  putative isoamylase  42.25 
 
 		 668 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451746  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  42.56 
 
 		 733 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  40.82 
 
 		 730 aa  513  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  40.79 
 
 		 721 aa  515  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1322  glycogen debranching enzyme GlgX  42.42 
 
 		 733 aa  512  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831141  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  42.03 
 
 		 755 aa  514  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  40.36 
 
 		 722 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  41.94 
 
 		 720 aa  514  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  42.31 
 
 		 706 aa  514  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  40.36 
 
 		 720 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  40.36 
 
 		 720 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2983  glycogen debranching enzyme GlgX  42.94 
 
 		 718 aa  515  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602894  normal  0.0199459 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  40.17 
 
 		 727 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1249  glycogen debranching enzyme GlgX  41.68 
 
 		 735 aa  510  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  40.63 
 
 		 727 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  42.1 
 
 		 707 aa  509  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0893  alpha amylase domain-containing protein  40.52 
 
 		 686 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0763625  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  41.33 
 
 		 723 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  42.75 
 
 		 717 aa  511  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  41.1 
 
 		 779 aa  511  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3027  glycogen debranching enzyme GlgX  42.56 
 
 		 733 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  48.28 
 
 		 727 aa  512  1e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1332  glycogen debranching enzyme GlgX  42.56 
 
 		 733 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  41.9 
 
 		 720 aa  508  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  41.72 
 
 		 729 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1350  glycogen debranching protein GlgX  40.6 
 
 		 776 aa  507  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  40.08 
 
 		 717 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17491  putative isoamylase  40.37 
 
 		 686 aa  508  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  46.28 
 
 		 711 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  46.28 
 
 		 711 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  41.31 
 
 		 756 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2795  glycogen debranching enzyme GlgX  40.92 
 
 		 779 aa  505  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0466072  decreased coverage  0.00000490674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>