More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2094 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_14831  putative isoamylase  50.07 
 
 		 668 aa  749    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451746  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0893  alpha amylase domain-containing protein  54.58 
 
 		 686 aa  795    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0763625  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0577  alpha amylase domain-containing protein  82.9 
 
 		 692 aa  1214    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2094  alpha amylase domain-containing protein  100 
 
 		 701 aa  1437    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.159475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15221  putative isoamylase  50.22 
 
 		 677 aa  763    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1420  alpha amylase domain-containing protein  51.67 
 
 		 677 aa  773    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  48.12 
 
 		 694 aa  638    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05691  putative isoamylase  66.14 
 
 		 704 aa  973    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17491  putative isoamylase  54.3 
 
 		 686 aa  801    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15081  putative isoamylase  50.73 
 
 		 677 aa  755    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13761  putative isoamylase  56.9 
 
 		 689 aa  878    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  45.65 
 
 		 706 aa  589  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3784  glycogen debranching enzyme GlgX  46.78 
 
 		 693 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  45.19 
 
 		 708 aa  586  1e-166  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  42.94 
 
 		 705 aa  573  1.0000000000000001e-162  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  44.89 
 
 		 696 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3070  glycogen debranching enzyme GlgX  42.94 
 
 		 686 aa  560  1e-158  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0162429 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  45.4 
 
 		 693 aa  555  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  43.84 
 
 		 694 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  44.13 
 
 		 695 aa  552  1e-156  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  43.84 
 
 		 694 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  41.49 
 
 		 721 aa  519  1e-146  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0893  glycogen debranching enzyme GlgX  40.49 
 
 		 693 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.409319  normal  0.933748 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  40.68 
 
 		 697 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  36.67 
 
 		 774 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  40.18 
 
 		 724 aa  465  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  40.19 
 
 		 708 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  40.57 
 
 		 720 aa  462  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1471  glycogen debranching enzyme GlgX  41.23 
 
 		 683 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  41.15 
 
 		 711 aa  459  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  38.13 
 
 		 729 aa  457  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  41.29 
 
 		 711 aa  459  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  39.75 
 
 		 704 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  36.69 
 
 		 718 aa  455  1.0000000000000001e-126  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  38.76 
 
 		 710 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  40.44 
 
 		 720 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  39.04 
 
 		 706 aa  452  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  40.88 
 
 		 721 aa  453  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  40.73 
 
 		 706 aa  450  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4442  glycogen debranching enzyme GlgX  41.26 
 
 		 723 aa  449  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1973  glycogen debranching enzyme GlgX  40.69 
 
 		 721 aa  449  1e-125  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0990735  hitchhiker  0.000349089 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  41.17 
 
 		 711 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1249  glycogen debranching enzyme GlgX  39.84 
 
 		 735 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  40.34 
 
 		 707 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  39.39 
 
 		 708 aa  448  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  40.63 
 
 		 719 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  40.08 
 
 		 709 aa  447  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  39.6 
 
 		 707 aa  446  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  39.89 
 
 		 733 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  39.53 
 
 		 720 aa  445  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  39.5 
 
 		 715 aa  442  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  39.51 
 
 		 706 aa  443  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  39 
 
 		 751 aa  445  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3027  glycogen debranching enzyme GlgX  39.75 
 
 		 733 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  39.83 
 
 		 726 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  39.44 
 
 		 701 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  39.18 
 
 		 755 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  38.91 
 
 		 756 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  39.05 
 
 		 711 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  39.86 
 
 		 671 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  38.63 
 
 		 721 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  38.99 
 
 		 709 aa  441  9.999999999999999e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  39.05 
 
 		 710 aa  442  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  39.59 
 
 		 730 aa  441  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2983  glycogen debranching enzyme GlgX  39.04 
 
 		 718 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602894  normal  0.0199459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  38.97 
 
 		 722 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1332  glycogen debranching enzyme GlgX  39.75 
 
 		 733 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  39.32 
 
 		 758 aa  438  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  39.04 
 
 		 758 aa  437  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  38.77 
 
 		 712 aa  438  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2700  glycogen debranching enzyme GlgX  40.44 
 
 		 845 aa  436  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  38.68 
 
 		 712 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1322  glycogen debranching enzyme GlgX  39.48 
 
 		 733 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831141  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  41.32 
 
 		 718 aa  434  1e-120  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  38.37 
 
 		 752 aa  434  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  44.16 
 
 		 729 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  39.15 
 
 		 712 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43578  predicted protein  37.66 
 
 		 765 aa  433  1e-120  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0789627  normal  0.106596 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  39.92 
 
 		 722 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  41.65 
 
 		 727 aa  435  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  38.94 
 
 		 1537 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  38.56 
 
 		 714 aa  434  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  39.38 
 
 		 723 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  39.15 
 
 		 713 aa  429  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  40.11 
 
 		 733 aa  429  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  37.45 
 
 		 716 aa  432  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  39.67 
 
 		 706 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  40.39 
 
 		 716 aa  432  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  39.13 
 
 		 715 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  40.45 
 
 		 716 aa  429  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  39.28 
 
 		 719 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  39 
 
 		 720 aa  429  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  37.98 
 
 		 714 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  39.61 
 
 		 712 aa  426  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  37.98 
 
 		 714 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  37.93 
 
 		 723 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  37.98 
 
 		 714 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2795  glycogen debranching enzyme GlgX  39.17 
 
 		 779 aa  425  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0466072  decreased coverage  0.00000490674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  40.2 
 
 		 755 aa  423  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  38.43 
 
 		 722 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>