More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_15221 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_14831  putative isoamylase  78.74 
 
 		 668 aa  1113    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451746  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15221  putative isoamylase  100 
 
 		 677 aa  1390    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17491  putative isoamylase  54.68 
 
 		 686 aa  742    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05691  putative isoamylase  50.94 
 
 		 704 aa  764    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0893  alpha amylase domain-containing protein  54.82 
 
 		 686 aa  743    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0763625  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0577  alpha amylase domain-containing protein  50.15 
 
 		 692 aa  765    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2094  alpha amylase domain-containing protein  50.22 
 
 		 701 aa  749    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.159475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1420  alpha amylase domain-containing protein  90.84 
 
 		 677 aa  1264    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13761  putative isoamylase  53.88 
 
 		 689 aa  784    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15081  putative isoamylase  92.02 
 
 		 677 aa  1295    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  40.35 
 
 		 694 aa  560  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  42.53 
 
 		 706 aa  533  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  42.62 
 
 		 708 aa  531  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3070  glycogen debranching enzyme GlgX  42.35 
 
 		 686 aa  530  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0162429 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3784  glycogen debranching enzyme GlgX  40.64 
 
 		 693 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  39.94 
 
 		 696 aa  519  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  40.53 
 
 		 694 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  40.67 
 
 		 693 aa  504  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  40.53 
 
 		 694 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  39.54 
 
 		 695 aa  496  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  40.9 
 
 		 705 aa  498  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  36.41 
 
 		 774 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  37.48 
 
 		 721 aa  468  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0893  glycogen debranching enzyme GlgX  38.64 
 
 		 693 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.409319  normal  0.933748 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4442  glycogen debranching enzyme GlgX  36.55 
 
 		 723 aa  451  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  38.8 
 
 		 697 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  36.9 
 
 		 718 aa  445  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  37.29 
 
 		 706 aa  443  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  35.81 
 
 		 724 aa  433  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  36.35 
 
 		 722 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  34.32 
 
 		 720 aa  421  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  34.7 
 
 		 671 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  35.85 
 
 		 715 aa  419  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  34.82 
 
 		 720 aa  418  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  36.62 
 
 		 710 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  34.27 
 
 		 704 aa  416  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  33.85 
 
 		 709 aa  414  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  34.75 
 
 		 707 aa  414  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  36.81 
 
 		 729 aa  416  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1782  glycogen debranching enzyme GlgX  35.24 
 
 		 688 aa  416  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  34.45 
 
 		 713 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  33.19 
 
 		 711 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  34.99 
 
 		 701 aa  410  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  33.95 
 
 		 730 aa  411  1e-113  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2449  putative glycosyl hydrolase  34.86 
 
 		 688 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  35.26 
 
 		 726 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  35.48 
 
 		 708 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  34.99 
 
 		 706 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1112  glycogen debranching enzyme GlgX  34.96 
 
 		 688 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758297  normal  0.439261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  35.55 
 
 		 714 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2859  glycogen debranching enzyme GlgX  35.93 
 
 		 690 aa  404  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  35.92 
 
 		 718 aa  404  1e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  34.75 
 
 		 706 aa  404  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  33.62 
 
 		 714 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  33.62 
 
 		 714 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  35.83 
 
 		 751 aa  404  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  33.62 
 
 		 714 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43578  predicted protein  33.24 
 
 		 765 aa  401  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0789627  normal  0.106596 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13830  glycogen debranching enzyme GlgX  34.58 
 
 		 720 aa  402  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844349  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  34.89 
 
 		 718 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  34.22 
 
 		 709 aa  401  9.999999999999999e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  35.22 
 
 		 715 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  34.09 
 
 		 752 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  37.93 
 
 		 712 aa  400  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  36.03 
 
 		 707 aa  401  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1973  glycogen debranching enzyme GlgX  34.64 
 
 		 721 aa  399  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0990735  hitchhiker  0.000349089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  34.31 
 
 		 723 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  34.74 
 
 		 708 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  34.55 
 
 		 758 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  33.98 
 
 		 729 aa  398  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  32.11 
 
 		 712 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  35.64 
 
 		 721 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  35.74 
 
 		 701 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  34.6 
 
 		 755 aa  397  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  34.69 
 
 		 758 aa  399  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4097  glycogen debranching enzyme GlgX  35.83 
 
 		 709 aa  398  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2700  glycogen debranching enzyme GlgX  36.19 
 
 		 845 aa  395  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  36.5 
 
 		 710 aa  393  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  35.15 
 
 		 706 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  31.83 
 
 		 712 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  34.09 
 
 		 721 aa  394  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  35.19 
 
 		 710 aa  394  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  33.56 
 
 		 720 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  35.74 
 
 		 1537 aa  393  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  33.81 
 
 		 691 aa  395  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  35.57 
 
 		 733 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1249  glycogen debranching enzyme GlgX  39.02 
 
 		 735 aa  393  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  33.62 
 
 		 712 aa  393  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  31.83 
 
 		 712 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_19757  predicted protein  34.57 
 
 		 715 aa  389  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.13703  normal  0.0212411 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  37.44 
 
 		 716 aa  392  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  34.78 
 
 		 727 aa  391  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  38.95 
 
 		 722 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2164  glycogen debranching enzyme GlgX  33.85 
 
 		 708 aa  392  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  34.48 
 
 		 733 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  34.36 
 
 		 1464 aa  392  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  33.61 
 
 		 711 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3027  glycogen debranching enzyme GlgX  34.48 
 
 		 733 aa  389  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1189  glycogen debranching protein GlgX  34.53 
 
 		 688 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.50354  normal  0.29921 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  33.99 
 
 		 722 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>