More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2517 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  50 
 
 		 693 aa  666    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  46.84 
 
 		 694 aa  653    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  100 
 
 		 774 aa  1613    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  52.22 
 
 		 721 aa  813    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  46.84 
 
 		 694 aa  653    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  50.76 
 
 		 706 aa  672    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3784  glycogen debranching enzyme GlgX  45.51 
 
 		 693 aa  646    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  49.7 
 
 		 705 aa  663    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  49.28 
 
 		 697 aa  728    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  49.39 
 
 		 696 aa  635    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  50.61 
 
 		 708 aa  665    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0893  glycogen debranching enzyme GlgX  53.08 
 
 		 693 aa  811    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.409319  normal  0.933748 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  49.77 
 
 		 695 aa  632  1e-180  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  44.01 
 
 		 694 aa  626  1e-178  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  44.77 
 
 		 671 aa  622  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  43.75 
 
 		 729 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3070  glycogen debranching enzyme GlgX  42.69 
 
 		 686 aa  600  1e-170  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0162429 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  45.72 
 
 		 718 aa  569  1e-161  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4442  glycogen debranching enzyme GlgX  41.21 
 
 		 723 aa  571  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405829  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  46.19 
 
 		 724 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  41.47 
 
 		 706 aa  565  1.0000000000000001e-159  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  40.43 
 
 		 714 aa  533  1e-150  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  39.42 
 
 		 708 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0827  glycogen debranching enzyme GlgX  44.92 
 
 		 705 aa  518  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125239  normal  0.0549007 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1247  glycoside hydrolase family 13 protein  44.61 
 
 		 703 aa  514  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  40.15 
 
 		 715 aa  506  9.999999999999999e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2859  glycogen debranching enzyme GlgX  40.86 
 
 		 690 aa  508  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1471  glycogen debranching enzyme GlgX  39.92 
 
 		 683 aa  507  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  38.6 
 
 		 706 aa  503  1e-141  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  39.69 
 
 		 722 aa  503  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  39.42 
 
 		 709 aa  505  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  39.29 
 
 		 710 aa  505  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  39.84 
 
 		 707 aa  503  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  40.92 
 
 		 718 aa  499  1e-140  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  40.2 
 
 		 726 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  38.59 
 
 		 756 aa  497  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  43.79 
 
 		 710 aa  498  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  41.52 
 
 		 720 aa  496  1e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  42.46 
 
 		 715 aa  497  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  40.31 
 
 		 723 aa  496  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  39.26 
 
 		 707 aa  495  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  39.13 
 
 		 718 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  38.6 
 
 		 721 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  38.3 
 
 		 711 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  41.07 
 
 		 720 aa  491  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  41.54 
 
 		 704 aa  489  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  41.97 
 
 		 712 aa  489  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  42.31 
 
 		 714 aa  491  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  41.56 
 
 		 708 aa  486  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  37.95 
 
 		 716 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  38.04 
 
 		 717 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  42 
 
 		 701 aa  484  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  41.97 
 
 		 730 aa  482  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  42.33 
 
 		 706 aa  482  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  40.37 
 
 		 721 aa  485  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  39.39 
 
 		 711 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  39.39 
 
 		 711 aa  485  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  40.5 
 
 		 709 aa  483  1e-135  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  41.91 
 
 		 755 aa  484  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  38.04 
 
 		 717 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  38.04 
 
 		 717 aa  486  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  38.17 
 
 		 717 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  37.44 
 
 		 716 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  41.81 
 
 		 758 aa  481  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  41.22 
 
 		 706 aa  481  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  37.63 
 
 		 729 aa  481  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  40.9 
 
 		 751 aa  481  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  41.81 
 
 		 758 aa  481  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  42.79 
 
 		 701 aa  477  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  43.95 
 
 		 722 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  41.27 
 
 		 720 aa  476  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1601  glycogen debranching protein GlgX  38.72 
 
 		 701 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  43.95 
 
 		 720 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  38.93 
 
 		 712 aa  478  1e-133  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  41.67 
 
 		 721 aa  477  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  43.95 
 
 		 720 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  39.66 
 
 		 714 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  40.09 
 
 		 712 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5114  glycogen debranching enzyme GlgX  42.79 
 
 		 708 aa  476  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.84007  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  37.6 
 
 		 719 aa  475  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  37.72 
 
 		 723 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  39.66 
 
 		 714 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  41.29 
 
 		 779 aa  476  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  39.8 
 
 		 1464 aa  472  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  38.93 
 
 		 700 aa  474  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  37.15 
 
 		 711 aa  475  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  39.66 
 
 		 714 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  42.19 
 
 		 720 aa  474  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  40.09 
 
 		 712 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0577  alpha amylase domain-containing protein  37.17 
 
 		 692 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13830  glycogen debranching enzyme GlgX  38.79 
 
 		 720 aa  472  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844349  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1420  alpha amylase domain-containing protein  36.51 
 
 		 677 aa  472  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  41.25 
 
 		 713 aa  471  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  42.52 
 
 		 752 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15221  putative isoamylase  36.41 
 
 		 677 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  40.63 
 
 		 727 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  39.85 
 
 		 712 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  40.43 
 
 		 727 aa  468  9.999999999999999e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  37.45 
 
 		 727 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  37.98 
 
 		 738 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>