More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1420 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_17491  putative isoamylase  54.39 
 
 		 686 aa  735    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14831  putative isoamylase  79.19 
 
 		 668 aa  1116    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451746  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05691  putative isoamylase  51.68 
 
 		 704 aa  770    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13761  putative isoamylase  54.9 
 
 		 689 aa  799    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15221  putative isoamylase  90.84 
 
 		 677 aa  1282    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0893  alpha amylase domain-containing protein  55.12 
 
 		 686 aa  740    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0763625  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0577  alpha amylase domain-containing protein  51.31 
 
 		 692 aa  770    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2094  alpha amylase domain-containing protein  51.81 
 
 		 701 aa  761    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.159475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1420  alpha amylase domain-containing protein  100 
 
 		 677 aa  1389    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15081  putative isoamylase  91.14 
 
 		 677 aa  1285    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  41.35 
 
 		 694 aa  567  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3070  glycogen debranching enzyme GlgX  42.86 
 
 		 686 aa  536  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0162429 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  41.55 
 
 		 708 aa  529  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  42.81 
 
 		 706 aa  531  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3784  glycogen debranching enzyme GlgX  41.01 
 
 		 693 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  40.34 
 
 		 696 aa  514  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  41.03 
 
 		 694 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  41.03 
 
 		 694 aa  508  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  40.74 
 
 		 695 aa  504  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  40.61 
 
 		 705 aa  502  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  39.22 
 
 		 693 aa  501  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  38.78 
 
 		 721 aa  480  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  36.59 
 
 		 774 aa  473  1e-132  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0893  glycogen debranching enzyme GlgX  38.78 
 
 		 693 aa  459  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.409319  normal  0.933748 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  38.14 
 
 		 697 aa  451  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  36.44 
 
 		 718 aa  442  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  36.95 
 
 		 724 aa  437  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4442  glycogen debranching enzyme GlgX  36.21 
 
 		 723 aa  437  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  37.55 
 
 		 710 aa  426  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  35.62 
 
 		 671 aa  429  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  36.3 
 
 		 706 aa  427  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  35.65 
 
 		 720 aa  423  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  36.45 
 
 		 726 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  34.83 
 
 		 720 aa  419  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1782  glycogen debranching enzyme GlgX  35.67 
 
 		 688 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  34.37 
 
 		 730 aa  416  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  36.19 
 
 		 718 aa  412  1e-114  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  35.76 
 
 		 708 aa  412  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  34.94 
 
 		 707 aa  413  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  34.75 
 
 		 711 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  33.57 
 
 		 709 aa  411  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  35.21 
 
 		 701 aa  410  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  34.93 
 
 		 704 aa  411  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  36.27 
 
 		 715 aa  409  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  36.67 
 
 		 722 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  36.66 
 
 		 729 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  34.83 
 
 		 709 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  35.48 
 
 		 729 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  36.26 
 
 		 708 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  35.93 
 
 		 706 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1973  glycogen debranching enzyme GlgX  35.06 
 
 		 721 aa  405  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0990735  hitchhiker  0.000349089 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2449  putative glycosyl hydrolase  34.77 
 
 		 688 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  34.4 
 
 		 713 aa  405  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1112  glycogen debranching enzyme GlgX  34.91 
 
 		 688 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758297  normal  0.439261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  34.97 
 
 		 723 aa  405  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  35.16 
 
 		 706 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  33.05 
 
 		 712 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  33.33 
 
 		 712 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  33.15 
 
 		 712 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  34.84 
 
 		 718 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  34.83 
 
 		 758 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  34.61 
 
 		 752 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  34.66 
 
 		 714 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  35.79 
 
 		 751 aa  401  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2700  glycogen debranching enzyme GlgX  36.35 
 
 		 845 aa  399  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  34.66 
 
 		 714 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  34.66 
 
 		 714 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  34.7 
 
 		 714 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  35.31 
 
 		 721 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4097  glycogen debranching enzyme GlgX  36.48 
 
 		 709 aa  398  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  34.54 
 
 		 733 aa  399  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43578  predicted protein  33.15 
 
 		 765 aa  396  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0789627  normal  0.106596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  34.6 
 
 		 755 aa  399  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  34.69 
 
 		 758 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  36.08 
 
 		 707 aa  399  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  33.43 
 
 		 720 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0238  glycogen operon protein GlgX  33.57 
 
 		 754 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137822  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  34.28 
 
 		 715 aa  394  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  36.36 
 
 		 710 aa  394  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_19757  predicted protein  35.14 
 
 		 715 aa  393  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.13703  normal  0.0212411 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1249  glycogen debranching enzyme GlgX  39.16 
 
 		 735 aa  392  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  35.18 
 
 		 719 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  34.39 
 
 		 738 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  33.98 
 
 		 723 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  34.39 
 
 		 691 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  34.22 
 
 		 716 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  34.3 
 
 		 716 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3936  glycogen debranching enzyme GlgX  35.17 
 
 		 766 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659462  normal  0.365741 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  35.34 
 
 		 710 aa  393  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  39.1 
 
 		 712 aa  392  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4049  glycogen debranching enzyme GlgX  35.17 
 
 		 766 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.928409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2859  glycogen debranching enzyme GlgX  34.25 
 
 		 690 aa  392  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  33.33 
 
 		 704 aa  389  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  33.43 
 
 		 720 aa  392  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1322  glycogen debranching enzyme GlgX  35.17 
 
 		 733 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831141  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3027  glycogen debranching enzyme GlgX  35.03 
 
 		 733 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  35.03 
 
 		 733 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  34.44 
 
 		 711 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  34.55 
 
 		 1464 aa  392  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  34.14 
 
 		 712 aa  392  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>