More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2820 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1070  glycogen debranching enzyme GlgX  47.97 
 
 		 802 aa  693    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  62.35 
 
 		 1537 aa  946    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  49.1 
 
 		 718 aa  724    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1530  glycogen debranching enzyme GlgX  51.23 
 
 		 704 aa  641    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376415  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  50.42 
 
 		 717 aa  722    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  53.92 
 
 		 711 aa  764    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  63.7 
 
 		 713 aa  909    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0238  glycogen operon protein GlgX  50.42 
 
 		 754 aa  660    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137822  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  51.49 
 
 		 758 aa  716    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1495  glycogen operon protein  47.64 
 
 		 750 aa  644    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  51.27 
 
 		 727 aa  718    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1332  glycogen debranching enzyme GlgX  47.78 
 
 		 733 aa  650    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  61.12 
 
 		 720 aa  909    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6085  glycogen debranching enzyme GlgX  49.56 
 
 		 705 aa  649    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0291933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6824  glycogen debranching enzyme GlgX  47.81 
 
 		 739 aa  665    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  50.99 
 
 		 727 aa  722    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  77.13 
 
 		 707 aa  1145    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  64.04 
 
 		 714 aa  937    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4230  glycogen debranching protein GlgX  48.66 
 
 		 743 aa  642    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535158  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2267  glycogen debranching enzyme GlgX  51.84 
 
 		 691 aa  662    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138313  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1206  glycogen debranching enzyme GlgX  50.43 
 
 		 692 aa  692    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  51.91 
 
 		 723 aa  728    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  60.89 
 
 		 706 aa  884    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  50.42 
 
 		 719 aa  718    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2226  glycosidase  52.06 
 
 		 694 aa  669    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2449  putative glycosyl hydrolase  51.83 
 
 		 688 aa  694    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2884  glycogen debranching enzyme  51.09 
 
 		 704 aa  640    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.499516  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7031  glycogen debranching protein GlgX  50.36 
 
 		 708 aa  662    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2010  glycogen debranching enzyme GlgX  55.73 
 
 		 788 aa  746    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1249  glycogen debranching enzyme GlgX  47.86 
 
 		 735 aa  649    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1136  glycogen debranching enzyme GlgX  50.36 
 
 		 704 aa  664    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  52.76 
 
 		 757 aa  717    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3936  glycogen debranching enzyme GlgX  49.01 
 
 		 766 aa  660    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659462  normal  0.365741 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3835  glycogen debranching enzyme GlgX  54.63 
 
 		 673 aa  701    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.124257  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  60.45 
 
 		 701 aa  890    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0505  glycogen debranching protein GlgX  55.91 
 
 		 714 aa  786    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299874  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  54.09 
 
 		 729 aa  759    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5488  glycogen debranching enzyme GlgX  50.8 
 
 		 708 aa  676    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.168137  decreased coverage  0.0000616357 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  52.68 
 
 		 716 aa  726    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  53.85 
 
 		 712 aa  761    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1350  glycogen debranching protein GlgX  61.23 
 
 		 776 aa  938    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3665  glycogen debranching protein GlgX  46.73 
 
 		 830 aa  672    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1881  glycogen debranching protein GlgX  49.86 
 
 		 691 aa  662    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  51.13 
 
 		 733 aa  718    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  51.69 
 
 		 738 aa  717    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3116  glycogen debranching protein GlgX  50.65 
 
 		 698 aa  675    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  47.64 
 
 		 733 aa  649    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  52.82 
 
 		 719 aa  735    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  48.47 
 
 		 716 aa  681    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  51.69 
 
 		 719 aa  732    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  52.48 
 
 		 701 aa  733    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3681  glycogen debranching protein GlgX  50.44 
 
 		 692 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1189  glycogen debranching protein GlgX  47.91 
 
 		 688 aa  658    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.50354  normal  0.29921 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  52.12 
 
 		 738 aa  726    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2864  putative glycogen operon protein GlgX  47.18 
 
 		 739 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3213  glycogen debranching protein GlgX  51.63 
 
 		 728 aa  709    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3485  glycogen debranching protein GlgX  50.43 
 
 		 692 aa  661    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1463  glycogen debranching protein GlgX  50.42 
 
 		 692 aa  685    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4409  glycogen debranching enzyme GlgX  50 
 
 		 695 aa  652    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.374964 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  55.18 
 
 		 727 aa  773    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1333  glycogen debranching protein GlgX  49.56 
 
 		 705 aa  652    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0242466  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  61.12 
 
 		 722 aa  910    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  63.9 
 
 		 714 aa  936    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  61.35 
 
 		 715 aa  827    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  53.86 
 
 		 711 aa  775    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  52.25 
 
 		 691 aa  707    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  51.34 
 
 		 755 aa  704    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  64.25 
 
 		 718 aa  967    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1112  glycogen debranching enzyme GlgX  51.69 
 
 		 688 aa  692    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758297  normal  0.439261 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2983  glycogen debranching enzyme GlgX  48.34 
 
 		 718 aa  645    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602894  normal  0.0199459 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0902  glycogen debranching enzyme GlgX  51.61 
 
 		 694 aa  668    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  50.91 
 
 		 704 aa  724    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  61.66 
 
 		 721 aa  907    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  57.48 
 
 		 707 aa  847    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6323  glycogen debranching enzyme GlgX  49.85 
 
 		 704 aa  639    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431119  normal  0.149748 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2757  glycogen debranching enzyme GlgX  47.29 
 
 		 752 aa  639    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2835  glycogen debranching enzyme GlgX  47.17 
 
 		 752 aa  637    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  50.85 
 
 		 756 aa  709    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  100 
 
 		 720 aa  1484    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  53.58 
 
 		 716 aa  725    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6324  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  49.65 
 
 		 691 aa  681    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.24347  normal  0.874434 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  63.19 
 
 		 751 aa  946    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6496  glycogen debranching enzyme GlgX  49.56 
 
 		 705 aa  652    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0828061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  61.34 
 
 		 715 aa  917    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  49.31 
 
 		 745 aa  707    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  56.67 
 
 		 1464 aa  771    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2933  glycogen debranching enzyme GlgX  47.15 
 
 		 752 aa  635    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  60.64 
 
 		 700 aa  843    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  67.93 
 
 		 712 aa  1013    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1782  glycogen debranching enzyme GlgX  51.84 
 
 		 688 aa  694    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4425  glycogen debranching enzyme GlgX  50.72 
 
 		 697 aa  658    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0269  glycogen debranching enzyme GlgX  62.88 
 
 		 733 aa  931    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.537346  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1812  glycogen debranching enzyme GlgX  51.6 
 
 		 718 aa  730    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1322  glycogen debranching enzyme GlgX  47.78 
 
 		 733 aa  654    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831141  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  61.12 
 
 		 720 aa  909    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  63.9 
 
 		 714 aa  936    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  50.28 
 
 		 717 aa  721    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  50.85 
 
 		 717 aa  727    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  50.71 
 
 		 717 aa  722    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  61.34 
 
 		 714 aa  918    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>