More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0893 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_15081  putative isoamylase  55.26 
 
 		 677 aa  761    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17491  putative isoamylase  97.81 
 
 		 686 aa  1361    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05691  putative isoamylase  56.36 
 
 		 704 aa  848    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0893  alpha amylase domain-containing protein  100 
 
 		 686 aa  1413    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0763625  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0577  alpha amylase domain-containing protein  55.41 
 
 		 692 aa  822    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2094  alpha amylase domain-containing protein  54.58 
 
 		 701 aa  797    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.159475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14831  putative isoamylase  54.46 
 
 		 668 aa  747    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451746  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1420  alpha amylase domain-containing protein  55.12 
 
 		 677 aa  759    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15221  putative isoamylase  54.82 
 
 		 677 aa  763    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13761  putative isoamylase  63.53 
 
 		 689 aa  940    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  44.38 
 
 		 694 aa  596  1e-169  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  42.17 
 
 		 706 aa  560  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  42.55 
 
 		 708 aa  550  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  40.9 
 
 		 696 aa  550  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  42.23 
 
 		 693 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  42.29 
 
 		 695 aa  537  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3070  glycogen debranching enzyme GlgX  41.19 
 
 		 686 aa  535  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0162429 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  40.52 
 
 		 705 aa  526  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  42.88 
 
 		 694 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3784  glycogen debranching enzyme GlgX  40.78 
 
 		 693 aa  523  1e-147  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  42.88 
 
 		 694 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  40.51 
 
 		 721 aa  486  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  38.77 
 
 		 724 aa  478  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  39.63 
 
 		 697 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0893  glycogen debranching enzyme GlgX  39.11 
 
 		 693 aa  468  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.409319  normal  0.933748 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  38.21 
 
 		 704 aa  452  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4442  glycogen debranching enzyme GlgX  37.04 
 
 		 723 aa  452  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  35.6 
 
 		 774 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  43.67 
 
 		 720 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  37.6 
 
 		 718 aa  446  1.0000000000000001e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  38.48 
 
 		 701 aa  444  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  37.22 
 
 		 709 aa  443  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  39 
 
 		 706 aa  442  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  36.71 
 
 		 711 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  37.33 
 
 		 720 aa  444  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  37.1 
 
 		 718 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  38.41 
 
 		 671 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  38.17 
 
 		 706 aa  439  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  37.96 
 
 		 714 aa  436  1e-121  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  37.15 
 
 		 755 aa  436  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  36.92 
 
 		 714 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  37.85 
 
 		 706 aa  436  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  37.22 
 
 		 716 aa  437  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  36.78 
 
 		 714 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  38.22 
 
 		 703 aa  437  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  37.75 
 
 		 722 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  38.04 
 
 		 708 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  36.78 
 
 		 714 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  37.24 
 
 		 756 aa  435  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  38.37 
 
 		 1537 aa  434  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  36.24 
 
 		 730 aa  434  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1322  glycogen debranching enzyme GlgX  38.99 
 
 		 733 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831141  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  37.21 
 
 		 733 aa  435  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  38.84 
 
 		 733 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  37.96 
 
 		 710 aa  433  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1249  glycogen debranching enzyme GlgX  37.91 
 
 		 735 aa  434  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  37.15 
 
 		 758 aa  430  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  38.23 
 
 		 729 aa  429  1e-119  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  38.46 
 
 		 711 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1332  glycogen debranching enzyme GlgX  38.84 
 
 		 733 aa  432  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3027  glycogen debranching enzyme GlgX  38.84 
 
 		 733 aa  432  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  38.32 
 
 		 711 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  36.87 
 
 		 779 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  37.73 
 
 		 709 aa  431  1e-119  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  38.77 
 
 		 715 aa  432  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  41.28 
 
 		 712 aa  430  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  37.32 
 
 		 751 aa  430  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  37.29 
 
 		 758 aa  431  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  37.46 
 
 		 721 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  42.52 
 
 		 718 aa  428  1e-118  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  35.73 
 
 		 713 aa  428  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  36.75 
 
 		 721 aa  428  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  38.8 
 
 		 722 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0269  glycogen debranching enzyme GlgX  36.88 
 
 		 733 aa  427  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.537346  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1692  glycogen debranching enzyme GlgX  38.17 
 
 		 697 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  36.9 
 
 		 723 aa  426  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1136  glycogen debranching enzyme GlgX  37.11 
 
 		 704 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  36.2 
 
 		 707 aa  424  1e-117  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  40.45 
 
 		 729 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1973  glycogen debranching enzyme GlgX  36.97 
 
 		 721 aa  426  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0990735  hitchhiker  0.000349089 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  36.62 
 
 		 715 aa  423  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2859  glycogen debranching enzyme GlgX  37.52 
 
 		 690 aa  425  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2795  glycogen debranching enzyme GlgX  37.87 
 
 		 779 aa  423  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0466072  decreased coverage  0.00000490674 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  35.88 
 
 		 720 aa  422  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  37.8 
 
 		 701 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3835  glycogen debranching enzyme GlgX  37.74 
 
 		 673 aa  421  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.124257  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  36.17 
 
 		 752 aa  420  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  37.89 
 
 		 710 aa  420  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  42.47 
 
 		 727 aa  420  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2983  glycogen debranching enzyme GlgX  35.89 
 
 		 718 aa  420  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602894  normal  0.0199459 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2757  glycogen debranching enzyme GlgX  37.6 
 
 		 752 aa  422  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2835  glycogen debranching enzyme GlgX  37.88 
 
 		 752 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  38.09 
 
 		 710 aa  420  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2700  glycogen debranching enzyme GlgX  38.77 
 
 		 845 aa  420  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  37.08 
 
 		 712 aa  419  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  36.59 
 
 		 714 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7031  glycogen debranching protein GlgX  36.24 
 
 		 708 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13830  glycogen debranching enzyme GlgX  35.97 
 
 		 720 aa  419  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844349  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  36.77 
 
 		 726 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  37.7 
 
 		 723 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>