More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_16760 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  48.02 
 
 
717 aa  640    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  53.99 
 
 
712 aa  704    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  46.92 
 
 
718 aa  651    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  50.97 
 
 
727 aa  661    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  48.02 
 
 
717 aa  641    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  52.35 
 
 
720 aa  646    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  58.31 
 
 
713 aa  807    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  54.82 
 
 
710 aa  773    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4097  glycogen debranching enzyme GlgX  56.31 
 
 
709 aa  733    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3037  glycogen debranching enzyme GlgX  46.41 
 
 
730 aa  665    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  50.14 
 
 
712 aa  656    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  59.8 
 
 
714 aa  823    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  50.35 
 
 
723 aa  668    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1973  glycogen debranching enzyme GlgX  59.89 
 
 
721 aa  815    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0990735  hitchhiker  0.000349089 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  57.79 
 
 
703 aa  749    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  56.9 
 
 
707 aa  783    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  54.79 
 
 
711 aa  721    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  56.71 
 
 
706 aa  787    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  48.02 
 
 
717 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  50.77 
 
 
708 aa  686    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  49.37 
 
 
755 aa  643    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  56.11 
 
 
706 aa  774    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  56.26 
 
 
720 aa  776    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  55.79 
 
 
720 aa  742    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  58.19 
 
 
720 aa  821    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  54.23 
 
 
717 aa  677    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  50.44 
 
 
710 aa  650    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  60.31 
 
 
718 aa  865    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  52.77 
 
 
722 aa  726    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  56.88 
 
 
715 aa  818    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  50.77 
 
 
779 aa  648    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  50.28 
 
 
755 aa  640    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  49.23 
 
 
758 aa  637    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  55.6 
 
 
701 aa  760    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0505  glycogen debranching protein GlgX  50.85 
 
 
714 aa  654    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299874  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  51.81 
 
 
729 aa  673    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  50.63 
 
 
701 aa  647    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  51.89 
 
 
711 aa  716    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  54.55 
 
 
712 aa  709    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1350  glycogen debranching protein GlgX  54.72 
 
 
776 aa  791    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5114  glycogen debranching enzyme GlgX  59.01 
 
 
708 aa  785    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.84007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  53.02 
 
 
726 aa  756    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  49.3 
 
 
733 aa  635    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  56.96 
 
 
720 aa  817    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  59.15 
 
 
701 aa  806    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2010  glycogen debranching enzyme GlgX  51.83 
 
 
788 aa  657    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  50.35 
 
 
719 aa  668    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  62.84 
 
 
730 aa  865    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  50.44 
 
 
719 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  49.01 
 
 
701 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  56.28 
 
 
709 aa  789    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  51.75 
 
 
711 aa  714    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  49.58 
 
 
738 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3083  glycogen debranching enzyme GlgX  46.96 
 
 
730 aa  666    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2795  glycogen debranching enzyme GlgX  59.77 
 
 
779 aa  822    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0466072  decreased coverage  0.00000490674 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  52.94 
 
 
710 aa  699    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  57.75 
 
 
721 aa  811    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  54.48 
 
 
727 aa  729    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  49.16 
 
 
756 aa  644    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  56.96 
 
 
722 aa  816    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  59.8 
 
 
714 aa  824    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  56.03 
 
 
715 aa  752    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  49.58 
 
 
738 aa  645    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  50 
 
 
691 aa  640    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  55.62 
 
 
711 aa  723    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  55.73 
 
 
708 aa  782    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  62.27 
 
 
704 aa  850    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  56.84 
 
 
706 aa  759    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2700  glycogen debranching enzyme GlgX  53.85 
 
 
845 aa  691    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  50.51 
 
 
716 aa  642    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  54.96 
 
 
707 aa  775    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3835  glycogen debranching enzyme GlgX  55.62 
 
 
673 aa  695    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.124257  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  52.59 
 
 
721 aa  712    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  61.09 
 
 
752 aa  857    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  54.41 
 
 
712 aa  709    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  49.23 
 
 
758 aa  638    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  49.37 
 
 
716 aa  645    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  48.1 
 
 
745 aa  643    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  60.23 
 
 
751 aa  849    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  48.51 
 
 
717 aa  640    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1601  glycogen debranching protein GlgX  58.81 
 
 
701 aa  798    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  50.85 
 
 
704 aa  660    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  49.93 
 
 
1464 aa  654    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  100 
 
 
709 aa  1453    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  55.97 
 
 
700 aa  751    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  58.38 
 
 
712 aa  815    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  51.06 
 
 
722 aa  681    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13830  glycogen debranching enzyme GlgX  57.02 
 
 
720 aa  795    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844349  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0269  glycogen debranching enzyme GlgX  57.42 
 
 
733 aa  794    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.537346  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1812  glycogen debranching enzyme GlgX  52.59 
 
 
718 aa  671    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  56.31 
 
 
1537 aa  796    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  56.96 
 
 
720 aa  817    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  59.8 
 
 
714 aa  824    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  50.64 
 
 
720 aa  651    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  50.35 
 
 
757 aa  643    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2978  glycogen debranching enzyme GlgX  60.34 
 
 
850 aa  701    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  57.02 
 
 
714 aa  828    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  60.74 
 
 
723 aa  869    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2983  glycogen debranching enzyme GlgX  51.79 
 
 
718 aa  642    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602894  normal  0.0199459 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  57.18 
 
 
721 aa  775    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>