More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_14831 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_15221  putative isoamylase  78.74 
 
 
677 aa  1113    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05691  putative isoamylase  50.37 
 
 
704 aa  751    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17491  putative isoamylase  53.87 
 
 
686 aa  724    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0893  alpha amylase domain-containing protein  54.46 
 
 
686 aa  729    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0763625  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0577  alpha amylase domain-containing protein  50.37 
 
 
692 aa  756    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2094  alpha amylase domain-containing protein  50.07 
 
 
701 aa  732    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.159475  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14831  putative isoamylase  100 
 
 
668 aa  1370    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451746  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1420  alpha amylase domain-containing protein  79.19 
 
 
677 aa  1108    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13761  putative isoamylase  54.65 
 
 
689 aa  779    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15081  putative isoamylase  78.33 
 
 
677 aa  1107    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  40.65 
 
 
694 aa  552  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3070  glycogen debranching enzyme GlgX  44.48 
 
 
686 aa  544  1e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0162429 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3784  glycogen debranching enzyme GlgX  42.94 
 
 
693 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  42.57 
 
 
706 aa  529  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  42.46 
 
 
708 aa  525  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  42.04 
 
 
694 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  42.04 
 
 
694 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  42.25 
 
 
705 aa  513  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  40.68 
 
 
696 aa  514  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  40.71 
 
 
695 aa  510  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  40.09 
 
 
693 aa  498  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  36.56 
 
 
774 aa  464  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  37.35 
 
 
721 aa  454  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0893  glycogen debranching enzyme GlgX  38.82 
 
 
693 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.409319  normal  0.933748 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  39.2 
 
 
697 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  36.45 
 
 
718 aa  441  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4442  glycogen debranching enzyme GlgX  36.65 
 
 
723 aa  429  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405829  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  34.16 
 
 
724 aa  428  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  37.16 
 
 
729 aa  422  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  38.64 
 
 
710 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  35.85 
 
 
718 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  36.1 
 
 
701 aa  414  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  35.94 
 
 
720 aa  415  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  36.21 
 
 
722 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  35.67 
 
 
715 aa  414  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  35.04 
 
 
720 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  35.67 
 
 
723 aa  415  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  36.94 
 
 
726 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  35.57 
 
 
729 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  35.65 
 
 
704 aa  410  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  35.7 
 
 
706 aa  412  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  37.36 
 
 
708 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  34.92 
 
 
713 aa  406  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  35.71 
 
 
730 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  35.02 
 
 
671 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  35 
 
 
714 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  35 
 
 
714 aa  405  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  36.19 
 
 
706 aa  402  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  35 
 
 
714 aa  405  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  38.27 
 
 
718 aa  402  9.999999999999999e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  35.39 
 
 
721 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43578  predicted protein  33.28 
 
 
765 aa  402  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0789627  normal  0.106596 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  35.72 
 
 
707 aa  401  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  35.6 
 
 
1464 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2859  glycogen debranching enzyme GlgX  38.01 
 
 
690 aa  398  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1782  glycogen debranching enzyme GlgX  35.84 
 
 
688 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  34.89 
 
 
709 aa  397  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2700  glycogen debranching enzyme GlgX  40.77 
 
 
845 aa  399  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  35.85 
 
 
751 aa  399  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  34.92 
 
 
711 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1249  glycogen debranching enzyme GlgX  39.83 
 
 
735 aa  395  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1136  glycogen debranching enzyme GlgX  35.82 
 
 
704 aa  392  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55158  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  34.76 
 
 
707 aa  395  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  35.31 
 
 
706 aa  395  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2449  putative glycosyl hydrolase  35.5 
 
 
688 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  34.78 
 
 
711 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1112  glycogen debranching enzyme GlgX  35.5 
 
 
688 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758297  normal  0.439261 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1973  glycogen debranching enzyme GlgX  34.56 
 
 
721 aa  393  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0990735  hitchhiker  0.000349089 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  37.7 
 
 
710 aa  394  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  35.8 
 
 
708 aa  393  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  34.33 
 
 
715 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  37.32 
 
 
712 aa  391  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  33.52 
 
 
711 aa  392  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  36.16 
 
 
701 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4166  glycogen debranching enzyme GlgX  33.67 
 
 
693 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.830683  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  35.47 
 
 
733 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  34.05 
 
 
752 aa  390  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  34.79 
 
 
720 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13830  glycogen debranching enzyme GlgX  36.87 
 
 
720 aa  391  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844349  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  34 
 
 
712 aa  392  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  34.38 
 
 
714 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  33.95 
 
 
709 aa  387  1e-106  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3027  glycogen debranching enzyme GlgX  35.33 
 
 
733 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1322  glycogen debranching enzyme GlgX  35.47 
 
 
733 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831141  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0505  glycogen debranching protein GlgX  34.58 
 
 
714 aa  389  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299874  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1332  glycogen debranching enzyme GlgX  35.56 
 
 
733 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  35.08 
 
 
716 aa  389  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  40.77 
 
 
722 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  32.53 
 
 
712 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  32.34 
 
 
712 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_19757  predicted protein  35.67 
 
 
715 aa  386  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.13703  normal  0.0212411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  35.01 
 
 
755 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7031  glycogen debranching protein GlgX  34.48 
 
 
708 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261677  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  32.67 
 
 
712 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  38.8 
 
 
733 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  35.31 
 
 
706 aa  385  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  36.7 
 
 
1537 aa  385  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  34.87 
 
 
721 aa  383  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  34.94 
 
 
721 aa  384  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0269  glycogen debranching enzyme GlgX  36.22 
 
 
733 aa  385  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.537346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>