More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_43578 on replicon NC_009374
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009374  OSTLU_43578  predicted protein  100 
 
 
765 aa  1598    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0789627  normal  0.106596 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  46.63 
 
 
706 aa  593  1e-168  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4442  glycogen debranching enzyme GlgX  45.15 
 
 
723 aa  580  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405829  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  40.49 
 
 
706 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  41.2 
 
 
708 aa  538  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  41.91 
 
 
694 aa  533  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  41.27 
 
 
705 aa  533  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2859  glycogen debranching enzyme GlgX  43.94 
 
 
690 aa  531  1e-149  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3784  glycogen debranching enzyme GlgX  43.04 
 
 
693 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  43.36 
 
 
724 aa  521  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  40.68 
 
 
718 aa  520  1e-146  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_19757  predicted protein  42.53 
 
 
715 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.13703  normal  0.0212411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  41.33 
 
 
695 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  42.34 
 
 
693 aa  512  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  41.38 
 
 
694 aa  515  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  41.38 
 
 
694 aa  515  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  40.62 
 
 
721 aa  509  1e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  42.08 
 
 
696 aa  509  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  39.42 
 
 
714 aa  499  1e-139  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  39.89 
 
 
729 aa  498  1e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  42.66 
 
 
710 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  40.44 
 
 
726 aa  492  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  41.95 
 
 
715 aa  485  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  42.39 
 
 
706 aa  481  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  40.82 
 
 
722 aa  480  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  41.18 
 
 
704 aa  477  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  40.1 
 
 
720 aa  474  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  40.46 
 
 
752 aa  473  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  40.03 
 
 
709 aa  474  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  40.27 
 
 
751 aa  472  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  39.86 
 
 
697 aa  474  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  40.67 
 
 
708 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3070  glycogen debranching enzyme GlgX  38.27 
 
 
686 aa  473  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0162429 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  42.01 
 
 
701 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  40.7 
 
 
707 aa  471  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  40.63 
 
 
1464 aa  471  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  40.93 
 
 
712 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  41.4 
 
 
730 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  40.5 
 
 
1537 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  42.99 
 
 
708 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  40.08 
 
 
720 aa  465  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  39.94 
 
 
719 aa  462  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  41.6 
 
 
721 aa  462  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  40.82 
 
 
721 aa  464  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  40.39 
 
 
721 aa  465  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1471  glycogen debranching enzyme GlgX  38.87 
 
 
683 aa  464  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  40.62 
 
 
714 aa  463  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  38.87 
 
 
711 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  38.87 
 
 
711 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  39.39 
 
 
714 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  39.37 
 
 
718 aa  462  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  39.43 
 
 
671 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  39.39 
 
 
714 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  39.39 
 
 
714 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1973  glycogen debranching enzyme GlgX  39.3 
 
 
721 aa  458  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0990735  hitchhiker  0.000349089 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  40.14 
 
 
711 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  42.17 
 
 
703 aa  457  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  39.28 
 
 
710 aa  457  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  39.89 
 
 
738 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  42.92 
 
 
722 aa  459  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  43.08 
 
 
720 aa  458  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  43.08 
 
 
720 aa  458  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0893  glycogen debranching enzyme GlgX  37.67 
 
 
693 aa  457  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.409319  normal  0.933748 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  40 
 
 
712 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  40.52 
 
 
707 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  40.17 
 
 
701 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2795  glycogen debranching enzyme GlgX  40.81 
 
 
779 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0466072  decreased coverage  0.00000490674 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  40.14 
 
 
712 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  40.54 
 
 
715 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0269  glycogen debranching enzyme GlgX  43.32 
 
 
733 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.537346  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  39.78 
 
 
723 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  39.27 
 
 
723 aa  452  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  37.84 
 
 
713 aa  449  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  40.59 
 
 
712 aa  449  1e-125  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  40.05 
 
 
711 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  36.71 
 
 
774 aa  452  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  40.73 
 
 
779 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5114  glycogen debranching enzyme GlgX  42.01 
 
 
708 aa  451  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.84007  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  39.97 
 
 
710 aa  451  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  39.94 
 
 
712 aa  451  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  39.05 
 
 
706 aa  451  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  38.44 
 
 
756 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  40.66 
 
 
706 aa  448  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  39.2 
 
 
719 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  39.72 
 
 
722 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  43.87 
 
 
727 aa  449  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  40 
 
 
720 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  38.85 
 
 
755 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  39.97 
 
 
757 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  39.92 
 
 
700 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  39.22 
 
 
738 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13830  glycogen debranching enzyme GlgX  38.85 
 
 
720 aa  448  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844349  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  37.64 
 
 
718 aa  444  1e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  39.05 
 
 
717 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  39.32 
 
 
717 aa  445  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  40.34 
 
 
716 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  39.62 
 
 
720 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2010  glycogen debranching enzyme GlgX  39.78 
 
 
788 aa  443  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  38.35 
 
 
755 aa  444  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  42.95 
 
 
720 aa  446  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.888887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>