More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3520 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 671 aa  1385    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  47.79 
 
 		 721 aa  636    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  59.1 
 
 		 697 aa  793    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0893  glycogen debranching enzyme GlgX  48.14 
 
 		 693 aa  645    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.409319  normal  0.933748 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  44.77 
 
 		 774 aa  622  1e-177  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3784  glycogen debranching enzyme GlgX  46.83 
 
 		 693 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  44.77 
 
 		 705 aa  587  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  45.89 
 
 		 706 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  46.35 
 
 		 693 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  47.85 
 
 		 694 aa  581  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  47.85 
 
 		 694 aa  581  1e-164  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  45.75 
 
 		 708 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  48 
 
 		 694 aa  567  1e-160  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  47.27 
 
 		 695 aa  563  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  44.59 
 
 		 696 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  41.95 
 
 		 718 aa  558  1e-157  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  46.73 
 
 		 724 aa  558  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  41.5 
 
 		 729 aa  557  1e-157  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  42.1 
 
 		 706 aa  537  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4442  glycogen debranching enzyme GlgX  43.25 
 
 		 723 aa  528  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3070  glycogen debranching enzyme GlgX  41.38 
 
 		 686 aa  528  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0162429 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  41.38 
 
 		 714 aa  508  9.999999999999999e-143  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  43.47 
 
 		 720 aa  500  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  42.52 
 
 		 715 aa  485  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  41.42 
 
 		 721 aa  483  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  40.48 
 
 		 710 aa  485  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  40.54 
 
 		 733 aa  479  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  42.23 
 
 		 729 aa  481  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  40.89 
 
 		 708 aa  479  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  40.08 
 
 		 708 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  42.07 
 
 		 712 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  43.36 
 
 		 712 aa  476  1e-133  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  41.84 
 
 		 719 aa  476  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  40.73 
 
 		 718 aa  474  1e-132  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  40.99 
 
 		 722 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  42.71 
 
 		 712 aa  472  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  41.39 
 
 		 706 aa  469  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  41.5 
 
 		 712 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  41.76 
 
 		 711 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_19757  predicted protein  40.37 
 
 		 715 aa  468  9.999999999999999e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.13703  normal  0.0212411 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1881  glycogen debranching protein GlgX  40.46 
 
 		 691 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  42.86 
 
 		 727 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  40.68 
 
 		 738 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  39.5 
 
 		 710 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4166  glycogen debranching enzyme GlgX  40.57 
 
 		 693 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.830683  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  42.67 
 
 		 727 aa  464  1e-129  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1247  glycoside hydrolase family 13 protein  42.48 
 
 		 703 aa  462  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  39.57 
 
 		 751 aa  464  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1471  glycogen debranching enzyme GlgX  41.26 
 
 		 683 aa  464  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  41.73 
 
 		 1464 aa  464  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  40.53 
 
 		 738 aa  463  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  40.71 
 
 		 721 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0827  glycogen debranching enzyme GlgX  42.19 
 
 		 705 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125239  normal  0.0549007 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43578  predicted protein  39.43 
 
 		 765 aa  461  9.999999999999999e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0789627  normal  0.106596 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  41.17 
 
 		 723 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3027  glycogen debranching enzyme GlgX  39.21 
 
 		 733 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2700  glycogen debranching enzyme GlgX  42.36 
 
 		 845 aa  457  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1322  glycogen debranching enzyme GlgX  39.63 
 
 		 733 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831141  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  39.07 
 
 		 733 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1249  glycogen debranching enzyme GlgX  39.1 
 
 		 735 aa  457  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0505  glycogen debranching protein GlgX  41.49 
 
 		 714 aa  458  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299874  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3485  glycogen debranching protein GlgX  40 
 
 		 692 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1463  glycogen debranching protein GlgX  40.96 
 
 		 692 aa  457  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  39.53 
 
 		 755 aa  457  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  42.03 
 
 		 779 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05691  putative isoamylase  40.09 
 
 		 704 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2835  glycogen debranching enzyme GlgX  39.02 
 
 		 752 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  40.12 
 
 		 1537 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  40.69 
 
 		 712 aa  459  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  38.98 
 
 		 726 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  41.12 
 
 		 745 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  39.24 
 
 		 756 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  41.84 
 
 		 717 aa  453  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  40.77 
 
 		 701 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1332  glycogen debranching enzyme GlgX  39.07 
 
 		 733 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  40.18 
 
 		 720 aa  453  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  40.45 
 
 		 701 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  38.95 
 
 		 722 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  38.58 
 
 		 707 aa  453  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2757  glycogen debranching enzyme GlgX  38.88 
 
 		 752 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  38.95 
 
 		 720 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2933  glycogen debranching enzyme GlgX  38.93 
 
 		 752 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  38.95 
 
 		 720 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2859  glycogen debranching enzyme GlgX  41.47 
 
 		 690 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1206  glycogen debranching enzyme GlgX  39.4 
 
 		 692 aa  452  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  42.49 
 
 		 701 aa  451  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  39.68 
 
 		 758 aa  451  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  39.68 
 
 		 758 aa  452  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  40.11 
 
 		 716 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6324  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  39.36 
 
 		 691 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.24347  normal  0.874434 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  41.13 
 
 		 757 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  40.82 
 
 		 711 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1189  glycogen debranching protein GlgX  39.34 
 
 		 688 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.50354  normal  0.29921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  40.11 
 
 		 716 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  42.16 
 
 		 706 aa  449  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  43.5 
 
 		 700 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  37.85 
 
 		 718 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  39.15 
 
 		 722 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0577  alpha amylase domain-containing protein  40.79 
 
 		 692 aa  444  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3213  glycogen debranching protein GlgX  39.61 
 
 		 728 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>