More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4442 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2859  glycogen debranching enzyme GlgX  55.41 
 
 
690 aa  775    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  65.2 
 
 
706 aa  955    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4442  glycogen debranching enzyme GlgX  100 
 
 
723 aa  1499    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405829  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  44.34 
 
 
718 aa  610  1e-173  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  45.65 
 
 
729 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  44.89 
 
 
721 aa  595  1e-169  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  46.93 
 
 
697 aa  592  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  46.04 
 
 
724 aa  585  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  43.76 
 
 
705 aa  585  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43578  predicted protein  45.15 
 
 
765 aa  580  1e-164  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0789627  normal  0.106596 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  45.85 
 
 
694 aa  576  1.0000000000000001e-163  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  46.29 
 
 
694 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  46.29 
 
 
694 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  46.27 
 
 
708 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  46.29 
 
 
706 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0893  glycogen debranching enzyme GlgX  44.1 
 
 
693 aa  574  1.0000000000000001e-162  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.409319  normal  0.933748 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  41.21 
 
 
774 aa  570  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  46.16 
 
 
693 aa  566  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3784  glycogen debranching enzyme GlgX  45.12 
 
 
693 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  46.36 
 
 
696 aa  543  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  43.92 
 
 
720 aa  535  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3070  glycogen debranching enzyme GlgX  43.33 
 
 
686 aa  535  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0162429 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  43.18 
 
 
715 aa  529  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_19757  predicted protein  43.1 
 
 
715 aa  528  1e-148  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.13703  normal  0.0212411 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  43.25 
 
 
671 aa  528  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  41.2 
 
 
718 aa  519  1e-146  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  42.41 
 
 
695 aa  520  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  40.36 
 
 
714 aa  517  1.0000000000000001e-145  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  42.26 
 
 
710 aa  514  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  43.34 
 
 
730 aa  513  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  42.75 
 
 
710 aa  513  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  41.91 
 
 
745 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  42.5 
 
 
723 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  44.59 
 
 
717 aa  507  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  41.81 
 
 
729 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  43.13 
 
 
720 aa  508  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  41.41 
 
 
707 aa  506  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  43.44 
 
 
721 aa  508  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  42.54 
 
 
714 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5114  glycogen debranching enzyme GlgX  43 
 
 
708 aa  503  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.84007  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  41.89 
 
 
711 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  42.24 
 
 
712 aa  503  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  41.37 
 
 
726 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  41.13 
 
 
722 aa  499  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  40.38 
 
 
1537 aa  502  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  41.59 
 
 
708 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  41.75 
 
 
711 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  41.9 
 
 
738 aa  501  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  42.42 
 
 
722 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  42.42 
 
 
720 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  42.42 
 
 
720 aa  500  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  42.12 
 
 
758 aa  496  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  41.7 
 
 
755 aa  498  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  41.66 
 
 
716 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  42.16 
 
 
701 aa  496  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  41.26 
 
 
751 aa  498  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  41.94 
 
 
779 aa  499  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  41 
 
 
708 aa  498  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  42.39 
 
 
712 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  42.12 
 
 
758 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  42.48 
 
 
723 aa  495  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  41.04 
 
 
717 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  41.21 
 
 
717 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  41.61 
 
 
706 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  41.95 
 
 
712 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  41.04 
 
 
717 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  41.18 
 
 
717 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  41.9 
 
 
716 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  42.46 
 
 
711 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  41.39 
 
 
752 aa  492  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  42.11 
 
 
712 aa  492  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  42.78 
 
 
711 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  45.03 
 
 
712 aa  490  1e-137  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  41.29 
 
 
718 aa  491  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  40.93 
 
 
738 aa  490  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13830  glycogen debranching enzyme GlgX  42.1 
 
 
720 aa  489  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844349  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  41.42 
 
 
715 aa  491  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  41.26 
 
 
757 aa  489  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  41.84 
 
 
721 aa  492  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  41.57 
 
 
721 aa  486  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  41.07 
 
 
701 aa  487  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  41.29 
 
 
720 aa  486  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  40.33 
 
 
719 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  42.13 
 
 
709 aa  488  1e-136  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  40.69 
 
 
756 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  42.37 
 
 
704 aa  486  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  40.03 
 
 
727 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  41.64 
 
 
704 aa  483  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  41.71 
 
 
706 aa  485  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  41.15 
 
 
710 aa  483  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  41.76 
 
 
707 aa  480  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  40.22 
 
 
719 aa  480  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  40.36 
 
 
755 aa  482  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2795  glycogen debranching enzyme GlgX  41.77 
 
 
779 aa  482  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0466072  decreased coverage  0.00000490674 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  39.94 
 
 
709 aa  481  1e-134  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  39.83 
 
 
727 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1350  glycogen debranching protein GlgX  44.48 
 
 
776 aa  476  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  44.59 
 
 
727 aa  478  1e-133  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  39.81 
 
 
1464 aa  476  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  40.78 
 
 
714 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>