More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1350 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1070  glycogen debranching enzyme GlgX  43.13 
 
 		 802 aa  646    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  81.52 
 
 		 1537 aa  1301    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  46.27 
 
 		 718 aa  725    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  52.65 
 
 		 720 aa  719    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  50.96 
 
 		 717 aa  738    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  50.55 
 
 		 717 aa  732    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  61.32 
 
 		 713 aa  949    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3793  glycogen debranching enzyme GlgX  49.86 
 
 		 717 aa  699    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  61.23 
 
 		 720 aa  930    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1735  glycogen debranching enzyme GlgX  53.11 
 
 		 691 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  48.99 
 
 		 727 aa  721    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  63.32 
 
 		 714 aa  960    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  57.18 
 
 		 711 aa  861    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2010  glycogen debranching enzyme GlgX  54.89 
 
 		 788 aa  770    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  50.48 
 
 		 755 aa  731    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  50.56 
 
 		 727 aa  732    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  62.89 
 
 		 707 aa  964    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  59.84 
 
 		 720 aa  941    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4230  glycogen debranching protein GlgX  47.14 
 
 		 743 aa  636    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535158  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1782  glycogen debranching enzyme GlgX  51.06 
 
 		 688 aa  692    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1206  glycogen debranching enzyme GlgX  49.44 
 
 		 692 aa  679    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1463  glycogen debranching enzyme GlgX  49.32 
 
 		 708 aa  654    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.66197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  57.95 
 
 		 706 aa  893    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  49.8 
 
 		 719 aa  734    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2226  glycosidase  50.22 
 
 		 694 aa  645    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2449  putative glycosyl hydrolase  50.91 
 
 		 688 aa  687    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  49.8 
 
 		 710 aa  739    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7031  glycogen debranching protein GlgX  47.32 
 
 		 708 aa  636    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3083  glycogen debranching enzyme GlgX  49 
 
 		 730 aa  719    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  50.62 
 
 		 745 aa  723    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  61.5 
 
 		 715 aa  956    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4166  glycogen debranching enzyme GlgX  48.19 
 
 		 693 aa  652    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.830683  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  50.4 
 
 		 755 aa  720    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3835  glycogen debranching enzyme GlgX  54.13 
 
 		 673 aa  717    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.124257  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  59.34 
 
 		 701 aa  924    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0505  glycogen debranching protein GlgX  54.98 
 
 		 714 aa  775    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299874  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  52.91 
 
 		 729 aa  733    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  59.66 
 
 		 721 aa  931    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  52.94 
 
 		 716 aa  746    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  52.69 
 
 		 712 aa  795    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1350  glycogen debranching protein GlgX  100 
 
 		 776 aa  1598    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  57.62 
 
 		 708 aa  863    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1881  glycogen debranching protein GlgX  48.81 
 
 		 691 aa  662    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  49.66 
 
 		 733 aa  709    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3733  glycogen debranching enzyme GlgX  49.3 
 
 		 733 aa  685    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.635331  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1785  glycogen debranching enzyme GlgX  53.28 
 
 		 691 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  50.07 
 
 		 756 aa  719    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  52.09 
 
 		 719 aa  739    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  47.34 
 
 		 716 aa  637    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  51.59 
 
 		 719 aa  736    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  51.06 
 
 		 701 aa  718    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  52.69 
 
 		 712 aa  805    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1189  glycogen debranching protein GlgX  48.53 
 
 		 688 aa  679    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.50354  normal  0.29921 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  48.29 
 
 		 738 aa  715    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3027  glycogen debranching enzyme GlgX  46.94 
 
 		 733 aa  636    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3213  glycogen debranching protein GlgX  49.45 
 
 		 728 aa  704    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3485  glycogen debranching protein GlgX  48.68 
 
 		 692 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1463  glycogen debranching protein GlgX  49.03 
 
 		 692 aa  667    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  52.56 
 
 		 711 aa  781    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  54.66 
 
 		 727 aa  806    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1333  glycogen debranching protein GlgX  47.4 
 
 		 705 aa  642    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0242466  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  59.84 
 
 		 722 aa  941    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  63.32 
 
 		 714 aa  959    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  58.12 
 
 		 715 aa  865    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5488  glycogen debranching enzyme GlgX  47.75 
 
 		 708 aa  649    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.168137  decreased coverage  0.0000616357 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  51.13 
 
 		 691 aa  701    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6085  glycogen debranching enzyme GlgX  47.4 
 
 		 705 aa  641    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0291933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  51.75 
 
 		 758 aa  729    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0902  glycogen debranching enzyme GlgX  50.22 
 
 		 694 aa  644    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2983  glycogen debranching enzyme GlgX  49.09 
 
 		 718 aa  652    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602894  normal  0.0199459 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1112  glycogen debranching enzyme GlgX  50.77 
 
 		 688 aa  684    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758297  normal  0.439261 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2267  glycogen debranching enzyme GlgX  51.1 
 
 		 691 aa  649    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138313  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  50.55 
 
 		 717 aa  731    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  57.98 
 
 		 707 aa  863    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  52.01 
 
 		 704 aa  748    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  51.19 
 
 		 723 aa  738    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  50.47 
 
 		 757 aa  719    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  50.84 
 
 		 738 aa  719    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1672  glycogen debranching enzyme GlgX  53.45 
 
 		 691 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.574762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  52.66 
 
 		 716 aa  745    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  50.82 
 
 		 717 aa  735    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  62.25 
 
 		 751 aa  976    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6496  glycogen debranching enzyme GlgX  47.4 
 
 		 705 aa  642    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0828061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  62.02 
 
 		 718 aa  967    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4409  glycogen debranching enzyme GlgX  48.73 
 
 		 695 aa  654    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.374964 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  53.01 
 
 		 1464 aa  754    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  58.32 
 
 		 706 aa  865    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  56.86 
 
 		 700 aa  802    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  64.55 
 
 		 712 aa  1002    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  46.8 
 
 		 733 aa  635    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4425  glycogen debranching enzyme GlgX  49.44 
 
 		 697 aa  650    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0269  glycogen debranching enzyme GlgX  62.01 
 
 		 733 aa  941    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.537346  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1812  glycogen debranching enzyme GlgX  47.45 
 
 		 718 aa  696    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  51.32 
 
 		 711 aa  759    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  59.84 
 
 		 720 aa  941    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  63.32 
 
 		 714 aa  959    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6324  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  48 
 
 		 691 aa  657    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.24347  normal  0.874434 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1322  glycogen debranching enzyme GlgX  47.07 
 
 		 733 aa  636    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831141  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1607  glycogen debranching enzyme GlgX  53.45 
 
 		 691 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  60.65 
 
 		 714 aa  947    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>