More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4230 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5488  glycogen debranching enzyme GlgX  63.95 
 
 		 708 aa  915    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.168137  decreased coverage  0.0000616357 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  48.46 
 
 		 1537 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  53.07 
 
 		 755 aa  756    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1530  glycogen debranching enzyme GlgX  53.25 
 
 		 704 aa  697    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376415  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  53.06 
 
 		 717 aa  768    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  54.58 
 
 		 757 aa  765    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4409  glycogen debranching enzyme GlgX  48.61 
 
 		 695 aa  674    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.374964 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0238  glycogen operon protein GlgX  65.99 
 
 		 754 aa  989    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137822  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1495  glycogen operon protein  47.52 
 
 		 750 aa  669    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  51.52 
 
 		 727 aa  761    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1565  glycogen debranching enzyme GlgX  62.75 
 
 		 702 aa  877    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.122779  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1782  glycogen debranching enzyme GlgX  54.52 
 
 		 688 aa  740    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  47.75 
 
 		 714 aa  666    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0819  glycogen operon protein GlgX, putative  62.75 
 
 		 702 aa  877    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0962499  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  51.24 
 
 		 727 aa  754    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  50.5 
 
 		 707 aa  652    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1542  glycogen debranching enzyme GlgX  62.75 
 
 		 702 aa  877    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4230  glycogen debranching protein GlgX  100 
 
 		 743 aa  1511    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535158  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0618  glycogen debranching enzyme GlgX  62.75 
 
 		 702 aa  877    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.385691  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1206  glycogen debranching enzyme GlgX  49.93 
 
 		 692 aa  708    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1736  glycogen debranching enzyme GlgX  62.75 
 
 		 702 aa  877    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  50.76 
 
 		 706 aa  709    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  52.09 
 
 		 719 aa  752    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2226  glycosidase  50.91 
 
 		 694 aa  663    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2449  putative glycosyl hydrolase  54.25 
 
 		 688 aa  743    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2884  glycogen debranching enzyme  53.11 
 
 		 704 aa  697    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.499516  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7031  glycogen debranching protein GlgX  63.91 
 
 		 708 aa  913    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  48.84 
 
 		 733 aa  662    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  53.69 
 
 		 745 aa  750    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  47.74 
 
 		 718 aa  659    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1332  glycogen debranching enzyme GlgX  48.41 
 
 		 733 aa  676    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  47.03 
 
 		 720 aa  636    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  47.64 
 
 		 721 aa  640    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  47.8 
 
 		 701 aa  635    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0505  glycogen debranching protein GlgX  53.42 
 
 		 714 aa  731    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299874  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  55.54 
 
 		 729 aa  771    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  48.48 
 
 		 711 aa  653    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  52.79 
 
 		 717 aa  763    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  50.07 
 
 		 712 aa  674    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  48.66 
 
 		 720 aa  646    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6085  glycogen debranching enzyme GlgX  64.2 
 
 		 705 aa  912    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0291933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1881  glycogen debranching protein GlgX  49.86 
 
 		 691 aa  704    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  51.33 
 
 		 733 aa  714    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  52.65 
 
 		 717 aa  765    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3116  glycogen debranching protein GlgX  48.61 
 
 		 698 aa  660    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6811  glycogen debranching enzyme GlgX  53.46 
 
 		 702 aa  654    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  51.95 
 
 		 719 aa  694    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  49.58 
 
 		 716 aa  699    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  54 
 
 		 719 aa  751    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  50.91 
 
 		 701 aa  712    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3681  glycogen debranching protein GlgX  49.58 
 
 		 692 aa  681    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1189  glycogen debranching protein GlgX  51.83 
 
 		 688 aa  692    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.50354  normal  0.29921 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  50.67 
 
 		 738 aa  733    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2864  putative glycogen operon protein GlgX  64.76 
 
 		 739 aa  968    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3213  glycogen debranching protein GlgX  50.77 
 
 		 728 aa  698    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3485  glycogen debranching protein GlgX  50.07 
 
 		 692 aa  700    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1463  glycogen debranching protein GlgX  51.05 
 
 		 692 aa  717    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2937  glycogen debranching enzyme GlgX  60.06 
 
 		 703 aa  848    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  47.19 
 
 		 727 aa  643    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1333  glycogen debranching protein GlgX  64.06 
 
 		 705 aa  912    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0242466  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  47.03 
 
 		 722 aa  637    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  47.75 
 
 		 714 aa  665    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  53.44 
 
 		 715 aa  735    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0543  glycogen debranching enzyme GlgX  59.94 
 
 		 704 aa  854    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0247855  normal  0.604467 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  54.1 
 
 		 691 aa  753    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1112  glycogen debranching enzyme GlgX  54.25 
 
 		 688 aa  745    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758297  normal  0.439261 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0537  glycogen debranching enzyme GlgX  62.75 
 
 		 702 aa  877    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0902  glycogen debranching enzyme GlgX  51.34 
 
 		 694 aa  668    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  54.58 
 
 		 716 aa  765    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  52.92 
 
 		 717 aa  767    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  45.54 
 
 		 707 aa  639    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6324  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  50.8 
 
 		 691 aa  698    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.24347  normal  0.874434 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2757  glycogen debranching enzyme GlgX  48.1 
 
 		 752 aa  669    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2835  glycogen debranching enzyme GlgX  47.56 
 
 		 752 aa  665    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2164  glycogen debranching enzyme GlgX  46.63 
 
 		 708 aa  654    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5593  glycogen debranching enzyme GlgX  61.84 
 
 		 704 aa  887    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  54.87 
 
 		 716 aa  764    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1322  glycogen debranching enzyme GlgX  48.13 
 
 		 733 aa  674    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831141  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  47.45 
 
 		 751 aa  669    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6496  glycogen debranching enzyme GlgX  64.06 
 
 		 705 aa  912    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0828061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1136  glycogen debranching enzyme GlgX  54.3 
 
 		 704 aa  729    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  52.51 
 
 		 704 aa  741    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  48.3 
 
 		 1464 aa  698    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2933  glycogen debranching enzyme GlgX  47.83 
 
 		 752 aa  665    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  50.77 
 
 		 700 aa  656    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  49.44 
 
 		 712 aa  669    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  47.37 
 
 		 715 aa  642    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4425  glycogen debranching enzyme GlgX  55.73 
 
 		 697 aa  706    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0269  glycogen debranching enzyme GlgX  48.49 
 
 		 733 aa  642    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.537346  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  48.41 
 
 		 733 aa  678    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  48.2 
 
 		 711 aa  644    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  47.03 
 
 		 720 aa  636    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  47.75 
 
 		 714 aa  665    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2267  glycogen debranching enzyme GlgX  50.92 
 
 		 691 aa  665    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138313  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  50.84 
 
 		 758 aa  722    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1249  glycogen debranching enzyme GlgX  48.3 
 
 		 735 aa  677    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  47.08 
 
 		 714 aa  641    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  48.09 
 
 		 723 aa  669    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  51.54 
 
 		 756 aa  736    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1103  glycogen debranching enzyme GlgX  48.9 
 
 		 695 aa  638    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.512458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>