More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2937 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5488  glycogen debranching enzyme GlgX  61.14 
 
 		 708 aa  838    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.168137  decreased coverage  0.0000616357 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  55.54 
 
 		 720 aa  744    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  51.77 
 
 		 738 aa  733    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1530  glycogen debranching enzyme GlgX  54.23 
 
 		 704 aa  687    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376415  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  52.78 
 
 		 717 aa  727    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  52.78 
 
 		 717 aa  728    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4409  glycogen debranching enzyme GlgX  51.81 
 
 		 695 aa  660    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.374964 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0238  glycogen operon protein GlgX  62.03 
 
 		 754 aa  880    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137822  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1495  glycogen operon protein  48.5 
 
 		 750 aa  660    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  51.21 
 
 		 727 aa  729    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  48.51 
 
 		 714 aa  660    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  48.8 
 
 		 718 aa  659    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  47.89 
 
 		 723 aa  647    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0618  glycogen debranching enzyme GlgX  60.59 
 
 		 702 aa  810    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.385691  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  55.59 
 
 		 755 aa  746    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0819  glycogen operon protein GlgX, putative  60.59 
 
 		 702 aa  810    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0962499  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  50.71 
 
 		 727 aa  724    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  48.5 
 
 		 707 aa  637    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6323  glycogen debranching enzyme GlgX  61.23 
 
 		 704 aa  835    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431119  normal  0.149748 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4230  glycogen debranching protein GlgX  60.06 
 
 		 743 aa  841    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535158  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1136  glycogen debranching enzyme GlgX  54.17 
 
 		 704 aa  706    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1206  glycogen debranching enzyme GlgX  53.97 
 
 		 692 aa  692    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1736  glycogen debranching enzyme GlgX  60.59 
 
 		 702 aa  810    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  49.29 
 
 		 706 aa  676    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  51.92 
 
 		 719 aa  721    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2226  glycosidase  51.16 
 
 		 694 aa  662    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2449  putative glycosyl hydrolase  54.64 
 
 		 688 aa  737    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2884  glycogen debranching enzyme  54.09 
 
 		 704 aa  686    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.499516  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7031  glycogen debranching protein GlgX  62.13 
 
 		 708 aa  853    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1249  glycogen debranching enzyme GlgX  49.93 
 
 		 735 aa  661    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  53.74 
 
 		 704 aa  734    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1565  glycogen debranching enzyme GlgX  60.59 
 
 		 702 aa  810    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.122779  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1337  glycogen debranching enzyme GlgX  60.59 
 
 		 702 aa  810    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  47.56 
 
 		 733 aa  649    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1332  glycogen debranching enzyme GlgX  48.75 
 
 		 733 aa  677    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  55.08 
 
 		 716 aa  746    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6811  glycogen debranching enzyme GlgX  51.72 
 
 		 702 aa  671    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0505  glycogen debranching protein GlgX  52.65 
 
 		 714 aa  697    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299874  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  51.42 
 
 		 729 aa  701    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1322  glycogen debranching enzyme GlgX  49.44 
 
 		 733 aa  677    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831141  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1692  glycogen debranching enzyme GlgX  52.14 
 
 		 697 aa  640    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4166  glycogen debranching enzyme GlgX  53.6 
 
 		 693 aa  692    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.830683  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1735  glycogen debranching enzyme GlgX  48.84 
 
 		 691 aa  679    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  52.64 
 
 		 717 aa  725    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1881  glycogen debranching protein GlgX  52.82 
 
 		 691 aa  713    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  51.08 
 
 		 733 aa  696    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  53.44 
 
 		 723 aa  726    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3116  glycogen debranching protein GlgX  50.14 
 
 		 698 aa  640    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  52.83 
 
 		 756 aa  736    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  52.94 
 
 		 719 aa  702    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  51.55 
 
 		 716 aa  702    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  56.34 
 
 		 719 aa  735    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  52.18 
 
 		 701 aa  687    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3681  glycogen debranching protein GlgX  52.69 
 
 		 692 aa  687    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1189  glycogen debranching protein GlgX  49.14 
 
 		 688 aa  672    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.50354  normal  0.29921 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  53.17 
 
 		 738 aa  746    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2864  putative glycogen operon protein GlgX  60.49 
 
 		 739 aa  869    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3213  glycogen debranching protein GlgX  51.52 
 
 		 728 aa  684    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3485  glycogen debranching protein GlgX  53.02 
 
 		 692 aa  713    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1463  glycogen debranching protein GlgX  51.38 
 
 		 692 aa  692    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6324  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  51.81 
 
 		 691 aa  707    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.24347  normal  0.874434 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3733  glycogen debranching enzyme GlgX  49.5 
 
 		 733 aa  665    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.635331  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1333  glycogen debranching protein GlgX  61.83 
 
 		 705 aa  839    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0242466  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6085  glycogen debranching enzyme GlgX  61.98 
 
 		 705 aa  838    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0291933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  48.06 
 
 		 714 aa  661    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  50.99 
 
 		 715 aa  698    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  49.93 
 
 		 711 aa  658    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  57.35 
 
 		 691 aa  761    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0537  glycogen debranching enzyme GlgX  60.59 
 
 		 702 aa  810    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0902  glycogen debranching enzyme GlgX  51.45 
 
 		 694 aa  664    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1112  glycogen debranching enzyme GlgX  54.64 
 
 		 688 aa  736    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758297  normal  0.439261 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3936  glycogen debranching enzyme GlgX  62.75 
 
 		 766 aa  901    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659462  normal  0.365741 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  56.55 
 
 		 757 aa  754    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6824  glycogen debranching enzyme GlgX  60.63 
 
 		 739 aa  871    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2937  glycogen debranching enzyme GlgX  100 
 
 		 703 aa  1424    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2757  glycogen debranching enzyme GlgX  49.93 
 
 		 752 aa  657    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2835  glycogen debranching enzyme GlgX  49.93 
 
 		 752 aa  658    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2164  glycogen debranching enzyme GlgX  48.37 
 
 		 708 aa  681    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5593  glycogen debranching enzyme GlgX  61.09 
 
 		 704 aa  829    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  54.99 
 
 		 716 aa  748    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  49.44 
 
 		 733 aa  677    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  47.52 
 
 		 751 aa  658    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6496  glycogen debranching enzyme GlgX  61.83 
 
 		 705 aa  839    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0828061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1542  glycogen debranching enzyme GlgX  60.59 
 
 		 702 aa  810    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2267  glycogen debranching enzyme GlgX  52.17 
 
 		 691 aa  673    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138313  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  50.76 
 
 		 1464 aa  664    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2933  glycogen debranching enzyme GlgX  49.71 
 
 		 752 aa  654    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  49.71 
 
 		 700 aa  641    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  52.82 
 
 		 755 aa  732    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  53.24 
 
 		 758 aa  729    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4425  glycogen debranching enzyme GlgX  52.45 
 
 		 697 aa  666    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1672  glycogen debranching enzyme GlgX  49.13 
 
 		 691 aa  681    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.574762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  52.14 
 
 		 717 aa  721    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0543  glycogen debranching enzyme GlgX  59.09 
 
 		 704 aa  828    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0247855  normal  0.604467 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2010  glycogen debranching enzyme GlgX  49.04 
 
 		 788 aa  644    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  48.06 
 
 		 714 aa  661    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1782  glycogen debranching enzyme GlgX  54.39 
 
 		 688 aa  727    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  53.71 
 
 		 710 aa  701    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  53.43 
 
 		 745 aa  725    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4390  glycogen debranching enzyme GlgX  60.72 
 
 		 737 aa  843    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.497261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>