More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2864 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  55.78 
 
 
756 aa  775    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5488  glycogen debranching enzyme GlgX  73.82 
 
 
708 aa  1063    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.168137  decreased coverage  0.0000616357 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  55.13 
 
 
723 aa  787    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1530  glycogen debranching enzyme GlgX  53.54 
 
 
704 aa  694    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376415  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  54.99 
 
 
717 aa  800    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  54.56 
 
 
717 aa  797    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  52.05 
 
 
733 aa  714    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0238  glycogen operon protein GlgX  68.49 
 
 
754 aa  997    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137822  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1495  glycogen operon protein  50.92 
 
 
750 aa  702    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  56.21 
 
 
727 aa  796    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1782  glycogen debranching enzyme GlgX  54.3 
 
 
688 aa  725    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1103  glycogen debranching enzyme GlgX  49.22 
 
 
695 aa  644    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.512458 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1332  glycogen debranching enzyme GlgX  52.56 
 
 
733 aa  713    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  48.3 
 
 
714 aa  672    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1337  glycogen debranching enzyme GlgX  70.95 
 
 
702 aa  1012    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0819  glycogen operon protein GlgX, putative  70.95 
 
 
702 aa  1012    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0962499  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  56.07 
 
 
727 aa  794    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  48.38 
 
 
707 aa  651    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1565  glycogen debranching enzyme GlgX  70.95 
 
 
702 aa  1012    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.122779  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4230  glycogen debranching protein GlgX  64.76 
 
 
743 aa  958    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535158  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  50.29 
 
 
733 aa  679    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1206  glycogen debranching enzyme GlgX  53.36 
 
 
692 aa  724    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1736  glycogen debranching enzyme GlgX  70.95 
 
 
702 aa  1012    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  50.14 
 
 
706 aa  701    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  55.52 
 
 
719 aa  785    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2226  glycosidase  49.57 
 
 
694 aa  666    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2449  putative glycosyl hydrolase  54.87 
 
 
688 aa  730    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2884  glycogen debranching enzyme  53.54 
 
 
704 aa  695    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.499516  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7031  glycogen debranching protein GlgX  74.41 
 
 
708 aa  1066    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261677  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  47.63 
 
 
718 aa  654    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4409  glycogen debranching enzyme GlgX  51.17 
 
 
695 aa  682    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.374964 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0618  glycogen debranching enzyme GlgX  70.95 
 
 
702 aa  1012    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.385691  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2010  glycogen debranching enzyme GlgX  45.79 
 
 
788 aa  665    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1486  glycogen debranching enzyme GlgX  51.58 
 
 
705 aa  660    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700154 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1542  glycogen debranching enzyme GlgX  70.95 
 
 
702 aa  1012    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  47.18 
 
 
720 aa  643    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4390  glycogen debranching enzyme GlgX  85.6 
 
 
737 aa  1288    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.497261 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0505  glycogen debranching protein GlgX  52.74 
 
 
714 aa  719    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299874  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  50.55 
 
 
729 aa  728    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  46.81 
 
 
713 aa  640    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  48.35 
 
 
1537 aa  644    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  50.42 
 
 
712 aa  671    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  55.37 
 
 
755 aa  781    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  56.36 
 
 
717 aa  795    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1881  glycogen debranching protein GlgX  53.66 
 
 
691 aa  720    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  54.52 
 
 
733 aa  743    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2267  glycogen debranching enzyme GlgX  50.66 
 
 
691 aa  671    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138313  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3116  glycogen debranching protein GlgX  51.43 
 
 
698 aa  693    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  53.81 
 
 
758 aa  767    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  51.98 
 
 
719 aa  714    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  52.47 
 
 
716 aa  724    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  57.65 
 
 
719 aa  793    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  54.29 
 
 
701 aa  751    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3681  glycogen debranching protein GlgX  52.54 
 
 
692 aa  696    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1189  glycogen debranching protein GlgX  50.68 
 
 
688 aa  692    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.50354  normal  0.29921 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  54.27 
 
 
738 aa  780    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2864  putative glycogen operon protein GlgX  100 
 
 
739 aa  1519    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3213  glycogen debranching protein GlgX  52.8 
 
 
728 aa  732    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3485  glycogen debranching protein GlgX  53.14 
 
 
692 aa  706    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1463  glycogen debranching protein GlgX  53.02 
 
 
692 aa  738    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2937  glycogen debranching enzyme GlgX  60.49 
 
 
703 aa  869    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  50.08 
 
 
727 aa  643    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1333  glycogen debranching protein GlgX  75.44 
 
 
705 aa  1077    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0242466  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  56.64 
 
 
757 aa  790    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  48.3 
 
 
714 aa  671    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  54.1 
 
 
715 aa  744    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  50.14 
 
 
711 aa  671    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  56.35 
 
 
691 aa  774    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1112  glycogen debranching enzyme GlgX  55.02 
 
 
688 aa  733    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758297  normal  0.439261 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0902  glycogen debranching enzyme GlgX  49.71 
 
 
694 aa  669    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934485  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0537  glycogen debranching enzyme GlgX  70.95 
 
 
702 aa  1012    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  55.43 
 
 
716 aa  789    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  55.32 
 
 
745 aa  796    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  46.33 
 
 
707 aa  650    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6324  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  52.73 
 
 
691 aa  713    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.24347  normal  0.874434 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2757  glycogen debranching enzyme GlgX  52.03 
 
 
752 aa  706    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2835  glycogen debranching enzyme GlgX  51.88 
 
 
752 aa  707    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2164  glycogen debranching enzyme GlgX  52.06 
 
 
708 aa  714    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5593  glycogen debranching enzyme GlgX  72.84 
 
 
704 aa  1060    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  55.46 
 
 
716 aa  788    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  54.7 
 
 
717 aa  795    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  49.3 
 
 
751 aa  685    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6496  glycogen debranching enzyme GlgX  75.44 
 
 
705 aa  1077    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0828061  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6811  glycogen debranching enzyme GlgX  51.56 
 
 
702 aa  666    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  54.42 
 
 
704 aa  786    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  50.22 
 
 
1464 aa  696    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2933  glycogen debranching enzyme GlgX  51.67 
 
 
752 aa  700    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  49.93 
 
 
700 aa  637    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  49.01 
 
 
712 aa  652    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1136  glycogen debranching enzyme GlgX  53.25 
 
 
704 aa  708    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55158  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4425  glycogen debranching enzyme GlgX  53.38 
 
 
697 aa  695    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0269  glycogen debranching enzyme GlgX  46.96 
 
 
733 aa  649    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.537346  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  50.56 
 
 
711 aa  656    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1549  glycogen debranching enzyme GlgX  51.67 
 
 
697 aa  640    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6085  glycogen debranching enzyme GlgX  75.44 
 
 
705 aa  1077    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0291933  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  48.3 
 
 
714 aa  671    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1249  glycogen debranching enzyme GlgX  51.97 
 
 
735 aa  709    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1322  glycogen debranching enzyme GlgX  52.05 
 
 
733 aa  713    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831141  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0543  glycogen debranching enzyme GlgX  62.46 
 
 
704 aa  906    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0247855  normal  0.604467 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6323  glycogen debranching enzyme GlgX  73.42 
 
 
704 aa  1070    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431119  normal  0.149748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>