More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0681 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  49.65 
 
 
713 aa  733    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  49.79 
 
 
713 aa  733    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  49.79 
 
 
713 aa  734    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  49.37 
 
 
713 aa  732    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  49.65 
 
 
713 aa  734    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  49.58 
 
 
713 aa  721    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  100 
 
 
718 aa  1484    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  49.79 
 
 
713 aa  734    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  49.79 
 
 
713 aa  728    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  48.82 
 
 
712 aa  717    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  49.65 
 
 
713 aa  733    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  49.79 
 
 
713 aa  735    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  43.08 
 
 
848 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  45.47 
 
 
850 aa  600  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  45.47 
 
 
852 aa  597  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  45.16 
 
 
852 aa  597  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  44.24 
 
 
852 aa  592  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  44.38 
 
 
848 aa  592  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  45.16 
 
 
852 aa  595  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  45.16 
 
 
852 aa  595  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  44.55 
 
 
852 aa  593  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  44.01 
 
 
856 aa  587  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  43.12 
 
 
1043 aa  505  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  39.48 
 
 
928 aa  501  1e-140  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  40.68 
 
 
647 aa  492  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  42.36 
 
 
843 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  42.31 
 
 
601 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  41.57 
 
 
843 aa  472  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  42.01 
 
 
640 aa  468  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  39.5 
 
 
655 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  38.76 
 
 
1888 aa  456  1e-127  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  39.53 
 
 
841 aa  456  1e-127  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  39.81 
 
 
842 aa  457  1e-127  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  39.91 
 
 
655 aa  456  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  39.18 
 
 
899 aa  454  1.0000000000000001e-126  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  34.78 
 
 
2638 aa  455  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  38.64 
 
 
1136 aa  426  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  36.44 
 
 
874 aa  415  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  36.88 
 
 
1064 aa  395  1e-108  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  36.39 
 
 
1064 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  36.7 
 
 
640 aa  387  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  36.86 
 
 
766 aa  384  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  35.89 
 
 
825 aa  378  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  35.16 
 
 
669 aa  314  2.9999999999999996e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  31.72 
 
 
1117 aa  304  4.0000000000000003e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  34.11 
 
 
1176 aa  282  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  32.79 
 
 
891 aa  273  7e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  31.57 
 
 
776 aa  268  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  32.42 
 
 
1248 aa  263  6.999999999999999e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  30.44 
 
 
991 aa  262  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  34.71 
 
 
1062 aa  261  4e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  33.11 
 
 
1331 aa  258  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.61 
 
 
2156 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  32.48 
 
 
1440 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  32.48 
 
 
1440 aa  253  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  28.32 
 
 
1432 aa  252  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.08 
 
 
1035 aa  251  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  31.94 
 
 
1025 aa  250  8e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  30.58 
 
 
1450 aa  247  6e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  30.41 
 
 
1942 aa  244  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  31.19 
 
 
1441 aa  243  6e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  31.04 
 
 
946 aa  239  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  28.2 
 
 
1252 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  29.66 
 
 
1429 aa  234  6e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.41 
 
 
1891 aa  233  9e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.5 
 
 
2068 aa  233  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  28.35 
 
 
1328 aa  228  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  28.35 
 
 
1329 aa  225  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  31.27 
 
 
1855 aa  223  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  31.8 
 
 
1975 aa  221  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  29.13 
 
 
1472 aa  212  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3828  glycoside hydrolase family 13 protein  31.76 
 
 
817 aa  198  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.535052 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  32.5 
 
 
1124 aa  192  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  30.14 
 
 
998 aa  189  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2273  pullulanase  33.89 
 
 
717 aa  172  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  29.56 
 
 
721 aa  169  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  28.82 
 
 
697 aa  168  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  27.58 
 
 
706 aa  167  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  28.92 
 
 
774 aa  167  8e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  28.32 
 
 
701 aa  166  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2413  glycogen debranching enzyme GlgX  27.7 
 
 
771 aa  166  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.246896  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  28.21 
 
 
718 aa  166  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  27.39 
 
 
700 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0312  glycosyl hydrolase family protein  25.68 
 
 
666 aa  161  4e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0426975  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  25.75 
 
 
710 aa  160  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  27.94 
 
 
671 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  28.39 
 
 
705 aa  160  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  27.13 
 
 
729 aa  158  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  29.35 
 
 
696 aa  158  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1812  glycogen debranching enzyme GlgX  27.27 
 
 
718 aa  158  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2859  glycogen debranching enzyme GlgX  28.35 
 
 
690 aa  158  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  26.44 
 
 
727 aa  158  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  26.23 
 
 
712 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  28.76 
 
 
717 aa  157  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  29.31 
 
 
693 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  27.14 
 
 
721 aa  156  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1471  glycogen debranching enzyme GlgX  26.97 
 
 
683 aa  155  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  26.96 
 
 
707 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  27.27 
 
 
709 aa  152  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7550  glycogen debranching enzyme GlgX  29.92 
 
 
702 aa  152  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>