More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001089 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  43.72 
 
 		 1124 aa  790    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  40.57 
 
 		 1942 aa  704    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  44.68 
 
 		 998 aa  783    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  38.49 
 
 		 1429 aa  837    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  100 
 
 		 1329 aa  2742    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  39.98 
 
 		 946 aa  665    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  48.99 
 
 		 1035 aa  972    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  40.33 
 
 		 1432 aa  919    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  41.74 
 
 		 1472 aa  942    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.99 
 
 		 891 aa  652    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2273  pullulanase  48.81 
 
 		 717 aa  677    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  43.64 
 
 		 1440 aa  989    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  40.32 
 
 		 1450 aa  922    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  41.02 
 
 		 1117 aa  740    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  42.43 
 
 		 1025 aa  674    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  87.45 
 
 		 1328 aa  2416    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  43.64 
 
 		 1440 aa  989    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  43.87 
 
 		 1176 aa  719    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  42.17 
 
 		 1441 aa  973    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  39.9 
 
 		 1975 aa  633  1e-180  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  39.91 
 
 		 1891 aa  630  1e-179  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.82 
 
 		 1248 aa  622  1e-176  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  39.7 
 
 		 1331 aa  618  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  39.85 
 
 		 2068 aa  595  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  35.88 
 
 		 1062 aa  592  1e-167  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  35.69 
 
 		 991 aa  589  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  37.72 
 
 		 1855 aa  586  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  37.46 
 
 		 2156 aa  572  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  29.56 
 
 		 1043 aa  316  1.9999999999999998e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  26.71 
 
 		 1136 aa  303  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  29.21 
 
 		 655 aa  278  4e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  31.08 
 
 		 850 aa  274  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  31.08 
 
 		 852 aa  273  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  30.92 
 
 		 852 aa  272  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  30.92 
 
 		 852 aa  272  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  26.83 
 
 		 640 aa  272  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  30.92 
 
 		 852 aa  272  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  30.39 
 
 		 848 aa  271  8e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  29.51 
 
 		 655 aa  268  7e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  26.24 
 
 		 899 aa  262  3e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  31.83 
 
 		 856 aa  259  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  26.45 
 
 		 874 aa  259  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  30.11 
 
 		 848 aa  257  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  30.61 
 
 		 852 aa  255  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  30.77 
 
 		 852 aa  256  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  28.12 
 
 		 842 aa  249  3e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  27.61 
 
 		 843 aa  238  6e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  27.35 
 
 		 843 aa  236  2.0000000000000002e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  26.64 
 
 		 2638 aa  236  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  28.17 
 
 		 1064 aa  236  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  29 
 
 		 1888 aa  233  2e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  27.7 
 
 		 1064 aa  233  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  29.3 
 
 		 841 aa  231  5e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  28.37 
 
 		 928 aa  231  8e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  30.48 
 
 		 647 aa  230  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  30.29 
 
 		 825 aa  229  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  29.25 
 
 		 601 aa  218  5.9999999999999996e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  28.35 
 
 		 718 aa  214  7e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  27.99 
 
 		 712 aa  204  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  28.57 
 
 		 766 aa  204  8e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  27.05 
 
 		 640 aa  202  3.9999999999999996e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  26.16 
 
 		 713 aa  189  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  26.04 
 
 		 713 aa  189  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  26.04 
 
 		 713 aa  189  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  26.24 
 
 		 713 aa  188  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  26.67 
 
 		 713 aa  184  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  26.9 
 
 		 669 aa  182  4e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  25.93 
 
 		 713 aa  176  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  25.59 
 
 		 713 aa  175  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  24.9 
 
 		 776 aa  173  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  30.16 
 
 		 713 aa  164  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  30.16 
 
 		 713 aa  164  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  25.56 
 
 		 1252 aa  162  4e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  30.73 
 
 		 713 aa  159  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2272  type II secretory pathway protein  31.02 
 
 		 496 aa  124  9e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2363  glycogen debranching enzyme GlgX  26.9 
 
 		 701 aa  117  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0149674 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  24.94 
 
 		 711 aa  114  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  23.23 
 
 		 714 aa  110  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  23.24 
 
 		 701 aa  109  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  24.27 
 
 		 727 aa  108  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  22.42 
 
 		 706 aa  107  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0537  glycogen debranching enzyme GlgX  26.15 
 
 		 695 aa  104  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  24.69 
 
 		 721 aa  104  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_19757  predicted protein  23.05 
 
 		 715 aa  103  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.13703  normal  0.0212411 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  23.63 
 
 		 721 aa  103  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01253  glycogen debranching enzyme GlgX  23.92 
 
 		 695 aa  103  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.358953  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13761  putative isoamylase  22.82 
 
 		 689 aa  102  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1601  glycogen debranching protein GlgX  22.03 
 
 		 701 aa  101  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  25.47 
 
 		 709 aa  100  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0212  glycogen operon protein GlgX  24.15 
 
 		 656 aa  100  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182326  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  24.3 
 
 		 700 aa  100  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  23.24 
 
 		 717 aa  99.8  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  25.31 
 
 		 721 aa  98.2  8e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15221  putative isoamylase  20.5 
 
 		 677 aa  98.2  8e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1322  glycogen debranching enzyme GlgX  25.51 
 
 		 733 aa  98.2  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831141  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  22.71 
 
 		 701 aa  97.8  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7550  glycogen debranching enzyme GlgX  24.34 
 
 		 702 aa  97.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317676  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3027  glycogen debranching enzyme GlgX  25.2 
 
 		 733 aa  97.1  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  22.91 
 
 		 1464 aa  97.1  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  22.27 
 
 		 710 aa  97.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>