More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0868 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  52.45 
 
 
1252 aa  834    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  100 
 
 
776 aa  1614    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  33.46 
 
 
874 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  32.47 
 
 
928 aa  319  1e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  30.67 
 
 
848 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  30.67 
 
 
852 aa  302  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  30.39 
 
 
850 aa  300  6e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  30.67 
 
 
852 aa  300  7e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  30.67 
 
 
852 aa  300  7e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  30.58 
 
 
848 aa  299  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  30.53 
 
 
852 aa  299  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  30.03 
 
 
856 aa  295  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  30.67 
 
 
852 aa  293  7e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  30.26 
 
 
2638 aa  291  3e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  30.53 
 
 
852 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  30.7 
 
 
647 aa  290  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  29.68 
 
 
1136 aa  288  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  29.47 
 
 
1043 aa  282  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  30.52 
 
 
655 aa  270  7e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  29.42 
 
 
843 aa  269  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  29.3 
 
 
713 aa  266  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  29.53 
 
 
713 aa  266  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  29.3 
 
 
713 aa  265  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  28.99 
 
 
843 aa  265  3e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  29.51 
 
 
655 aa  263  6e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  29.1 
 
 
713 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  29.26 
 
 
713 aa  263  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  29.11 
 
 
712 aa  262  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  29.37 
 
 
713 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  29.37 
 
 
713 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  30.8 
 
 
718 aa  261  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  28.97 
 
 
713 aa  261  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  30.62 
 
 
640 aa  259  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  29.63 
 
 
1888 aa  258  3e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  28.55 
 
 
713 aa  258  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  28.88 
 
 
842 aa  258  4e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  28.65 
 
 
713 aa  253  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  30.22 
 
 
766 aa  246  9e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  30.38 
 
 
825 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  27.83 
 
 
899 aa  244  7e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  27.63 
 
 
841 aa  242  2e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  29.16 
 
 
640 aa  242  2e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  30.27 
 
 
601 aa  241  2.9999999999999997e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  27.54 
 
 
669 aa  227  5.0000000000000005e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  29.6 
 
 
1064 aa  224  7e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  29.07 
 
 
1064 aa  221  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  25.79 
 
 
1062 aa  201  6e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.07 
 
 
1117 aa  200  9e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.16 
 
 
1176 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  28.06 
 
 
1942 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.35 
 
 
1331 aa  194  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.08 
 
 
946 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.21 
 
 
1855 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.52 
 
 
891 aa  184  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.64 
 
 
1035 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  24.37 
 
 
1975 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  26.53 
 
 
1025 aa  174  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  24.9 
 
 
1329 aa  173  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  27.18 
 
 
1429 aa  171  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  24.73 
 
 
1248 aa  165  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  24.17 
 
 
2156 aa  164  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.93 
 
 
2068 aa  157  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  23.76 
 
 
1328 aa  157  9e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2273  pullulanase  25.65 
 
 
717 aa  156  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  23.26 
 
 
1440 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  23.26 
 
 
1440 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  24.97 
 
 
1891 aa  152  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  23.59 
 
 
1432 aa  152  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  22.78 
 
 
1441 aa  152  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  25.24 
 
 
1472 aa  152  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  26.93 
 
 
693 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  23.08 
 
 
998 aa  145  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3828  glycoside hydrolase family 13 protein  28.41 
 
 
817 aa  144  9e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.535052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  24.32 
 
 
991 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  25.35 
 
 
718 aa  141  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  22.98 
 
 
1450 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  25.96 
 
 
706 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0312  glycosyl hydrolase family protein  27.27 
 
 
666 aa  139  2e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0426975  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  24.9 
 
 
720 aa  139  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  25.96 
 
 
708 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.62 
 
 
1124 aa  138  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  29.8 
 
 
695 aa  137  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  24.73 
 
 
696 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15221  putative isoamylase  24.34 
 
 
677 aa  135  3e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  27.09 
 
 
774 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  29.78 
 
 
729 aa  134  6.999999999999999e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  25.24 
 
 
714 aa  133  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  24.47 
 
 
697 aa  133  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.490165 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  24.65 
 
 
718 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  25.19 
 
 
671 aa  132  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43578  predicted protein  23.16 
 
 
765 aa  132  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0789627  normal  0.106596 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  24.19 
 
 
694 aa  131  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_19757  predicted protein  26.17 
 
 
715 aa  130  8.000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.13703  normal  0.0212411 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15081  putative isoamylase  25.26 
 
 
677 aa  130  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2859  glycogen debranching enzyme GlgX  27.46 
 
 
690 aa  130  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3784  glycogen debranching enzyme GlgX  26.15 
 
 
693 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17491  putative isoamylase  26.57 
 
 
686 aa  128  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3835  glycogen debranching enzyme GlgX  25.59 
 
 
673 aa  127  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.124257  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  27.03 
 
 
700 aa  127  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  29.43 
 
 
738 aa  127  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>