More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2331 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  51.68 
 
 		 1043 aa  684    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  100 
 
 		 647 aa  1340    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  48.17 
 
 		 655 aa  623  1e-177  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  48.51 
 
 		 655 aa  618  1e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  48.9 
 
 		 848 aa  610  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  48.36 
 
 		 850 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  48.27 
 
 		 852 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  47.89 
 
 		 852 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  48.27 
 
 		 852 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  48.27 
 
 		 852 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  48.11 
 
 		 848 aa  595  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  47.96 
 
 		 852 aa  588  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  47.48 
 
 		 852 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  47.42 
 
 		 856 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  45.12 
 
 		 640 aa  534  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  43.16 
 
 		 843 aa  528  1e-148  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  43.61 
 
 		 843 aa  524  1e-147  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  43.19 
 
 		 713 aa  519  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  43.19 
 
 		 713 aa  520  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  43.19 
 
 		 713 aa  519  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  43.35 
 
 		 713 aa  521  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  43.75 
 
 		 713 aa  522  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  43.19 
 
 		 713 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  43.19 
 
 		 713 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  43.04 
 
 		 713 aa  509  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  42.72 
 
 		 713 aa  509  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  42.83 
 
 		 713 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  41.45 
 
 		 842 aa  503  1e-141  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  41.46 
 
 		 712 aa  499  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  41.55 
 
 		 2638 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  42.15 
 
 		 841 aa  491  1e-137  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  40.4 
 
 		 718 aa  486  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  39.73 
 
 		 899 aa  483  1e-135  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  41.12 
 
 		 874 aa  482  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  40.31 
 
 		 1136 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  38.24 
 
 		 1888 aa  460  9.999999999999999e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  41.19 
 
 		 928 aa  436  1e-121  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  38.46 
 
 		 1064 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  38.34 
 
 		 1064 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  37.95 
 
 		 601 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  38.71 
 
 		 825 aa  398  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  35.32 
 
 		 669 aa  381  1e-104  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  36.53 
 
 		 640 aa  373  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  37.29 
 
 		 766 aa  371  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  33.11 
 
 		 1117 aa  352  1e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  31.5 
 
 		 1176 aa  310  5e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  33.33 
 
 		 1062 aa  307  3e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  31.43 
 
 		 1942 aa  302  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  33.39 
 
 		 891 aa  290  6e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  30.7 
 
 		 776 aa  290  8e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  30.21 
 
 		 1025 aa  286  7e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  30.18 
 
 		 991 aa  286  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.71 
 
 		 946 aa  283  6.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  31.45 
 
 		 1432 aa  276  6e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  32.52 
 
 		 2156 aa  273  7e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  32.05 
 
 		 1429 aa  271  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.69 
 
 		 1035 aa  266  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  29.05 
 
 		 1252 aa  264  4e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.09 
 
 		 1855 aa  264  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.8 
 
 		 1331 aa  258  3e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  30.79 
 
 		 998 aa  255  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.05 
 
 		 1248 aa  248  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  30.8 
 
 		 1472 aa  247  4.9999999999999997e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  29.73 
 
 		 1450 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.44 
 
 		 1975 aa  239  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.76 
 
 		 1891 aa  233  8.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  31.38 
 
 		 1441 aa  232  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.34 
 
 		 2068 aa  231  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  30.48 
 
 		 1329 aa  230  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  30.71 
 
 		 1328 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.83 
 
 		 1440 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.83 
 
 		 1440 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  31.16 
 
 		 1124 aa  206  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2273  pullulanase  30.36 
 
 		 717 aa  194  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3828  glycoside hydrolase family 13 protein  27.21 
 
 		 817 aa  183  9.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535052 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  24.73 
 
 		 729 aa  162  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  23.82 
 
 		 718 aa  159  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  24.06 
 
 		 711 aa  153  8e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  25.25 
 
 		 700 aa  152  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  25.21 
 
 		 1464 aa  152  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  24.58 
 
 		 714 aa  151  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  24.81 
 
 		 715 aa  151  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  24.87 
 
 		 671 aa  150  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0893  alpha amylase domain-containing protein  26.41 
 
 		 686 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0763625  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  24.8 
 
 		 706 aa  149  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  24.08 
 
 		 697 aa  149  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17491  putative isoamylase  26.25 
 
 		 686 aa  148  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  24.72 
 
 		 722 aa  147  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  24.29 
 
 		 701 aa  147  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  23.04 
 
 		 724 aa  147  8.000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1812  glycogen debranching enzyme GlgX  24.24 
 
 		 718 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  23.49 
 
 		 705 aa  145  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  23.8 
 
 		 720 aa  144  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  23.14 
 
 		 712 aa  143  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  25.31 
 
 		 711 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  25.31 
 
 		 711 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13830  glycogen debranching enzyme GlgX  24.19 
 
 		 720 aa  141  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844349  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  23.59 
 
 		 706 aa  141  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2413  glycogen debranching enzyme GlgX  25.7 
 
 		 771 aa  141  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.246896  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  23.52 
 
 		 729 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>