More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0421 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  100 
 
 
601 aa  1219    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  48.7 
 
 
928 aa  545  1e-154  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  43.17 
 
 
850 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  44.07 
 
 
852 aa  488  1e-137  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  43.17 
 
 
852 aa  491  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  43.69 
 
 
848 aa  491  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  44.07 
 
 
852 aa  488  1e-137  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  44.07 
 
 
852 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  42.97 
 
 
856 aa  483  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  43.41 
 
 
848 aa  480  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  43.48 
 
 
852 aa  479  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  43.81 
 
 
852 aa  480  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  42.31 
 
 
718 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  41.49 
 
 
1888 aa  464  1e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  42.31 
 
 
713 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  42.31 
 
 
713 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  42.31 
 
 
713 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  42.31 
 
 
713 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  42.31 
 
 
713 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  42 
 
 
713 aa  449  1e-125  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  41.52 
 
 
713 aa  449  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  41.27 
 
 
713 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  42 
 
 
713 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  41.36 
 
 
713 aa  444  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  39.69 
 
 
712 aa  442  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  41.82 
 
 
655 aa  433  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  41.14 
 
 
655 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  37.38 
 
 
1043 aa  422  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  37.95 
 
 
647 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  35.33 
 
 
2638 aa  395  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  36.69 
 
 
843 aa  383  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  37.03 
 
 
843 aa  382  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  36.25 
 
 
640 aa  378  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  36.27 
 
 
766 aa  369  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  35.82 
 
 
825 aa  371  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  38.21 
 
 
842 aa  362  1e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  34 
 
 
899 aa  358  9.999999999999999e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  32.85 
 
 
841 aa  352  1e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  34.68 
 
 
1136 aa  350  6e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  37.74 
 
 
1064 aa  347  2e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  35.95 
 
 
874 aa  345  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  37.31 
 
 
1064 aa  344  2e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  33.48 
 
 
669 aa  333  8e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  38.04 
 
 
640 aa  310  4e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  32.55 
 
 
1117 aa  266  8.999999999999999e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  33.17 
 
 
1062 aa  265  1e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  31.61 
 
 
891 aa  261  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  31.74 
 
 
1176 aa  256  8e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  32.92 
 
 
1942 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  30.27 
 
 
776 aa  241  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.81 
 
 
2156 aa  238  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  29.97 
 
 
1252 aa  236  7e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.71 
 
 
1035 aa  236  8e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  29.93 
 
 
1432 aa  232  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  29.63 
 
 
991 aa  229  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  28.81 
 
 
998 aa  225  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  30.22 
 
 
1450 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  29.55 
 
 
1441 aa  223  7e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  30.22 
 
 
1472 aa  222  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.55 
 
 
1855 aa  222  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  28.76 
 
 
1328 aa  221  3e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3828  glycoside hydrolase family 13 protein  29.23 
 
 
817 aa  220  5e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.535052 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  29.25 
 
 
1329 aa  218  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  29.98 
 
 
1025 aa  217  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  30.02 
 
 
1429 aa  215  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.16 
 
 
1331 aa  206  7e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.83 
 
 
1440 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.83 
 
 
1440 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.25 
 
 
1975 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.5 
 
 
946 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.53 
 
 
1891 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.38 
 
 
2068 aa  193  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.66 
 
 
1248 aa  190  5e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.19 
 
 
1124 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  27.65 
 
 
711 aa  177  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  27.65 
 
 
711 aa  176  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  27.82 
 
 
729 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  29.88 
 
 
774 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  26.31 
 
 
710 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  25.43 
 
 
724 aa  174  5e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  27.55 
 
 
706 aa  173  7.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  28.66 
 
 
714 aa  172  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  29.34 
 
 
721 aa  172  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  26.03 
 
 
712 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  26.42 
 
 
712 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  27.01 
 
 
719 aa  171  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3070  glycogen debranching enzyme GlgX  26.7 
 
 
686 aa  170  8e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0162429 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  25.83 
 
 
712 aa  170  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  28.94 
 
 
720 aa  169  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  28.12 
 
 
693 aa  169  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  28.36 
 
 
1464 aa  169  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  25.71 
 
 
708 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  28.9 
 
 
694 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  28.9 
 
 
694 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  27.9 
 
 
696 aa  167  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  27.96 
 
 
708 aa  167  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  27.9 
 
 
706 aa  167  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  25.84 
 
 
715 aa  166  9e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  24.88 
 
 
722 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  27.62 
 
 
707 aa  166  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>