More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28060 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  53.62 
 
 		 1248 aa  1073    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  44.64 
 
 		 891 aa  717    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  58.13 
 
 		 1891 aa  1945    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  44.49 
 
 		 991 aa  694    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  57.5 
 
 		 1331 aa  1200    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  50.17 
 
 		 1942 aa  787    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  46.44 
 
 		 1117 aa  744    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  52.31 
 
 		 1855 aa  728    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  51.15 
 
 		 1025 aa  917    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  46.93 
 
 		 1176 aa  877    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  58.07 
 
 		 1975 aa  1900    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  47.36 
 
 		 946 aa  761    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  100 
 
 		 2068 aa  4128    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  41.18 
 
 		 1035 aa  623  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  39.4 
 
 		 1329 aa  610  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  39.46 
 
 		 1328 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  39.15 
 
 		 1124 aa  581  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  39.64 
 
 		 2156 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  38.97 
 
 		 1062 aa  573  1e-161  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  37.34 
 
 		 998 aa  564  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  41.53 
 
 		 1017 aa  558  1e-157  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  39.78 
 
 		 1005 aa  560  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  38.25 
 
 		 1441 aa  533  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  36.39 
 
 		 1440 aa  520  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  36.39 
 
 		 1440 aa  520  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  43.44 
 
 		 723 aa  513  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2273  pullulanase  41.84 
 
 		 717 aa  502  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  46.02 
 
 		 925 aa  503  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  36.35 
 
 		 1432 aa  498  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  33.44 
 
 		 1472 aa  458  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  33.58 
 
 		 1450 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  32.55 
 
 		 1429 aa  446  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  42.66 
 
 		 600 aa  436  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  45.76 
 
 		 614 aa  429  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  41.61 
 
 		 609 aa  422  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  44.14 
 
 		 593 aa  414  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  45.63 
 
 		 599 aa  416  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  40.46 
 
 		 622 aa  399  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  42.96 
 
 		 604 aa  395  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  29.28 
 
 		 1043 aa  276  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  28.61 
 
 		 655 aa  261  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  28.43 
 
 		 852 aa  260  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  28.43 
 
 		 850 aa  258  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  28.3 
 
 		 852 aa  256  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  28.16 
 
 		 852 aa  254  9.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  28.16 
 
 		 852 aa  254  9.000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  28.48 
 
 		 655 aa  253  3e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  27.26 
 
 		 848 aa  250  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  30.59 
 
 		 2638 aa  246  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  27.61 
 
 		 1136 aa  245  5e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  27.89 
 
 		 856 aa  243  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  26.87 
 
 		 848 aa  239  6e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  27.75 
 
 		 852 aa  239  6e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  27.08 
 
 		 640 aa  238  9e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  27.73 
 
 		 852 aa  235  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  29.34 
 
 		 647 aa  233  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  28.75 
 
 		 1888 aa  227  2e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  30.8 
 
 		 718 aa  224  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  29.36 
 
 		 825 aa  224  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  32.09 
 
 		 620 aa  220  2e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  26.4 
 
 		 843 aa  219  5.9999999999999996e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  25.62 
 
 		 1064 aa  218  8e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  27.59 
 
 		 874 aa  217  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  25.49 
 
 		 1064 aa  215  7e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  26.98 
 
 		 842 aa  211  8e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  27.91 
 
 		 928 aa  210  2e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  25.67 
 
 		 843 aa  206  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  25.9 
 
 		 713 aa  201  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  26.02 
 
 		 899 aa  201  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  26.18 
 
 		 713 aa  200  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  25.9 
 
 		 713 aa  200  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  25.9 
 
 		 713 aa  200  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  25.76 
 
 		 713 aa  199  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  25.62 
 
 		 713 aa  199  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  28.16 
 
 		 841 aa  196  3e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  26.04 
 
 		 713 aa  196  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  30.13 
 
 		 510 aa  195  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  26.04 
 
 		 713 aa  194  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  28.38 
 
 		 601 aa  193  2.9999999999999997e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  25.79 
 
 		 713 aa  192  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  30.21 
 
 		 838 aa  191  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  28.99 
 
 		 669 aa  189  7e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  29.58 
 
 		 511 aa  187  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  25.48 
 
 		 713 aa  185  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  25.4 
 
 		 712 aa  184  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  27.94 
 
 		 640 aa  184  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  29.76 
 
 		 524 aa  181  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  26.55 
 
 		 766 aa  178  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  35.48 
 
 		 1021 aa  176  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  28.89 
 
 		 564 aa  176  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  30.13 
 
 		 528 aa  174  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  30.31 
 
 		 885 aa  175  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  31.77 
 
 		 528 aa  172  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  29.24 
 
 		 571 aa  171  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  29.94 
 
 		 533 aa  169  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  28.33 
 
 		 462 aa  167  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  25.87 
 
 		 836 aa  161  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  30.96 
 
 		 752 aa  160  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  24.58 
 
 		 1252 aa  159  6e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  27.92 
 
 		 642 aa  159  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>