More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0872 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  100 
 
 
640 aa  1289    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  40.07 
 
 
1043 aa  427  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  39.65 
 
 
852 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  39.83 
 
 
852 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  40.25 
 
 
852 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  39.83 
 
 
852 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  39.83 
 
 
850 aa  415  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  39.48 
 
 
848 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  40.64 
 
 
655 aa  414  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  40.29 
 
 
655 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  41.05 
 
 
843 aa  410  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  39.55 
 
 
848 aa  411  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  40.69 
 
 
843 aa  409  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  39.58 
 
 
841 aa  402  1e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  40.5 
 
 
640 aa  401  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  40.75 
 
 
1136 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  38.1 
 
 
842 aa  398  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  39.37 
 
 
852 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  38.78 
 
 
852 aa  395  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  36.7 
 
 
718 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  40.45 
 
 
899 aa  389  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  37.98 
 
 
856 aa  391  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  40.07 
 
 
1064 aa  389  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  37.78 
 
 
713 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  38.09 
 
 
713 aa  383  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  38.09 
 
 
713 aa  385  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  37.28 
 
 
2638 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  39.9 
 
 
1064 aa  385  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  39.97 
 
 
928 aa  384  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  38.09 
 
 
713 aa  382  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  37.98 
 
 
713 aa  382  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  37.61 
 
 
713 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  38.17 
 
 
713 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  38.09 
 
 
713 aa  382  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  37.82 
 
 
713 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  36.97 
 
 
647 aa  380  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  37.82 
 
 
713 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  39.43 
 
 
825 aa  372  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  36.8 
 
 
1888 aa  354  2.9999999999999997e-96  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  34.25 
 
 
712 aa  350  4e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  36.96 
 
 
874 aa  345  2e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  38.04 
 
 
601 aa  319  1e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  31.83 
 
 
669 aa  312  2e-83  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  34.25 
 
 
766 aa  309  9e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  29.42 
 
 
1252 aa  266  8.999999999999999e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  29.16 
 
 
776 aa  255  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.73 
 
 
1117 aa  245  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.76 
 
 
946 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  27.7 
 
 
1328 aa  223  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.45 
 
 
891 aa  221  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.66 
 
 
1176 aa  216  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  29.16 
 
 
1062 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  27.05 
 
 
1329 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  26.71 
 
 
1942 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.63 
 
 
1035 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  28.09 
 
 
998 aa  209  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  28.24 
 
 
1025 aa  206  8e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3828  glycoside hydrolase family 13 protein  24.77 
 
 
817 aa  202  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.535052 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.26 
 
 
1248 aa  201  5e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.71 
 
 
1855 aa  199  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  26.8 
 
 
1441 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  25.41 
 
 
1450 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  27.04 
 
 
1472 aa  193  7e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.98 
 
 
2156 aa  193  7e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.18 
 
 
1331 aa  191  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.47 
 
 
1891 aa  187  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  26.49 
 
 
991 aa  187  7e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.13 
 
 
2068 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.53 
 
 
1975 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  25.99 
 
 
1432 aa  184  4.0000000000000006e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  27.38 
 
 
706 aa  180  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  27.14 
 
 
1429 aa  176  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  26.72 
 
 
708 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.69 
 
 
1124 aa  173  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_002620  TC0312  glycosyl hydrolase family protein  26.28 
 
 
666 aa  170  8e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0426975  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2273  pullulanase  29.32 
 
 
717 aa  166  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1812  glycogen debranching enzyme GlgX  24.15 
 
 
718 aa  161  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  26.05 
 
 
696 aa  160  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  26.41 
 
 
694 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  26.41 
 
 
694 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  29.05 
 
 
706 aa  157  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  24.92 
 
 
694 aa  156  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  25.45 
 
 
695 aa  156  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  26.35 
 
 
693 aa  156  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2859  glycogen debranching enzyme GlgX  26.57 
 
 
690 aa  155  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3070  glycogen debranching enzyme GlgX  25.54 
 
 
686 aa  153  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0162429 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  26.59 
 
 
705 aa  151  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  26.96 
 
 
774 aa  151  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3784  glycogen debranching enzyme GlgX  24.47 
 
 
693 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_19757  predicted protein  26.38 
 
 
715 aa  145  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.13703  normal  0.0212411 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.65 
 
 
1440 aa  144  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.65 
 
 
1440 aa  144  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1471  glycogen debranching enzyme GlgX  26.78 
 
 
683 aa  143  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  23.14 
 
 
721 aa  142  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  25.79 
 
 
712 aa  142  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  25.43 
 
 
714 aa  139  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  24.07 
 
 
779 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6785  glycogen debranching enzyme GlgX  24.55 
 
 
718 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0893  glycogen debranching enzyme GlgX  26.92 
 
 
693 aa  138  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.409319  normal  0.933748 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  23.55 
 
 
724 aa  137  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>