More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0459 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  50.18 
 
 		 899 aa  828    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  67.7 
 
 		 841 aa  1215    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  72 
 
 		 843 aa  1272    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  100 
 
 		 842 aa  1725    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  72.97 
 
 		 843 aa  1281    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  41.69 
 
 		 852 aa  632  1e-180  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  41.69 
 
 		 852 aa  632  1e-180  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  41.69 
 
 		 850 aa  631  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  41.75 
 
 		 852 aa  627  1e-178  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  41.44 
 
 		 852 aa  627  1e-178  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  41.31 
 
 		 848 aa  626  1e-178  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  41.75 
 
 		 848 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  41.72 
 
 		 856 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  41.9 
 
 		 852 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  41.31 
 
 		 852 aa  600  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  39.28 
 
 		 2638 aa  581  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  46.52 
 
 		 640 aa  545  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  44.12 
 
 		 1043 aa  538  1e-151  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  44.57 
 
 		 655 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  43.19 
 
 		 655 aa  505  1e-141  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  41.45 
 
 		 647 aa  503  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  42.32 
 
 		 1136 aa  500  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  35.78 
 
 		 874 aa  486  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  39.82 
 
 		 713 aa  464  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  40.98 
 
 		 713 aa  462  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  39.68 
 
 		 713 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  39.68 
 
 		 713 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  39.97 
 
 		 713 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  39.68 
 
 		 713 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  40.73 
 
 		 713 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  40.35 
 
 		 713 aa  456  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  35.8 
 
 		 1064 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  35.91 
 
 		 1064 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  40.19 
 
 		 713 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  39.78 
 
 		 718 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  40.03 
 
 		 713 aa  449  1.0000000000000001e-124  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  39.28 
 
 		 712 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  39.8 
 
 		 825 aa  421  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  33.18 
 
 		 1888 aa  420  1e-116  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  35.17 
 
 		 928 aa  390  1e-107  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  38.1 
 
 		 640 aa  392  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  38.21 
 
 		 601 aa  362  2e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  33.63 
 
 		 669 aa  335  2e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.2 
 
 		 1117 aa  335  2e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  33.33 
 
 		 766 aa  318  2e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  27.21 
 
 		 1942 aa  287  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.37 
 
 		 1176 aa  280  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  24.82 
 
 		 991 aa  267  7e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  28.59 
 
 		 1025 aa  263  6.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  27.47 
 
 		 1450 aa  263  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.11 
 
 		 1035 aa  263  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  25.87 
 
 		 1062 aa  259  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  28.88 
 
 		 776 aa  258  5e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.57 
 
 		 2156 aa  257  6e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.72 
 
 		 891 aa  255  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  27.21 
 
 		 1432 aa  255  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.72 
 
 		 1855 aa  250  7e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  28.12 
 
 		 1329 aa  249  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  29.05 
 
 		 1429 aa  245  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.97 
 
 		 946 aa  245  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  26.8 
 
 		 998 aa  243  9e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  27.07 
 
 		 1441 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  29.55 
 
 		 1472 aa  239  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  26.6 
 
 		 1328 aa  235  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.02 
 
 		 1891 aa  226  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  27.26 
 
 		 1252 aa  224  4.9999999999999996e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.75 
 
 		 1331 aa  223  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.84 
 
 		 2068 aa  208  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.53 
 
 		 1248 aa  207  5e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.02 
 
 		 1975 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.34 
 
 		 1440 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.34 
 
 		 1440 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  31.45 
 
 		 1124 aa  194  6e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  27.57 
 
 		 706 aa  177  5e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3828  glycoside hydrolase family 13 protein  27.56 
 
 		 817 aa  177  8e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535052 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  27.68 
 
 		 706 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0312  glycosyl hydrolase family protein  26.53 
 
 		 666 aa  172  3e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0426975  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  27.35 
 
 		 708 aa  172  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  27.6 
 
 		 693 aa  170  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  24.92 
 
 		 694 aa  170  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  26.28 
 
 		 671 aa  170  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  25.55 
 
 		 718 aa  169  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  28.16 
 
 		 729 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  25.14 
 
 		 697 aa  169  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  26.9 
 
 		 696 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  28.98 
 
 		 774 aa  165  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  26.14 
 
 		 694 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  26.14 
 
 		 694 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2273  pullulanase  31.48 
 
 		 717 aa  164  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  23.83 
 
 		 724 aa  163  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  30.25 
 
 		 718 aa  163  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2413  glycogen debranching enzyme GlgX  25.63 
 
 		 771 aa  161  6e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.246896  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0893  glycogen debranching enzyme GlgX  26.43 
 
 		 693 aa  160  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.409319  normal  0.933748 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  28.03 
 
 		 712 aa  160  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  24.32 
 
 		 721 aa  159  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0733  glycogen debranching enzyme GlgX  25.34 
 
 		 704 aa  159  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1247  glycoside hydrolase family 13 protein  27.04 
 
 		 703 aa  158  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4442  glycogen debranching enzyme GlgX  25.65 
 
 		 723 aa  157  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2859  glycogen debranching enzyme GlgX  25.67 
 
 		 690 aa  157  6e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  26.27 
 
 		 714 aa  157  9e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>