More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0733 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0857  glycogen debranching enzyme GlgX  75.53 
 
 		 703 aa  1116    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0733  glycogen debranching enzyme GlgX  100 
 
 		 704 aa  1454    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1726  glycogen debranching enzyme GlgX  42.82 
 
 		 748 aa  557  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1306  glycogen debranching enzyme GlgX  46.36 
 
 		 720 aa  545  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.348446 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  45.94 
 
 		 730 aa  540  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10400  glycogen debranching enzyme GlgX  54.39 
 
 		 822 aa  534  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  42.94 
 
 		 713 aa  530  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  43.73 
 
 		 712 aa  529  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  45.03 
 
 		 691 aa  524  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  42.88 
 
 		 720 aa  520  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  45.96 
 
 		 720 aa  520  1e-146  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7031  glycogen debranching protein GlgX  43.67 
 
 		 708 aa  519  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  43.76 
 
 		 715 aa  521  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  43.66 
 
 		 711 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1345  glycogen debranching enzyme GlgX  50 
 
 		 756 aa  518  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  48.4 
 
 		 703 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1973  glycogen debranching enzyme GlgX  44.36 
 
 		 721 aa  516  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0990735  hitchhiker  0.000349089 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2413  glycogen debranching enzyme GlgX  52.44 
 
 		 771 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.246896  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2983  glycogen debranching enzyme GlgX  44.22 
 
 		 718 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602894  normal  0.0199459 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  47.03 
 
 		 707 aa  515  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0537  glycogen debranching enzyme GlgX  42.33 
 
 		 695 aa  513  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  44.68 
 
 		 701 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5488  glycogen debranching enzyme GlgX  43.07 
 
 		 708 aa  514  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.168137  decreased coverage  0.0000616357 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  42.9 
 
 		 723 aa  514  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4049  glycogen debranching enzyme GlgX  42.94 
 
 		 766 aa  511  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.928409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3835  glycogen debranching enzyme GlgX  45.71 
 
 		 673 aa  509  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.124257  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0238  glycogen operon protein GlgX  43.08 
 
 		 754 aa  511  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137822  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  48.15 
 
 		 701 aa  511  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  40.32 
 
 		 720 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  43.36 
 
 		 706 aa  511  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  40.61 
 
 		 729 aa  512  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4097  glycogen debranching enzyme GlgX  45.45 
 
 		 709 aa  509  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  40.32 
 
 		 722 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19030  glycogen debranching enzyme GlgX  44.84 
 
 		 747 aa  510  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  43.86 
 
 		 721 aa  509  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  45.6 
 
 		 704 aa  511  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3936  glycogen debranching enzyme GlgX  42.94 
 
 		 766 aa  511  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659462  normal  0.365741 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  46.4 
 
 		 700 aa  509  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  40.32 
 
 		 720 aa  510  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  40.51 
 
 		 727 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2978  glycogen debranching enzyme GlgX  43.99 
 
 		 850 aa  505  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  43.23 
 
 		 718 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2795  glycogen debranching enzyme GlgX  44.09 
 
 		 779 aa  507  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0466072  decreased coverage  0.00000490674 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6085  glycogen debranching enzyme GlgX  42.98 
 
 		 705 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0291933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  42.38 
 
 		 751 aa  505  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  43.64 
 
 		 714 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  40.19 
 
 		 727 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  42.7 
 
 		 715 aa  503  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  43.01 
 
 		 712 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  40.13 
 
 		 733 aa  502  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  42.06 
 
 		 712 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  43.41 
 
 		 721 aa  504  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  40.97 
 
 		 727 aa  503  1e-141  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1333  glycogen debranching protein GlgX  42.69 
 
 		 705 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0242466  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  44.09 
 
 		 711 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6824  glycogen debranching enzyme GlgX  42.38 
 
 		 739 aa  504  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6496  glycogen debranching enzyme GlgX  42.69 
 
 		 705 aa  502  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0828061  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  43.11 
 
 		 712 aa  505  1e-141  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  44.06 
 
 		 706 aa  500  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  41.75 
 
 		 719 aa  500  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  46.55 
 
 		 1537 aa  499  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6323  glycogen debranching enzyme GlgX  44.1 
 
 		 704 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431119  normal  0.149748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  43.19 
 
 		 701 aa  499  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  42.06 
 
 		 712 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  43.36 
 
 		 719 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  43.93 
 
 		 709 aa  501  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5593  glycogen debranching enzyme GlgX  44.1 
 
 		 704 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13830  glycogen debranching enzyme GlgX  42.69 
 
 		 720 aa  497  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844349  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  43.78 
 
 		 720 aa  496  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5114  glycogen debranching enzyme GlgX  42.57 
 
 		 708 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.84007  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  42.86 
 
 		 714 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  42.22 
 
 		 710 aa  499  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  40.43 
 
 		 757 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  42.86 
 
 		 714 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  41.03 
 
 		 1464 aa  498  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  41.19 
 
 		 723 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0269  glycogen debranching enzyme GlgX  44.7 
 
 		 733 aa  498  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.537346  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  42.86 
 
 		 714 aa  497  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  42.21 
 
 		 755 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  44.17 
 
 		 708 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  42.66 
 
 		 701 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1350  glycogen debranching protein GlgX  45.85 
 
 		 776 aa  495  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  41.13 
 
 		 717 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  40.81 
 
 		 779 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1101  glycogen debranching enzyme GlgX  43.65 
 
 		 738 aa  494  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.429589  hitchhiker  0.00127607 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  46.49 
 
 		 721 aa  494  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1112  glycogen debranching enzyme GlgX  42.96 
 
 		 688 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758297  normal  0.439261 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  41.09 
 
 		 704 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  41.64 
 
 		 706 aa  493  9.999999999999999e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1103  glycogen debranching enzyme GlgX  42.86 
 
 		 695 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.512458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  40.93 
 
 		 755 aa  491  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  40.57 
 
 		 717 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2449  putative glycosyl hydrolase  42.67 
 
 		 688 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  42.44 
 
 		 711 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  40.79 
 
 		 758 aa  489  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1189  glycogen debranching protein GlgX  40.58 
 
 		 688 aa  489  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.50354  normal  0.29921 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2864  putative glycogen operon protein GlgX  41.79 
 
 		 739 aa  491  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3213  glycogen debranching protein GlgX  40 
 
 		 728 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  42.75 
 
 		 745 aa  491  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  42.79 
 
 		 720 aa  489  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>