More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2978 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2978  glycogen debranching enzyme GlgX  100 
 
 		 850 aa  1754    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  55.94 
 
 		 711 aa  650    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  53.17 
 
 		 712 aa  656    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  60.39 
 
 		 722 aa  699    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4097  glycogen debranching enzyme GlgX  57.34 
 
 		 709 aa  679    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  59.06 
 
 		 720 aa  666    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  71.25 
 
 		 714 aa  827    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5114  glycogen debranching enzyme GlgX  69.62 
 
 		 708 aa  824    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.84007  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  76.2 
 
 		 720 aa  928    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2700  glycogen debranching enzyme GlgX  59.29 
 
 		 845 aa  674    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  62.48 
 
 		 707 aa  741    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  69.06 
 
 		 718 aa  823    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  61.38 
 
 		 726 aa  746    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1601  glycogen debranching protein GlgX  67.54 
 
 		 701 aa  770    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  63.79 
 
 		 706 aa  795    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  56.82 
 
 		 712 aa  640    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  63.11 
 
 		 720 aa  742    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  75.51 
 
 		 715 aa  925    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  54.45 
 
 		 711 aa  637    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1973  glycogen debranching enzyme GlgX  65.73 
 
 		 721 aa  793    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0990735  hitchhiker  0.000349089 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  58.07 
 
 		 722 aa  687    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  63.13 
 
 		 701 aa  750    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2795  glycogen debranching enzyme GlgX  68.1 
 
 		 779 aa  806    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0466072  decreased coverage  0.00000490674 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  53.08 
 
 		 712 aa  654    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1350  glycogen debranching protein GlgX  61.64 
 
 		 776 aa  795    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13830  glycogen debranching enzyme GlgX  65.29 
 
 		 720 aa  772    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844349  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  67 
 
 		 720 aa  834    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  53.5 
 
 		 712 aa  661    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  55.13 
 
 		 721 aa  662    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  60.65 
 
 		 706 aa  749    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  67.87 
 
 		 701 aa  790    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  56.14 
 
 		 710 aa  650    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  59.3 
 
 		 727 aa  690    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  54.33 
 
 		 710 aa  747    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  76.2 
 
 		 722 aa  929    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  71.08 
 
 		 714 aa  826    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  62.05 
 
 		 715 aa  744    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  68.55 
 
 		 730 aa  825    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  58.39 
 
 		 709 aa  714    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  61.45 
 
 		 707 aa  730    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  66.5 
 
 		 713 aa  805    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  57.22 
 
 		 717 aa  648    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  57.95 
 
 		 708 aa  754    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  60.34 
 
 		 709 aa  702    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2010  glycogen debranching enzyme GlgX  56.12 
 
 		 788 aa  650    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.680457 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  68.1 
 
 		 751 aa  829    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  58.48 
 
 		 711 aa  701    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  76.01 
 
 		 721 aa  933    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  67.99 
 
 		 752 aa  825    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  53.97 
 
 		 700 aa  637    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  68.21 
 
 		 712 aa  839    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  58.48 
 
 		 711 aa  700    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  64.48 
 
 		 721 aa  775    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0269  glycogen debranching enzyme GlgX  67.18 
 
 		 733 aa  789    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.537346  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  69.95 
 
 		 704 aa  822    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  76.2 
 
 		 720 aa  928    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  71.08 
 
 		 714 aa  826    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  68.27 
 
 		 706 aa  771    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  64.11 
 
 		 1537 aa  799    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  76.37 
 
 		 714 aa  932    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  69.58 
 
 		 723 aa  835    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  66.78 
 
 		 703 aa  752    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  53.09 
 
 		 755 aa  626  1e-178  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  52.92 
 
 		 758 aa  625  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  58.48 
 
 		 727 aa  624  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  52.92 
 
 		 758 aa  625  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  52.46 
 
 		 738 aa  620  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  51.37 
 
 		 718 aa  618  1e-175  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0505  glycogen debranching protein GlgX  53.28 
 
 		 714 aa  617  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299874  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  52.76 
 
 		 755 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  52.2 
 
 		 779 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  52.41 
 
 		 745 aa  615  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  56.04 
 
 		 719 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  53.55 
 
 		 701 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  53.02 
 
 		 757 aa  611  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  52.24 
 
 		 756 aa  608  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  51.18 
 
 		 733 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  51.93 
 
 		 738 aa  612  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  53.77 
 
 		 708 aa  611  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  52.56 
 
 		 1464 aa  608  9.999999999999999e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  51.64 
 
 		 719 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  53.23 
 
 		 729 aa  600  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  50.7 
 
 		 723 aa  599  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  51.92 
 
 		 716 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3037  glycogen debranching enzyme GlgX  50 
 
 		 730 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3083  glycogen debranching enzyme GlgX  50.5 
 
 		 730 aa  598  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3835  glycogen debranching enzyme GlgX  55.03 
 
 		 673 aa  596  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.124257  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  51.3 
 
 		 720 aa  597  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  53.85 
 
 		 691 aa  596  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  53.19 
 
 		 716 aa  595  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3213  glycogen debranching protein GlgX  50.76 
 
 		 728 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  48.85 
 
 		 717 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  48.68 
 
 		 727 aa  581  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  48.68 
 
 		 717 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3733  glycogen debranching enzyme GlgX  50.42 
 
 		 733 aa  582  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.635331  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  49.21 
 
 		 717 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  51.81 
 
 		 720 aa  581  1e-164  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1782  glycogen debranching enzyme GlgX  51.83 
 
 		 688 aa  579  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  50.7 
 
 		 704 aa  581  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  49.03 
 
 		 717 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>