More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1726 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1726  glycogen debranching enzyme GlgX  100 
 
 		 748 aa  1519    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2413  glycogen debranching enzyme GlgX  56.88 
 
 		 771 aa  782    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.246896  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10400  glycogen debranching enzyme GlgX  63.65 
 
 		 822 aa  735    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1306  glycogen debranching enzyme GlgX  52.05 
 
 		 720 aa  649    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.348446 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1101  glycogen debranching enzyme GlgX  57.35 
 
 		 738 aa  775    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.429589  hitchhiker  0.00127607 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1345  glycogen debranching enzyme GlgX  56.1 
 
 		 756 aa  709    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  47.44 
 
 		 720 aa  592  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  47.51 
 
 		 721 aa  587  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  46.63 
 
 		 738 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  46.05 
 
 		 717 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  45.91 
 
 		 717 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  46.6 
 
 		 701 aa  579  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  46.13 
 
 		 717 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  46.05 
 
 		 717 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  46.63 
 
 		 738 aa  582  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4097  glycogen debranching enzyme GlgX  48.3 
 
 		 709 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  48.07 
 
 		 719 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  46.72 
 
 		 716 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  46.87 
 
 		 716 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  45.4 
 
 		 727 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  45.4 
 
 		 727 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  44.95 
 
 		 701 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  47.31 
 
 		 700 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  45.7 
 
 		 704 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  46.99 
 
 		 707 aa  570  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  45.73 
 
 		 712 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19030  glycogen debranching enzyme GlgX  48.67 
 
 		 747 aa  568  1e-160  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  44.01 
 
 		 710 aa  561  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  45.83 
 
 		 755 aa  561  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  45.19 
 
 		 719 aa  560  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  44.76 
 
 		 712 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  45.38 
 
 		 720 aa  559  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  44.73 
 
 		 691 aa  559  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  46.09 
 
 		 723 aa  562  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  45.32 
 
 		 712 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  45.97 
 
 		 779 aa  556  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  46.12 
 
 		 758 aa  556  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  44.72 
 
 		 729 aa  558  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  45.06 
 
 		 733 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  46.12 
 
 		 758 aa  556  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6824  glycogen debranching enzyme GlgX  45.82 
 
 		 739 aa  558  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0733  glycogen debranching enzyme GlgX  42.82 
 
 		 704 aa  557  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1812  glycogen debranching enzyme GlgX  45.9 
 
 		 718 aa  556  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  41.37 
 
 		 733 aa  556  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0238  glycogen operon protein GlgX  46.36 
 
 		 754 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137822  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4049  glycogen debranching enzyme GlgX  45.57 
 
 		 766 aa  552  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.928409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  43.15 
 
 		 721 aa  553  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6085  glycogen debranching enzyme GlgX  46.06 
 
 		 705 aa  555  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0291933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  44.08 
 
 		 719 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  44.88 
 
 		 756 aa  552  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2864  putative glycogen operon protein GlgX  45.68 
 
 		 739 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1333  glycogen debranching protein GlgX  45.77 
 
 		 705 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0242466  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3936  glycogen debranching enzyme GlgX  45.57 
 
 		 766 aa  552  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659462  normal  0.365741 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6496  glycogen debranching enzyme GlgX  45.77 
 
 		 705 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0828061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  44.55 
 
 		 711 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  44.38 
 
 		 711 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0543  glycogen debranching enzyme GlgX  45.68 
 
 		 704 aa  549  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0247855  normal  0.604467 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  46.01 
 
 		 720 aa  549  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  46.32 
 
 		 727 aa  549  1e-155  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1695  pullulanase-like glycosidase  42.34 
 
 		 846 aa  550  1e-155  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.195322  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0857  glycogen debranching enzyme GlgX  43.59 
 
 		 703 aa  550  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1332  glycogen debranching enzyme GlgX  42.9 
 
 		 733 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1189  glycogen debranching protein GlgX  41.04 
 
 		 688 aa  546  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.50354  normal  0.29921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3213  glycogen debranching protein GlgX  45.04 
 
 		 728 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3027  glycogen debranching enzyme GlgX  42.9 
 
 		 733 aa  548  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  42.9 
 
 		 733 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1322  glycogen debranching enzyme GlgX  42.76 
 
 		 733 aa  548  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831141  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  45.2 
 
 		 757 aa  543  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5488  glycogen debranching enzyme GlgX  46.08 
 
 		 708 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.168137  decreased coverage  0.0000616357 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  45.34 
 
 		 720 aa  543  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3665  glycogen debranching protein GlgX  45.17 
 
 		 830 aa  545  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  40.87 
 
 		 720 aa  543  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  43.22 
 
 		 712 aa  543  1e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0269  glycogen debranching enzyme GlgX  44.19 
 
 		 733 aa  545  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.537346  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7031  glycogen debranching protein GlgX  45.58 
 
 		 708 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  44.23 
 
 		 755 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3733  glycogen debranching enzyme GlgX  44.48 
 
 		 733 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.635331  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  41.63 
 
 		 706 aa  539  9.999999999999999e-153  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1249  glycogen debranching enzyme GlgX  40.16 
 
 		 735 aa  538  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  43.21 
 
 		 722 aa  536  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2757  glycogen debranching enzyme GlgX  40.83 
 
 		 752 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2933  glycogen debranching enzyme GlgX  40.96 
 
 		 752 aa  536  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6785  glycogen debranching enzyme GlgX  42.16 
 
 		 718 aa  535  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  40.11 
 
 		 726 aa  532  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1112  glycogen debranching enzyme GlgX  44.41 
 
 		 688 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758297  normal  0.439261 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2449  putative glycosyl hydrolase  44.56 
 
 		 688 aa  535  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  44.17 
 
 		 718 aa  531  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  44.49 
 
 		 706 aa  530  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5877  glycogen debranching enzyme GlgX  41.31 
 
 		 718 aa  529  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  42.9 
 
 		 701 aa  530  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6323  glycogen debranching enzyme GlgX  47.04 
 
 		 704 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431119  normal  0.149748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  44.2 
 
 		 745 aa  531  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  42.68 
 
 		 716 aa  530  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  42.76 
 
 		 710 aa  531  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3793  glycogen debranching enzyme GlgX  42.36 
 
 		 717 aa  531  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97477 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  44.13 
 
 		 717 aa  531  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  42.14 
 
 		 707 aa  530  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2835  glycogen debranching enzyme GlgX  40.57 
 
 		 752 aa  532  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  40.52 
 
 		 710 aa  530  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1782  glycogen debranching enzyme GlgX  44.27 
 
 		 688 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>