More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_19550 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  100 
 
 
874 aa  1800    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  37.98 
 
 
852 aa  544  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  38.01 
 
 
850 aa  544  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  37.44 
 
 
852 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  37.44 
 
 
852 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  37.56 
 
 
852 aa  538  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  37.76 
 
 
848 aa  538  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  37.26 
 
 
843 aa  533  1e-150  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  37.71 
 
 
843 aa  535  1e-150  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  37.21 
 
 
848 aa  526  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  37.21 
 
 
856 aa  520  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  37.1 
 
 
852 aa  522  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  36.99 
 
 
852 aa  515  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  36.72 
 
 
899 aa  498  1e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  38.92 
 
 
1043 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  42.2 
 
 
640 aa  494  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  35.37 
 
 
842 aa  491  1e-137  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  41.27 
 
 
647 aa  486  1e-136  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  34.4 
 
 
841 aa  478  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  39.42 
 
 
655 aa  473  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  39.33 
 
 
655 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  38.07 
 
 
1136 aa  452  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  34.16 
 
 
2638 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  33.81 
 
 
1888 aa  437  1e-121  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  37.85 
 
 
713 aa  436  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  37.85 
 
 
713 aa  434  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  37.85 
 
 
713 aa  434  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  37.85 
 
 
713 aa  436  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  37.57 
 
 
713 aa  433  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  37.29 
 
 
713 aa  428  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  36.88 
 
 
713 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  37.21 
 
 
713 aa  425  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  36.89 
 
 
713 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  36.38 
 
 
718 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  36.88 
 
 
713 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  37.22 
 
 
825 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  35.04 
 
 
712 aa  395  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  34.34 
 
 
928 aa  390  1e-107  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  33.66 
 
 
776 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.77 
 
 
1117 aa  385  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  35.65 
 
 
1064 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  36.09 
 
 
1064 aa  379  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  30.56 
 
 
1252 aa  369  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  34.93 
 
 
601 aa  347  8e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  29.95 
 
 
1942 aa  338  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  36.96 
 
 
640 aa  336  1e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  28.03 
 
 
991 aa  331  4e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  33.92 
 
 
766 aa  319  1e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.12 
 
 
1035 aa  311  4e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  33.28 
 
 
669 aa  298  2e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.14 
 
 
1855 aa  295  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  30.83 
 
 
1062 aa  290  1e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.72 
 
 
1176 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.37 
 
 
946 aa  282  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  30.46 
 
 
1025 aa  280  8e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.97 
 
 
891 aa  279  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  25.58 
 
 
1328 aa  274  5.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.78 
 
 
2156 aa  269  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  26.45 
 
 
1329 aa  259  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  28.57 
 
 
1441 aa  258  5e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  28.18 
 
 
1472 aa  250  6e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  28.53 
 
 
1432 aa  251  6e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.88 
 
 
1331 aa  248  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  27.59 
 
 
1429 aa  248  4.9999999999999997e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  26.47 
 
 
998 aa  246  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.7 
 
 
1975 aa  239  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.85 
 
 
1440 aa  232  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.85 
 
 
1440 aa  232  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  27.9 
 
 
1450 aa  228  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  31.24 
 
 
1124 aa  227  6e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.17 
 
 
1891 aa  226  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.56 
 
 
1248 aa  224  4.9999999999999996e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  30.08 
 
 
706 aa  221  7e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  29.59 
 
 
708 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3828  glycoside hydrolase family 13 protein  29.86 
 
 
817 aa  214  7e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.535052 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.19 
 
 
2068 aa  213  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  29.54 
 
 
693 aa  211  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  28.85 
 
 
696 aa  207  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  29.65 
 
 
729 aa  206  1e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  29.05 
 
 
694 aa  204  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  29.05 
 
 
694 aa  204  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  29.34 
 
 
694 aa  199  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2273  pullulanase  29.65 
 
 
717 aa  197  6e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3784  glycogen debranching enzyme GlgX  26.43 
 
 
693 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  28.48 
 
 
705 aa  188  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2859  glycogen debranching enzyme GlgX  28.34 
 
 
690 aa  187  7e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  28.34 
 
 
695 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  27.1 
 
 
724 aa  185  3e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  27.64 
 
 
714 aa  184  5.0000000000000004e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0893  alpha amylase domain-containing protein  27.72 
 
 
686 aa  184  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0763625  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17491  putative isoamylase  27.56 
 
 
686 aa  184  6e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3070  glycogen debranching enzyme GlgX  28.57 
 
 
686 aa  180  9e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0162429 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  27.91 
 
 
708 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1812  glycogen debranching enzyme GlgX  27.96 
 
 
718 aa  179  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  27.61 
 
 
697 aa  177  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  30.43 
 
 
774 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  27.32 
 
 
718 aa  177  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  27.1 
 
 
706 aa  176  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  27.18 
 
 
718 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2094  alpha amylase domain-containing protein  28.42 
 
 
701 aa  175  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.159475  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>