More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0312 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0312  glycosyl hydrolase family protein  100 
 
 		 666 aa  1386    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0426975  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4442  glycogen debranching enzyme GlgX  40.17 
 
 		 723 aa  466  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  43.48 
 
 		 706 aa  462  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_19757  predicted protein  40.64 
 
 		 715 aa  460  9.999999999999999e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.13703  normal  0.0212411 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  42.45 
 
 		 724 aa  457  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  42.81 
 
 		 721 aa  457  1e-127  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3784  glycogen debranching enzyme GlgX  43.77 
 
 		 693 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  41.94 
 
 		 706 aa  444  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  40.46 
 
 		 694 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  40.98 
 
 		 694 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  40.98 
 
 		 694 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  41.61 
 
 		 708 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  38.87 
 
 		 729 aa  438  1e-121  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  38.82 
 
 		 705 aa  438  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43578  predicted protein  38.62 
 
 		 765 aa  429  1e-119  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0789627  normal  0.106596 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  39.97 
 
 		 718 aa  430  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  38.7 
 
 		 714 aa  426  1e-118  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  40.63 
 
 		 696 aa  425  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  37.68 
 
 		 695 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  40.38 
 
 		 697 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  42.38 
 
 		 693 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  40.89 
 
 		 712 aa  411  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2859  glycogen debranching enzyme GlgX  41.59 
 
 		 690 aa  410  1e-113  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  41.42 
 
 		 708 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0893  glycogen debranching enzyme GlgX  42.3 
 
 		 693 aa  411  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.409319  normal  0.933748 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  39.73 
 
 		 719 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3070  glycogen debranching enzyme GlgX  39.69 
 
 		 686 aa  402  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0162429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  39.26 
 
 		 721 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  37.99 
 
 		 712 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  39.47 
 
 		 751 aa  396  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  38.21 
 
 		 774 aa  394  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  37.1 
 
 		 671 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  39.56 
 
 		 711 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  40.26 
 
 		 720 aa  395  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  39.13 
 
 		 752 aa  394  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  36.73 
 
 		 726 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  39.58 
 
 		 721 aa  392  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  38.1 
 
 		 712 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  36.02 
 
 		 710 aa  390  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05691  putative isoamylase  38.61 
 
 		 704 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  39.18 
 
 		 711 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  39.18 
 
 		 711 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  40.41 
 
 		 704 aa  388  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  36.52 
 
 		 711 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0577  alpha amylase domain-containing protein  38.29 
 
 		 692 aa  386  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  38.73 
 
 		 727 aa  388  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  39.12 
 
 		 707 aa  386  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  38.34 
 
 		 712 aa  387  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  40.77 
 
 		 701 aa  386  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  39.42 
 
 		 718 aa  383  1e-105  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  39.01 
 
 		 708 aa  382  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  38.96 
 
 		 722 aa  385  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  40.9 
 
 		 721 aa  385  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  37.01 
 
 		 712 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  38.95 
 
 		 710 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  38.16 
 
 		 709 aa  385  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1350  glycogen debranching protein GlgX  38.75 
 
 		 776 aa  380  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2795  glycogen debranching enzyme GlgX  39.1 
 
 		 779 aa  381  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0466072  decreased coverage  0.00000490674 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  38.94 
 
 		 715 aa  381  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2700  glycogen debranching enzyme GlgX  39.28 
 
 		 845 aa  378  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1637  glycogen debranching enzyme GlgX  37.34 
 
 		 691 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  38.31 
 
 		 720 aa  379  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3083  glycogen debranching enzyme GlgX  36.15 
 
 		 730 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2983  glycogen debranching enzyme GlgX  36.76 
 
 		 718 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602894  normal  0.0199459 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  37.36 
 
 		 715 aa  375  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  38.97 
 
 		 707 aa  372  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  41.24 
 
 		 706 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2094  alpha amylase domain-containing protein  38.55 
 
 		 701 aa  373  1e-102  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.159475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  39.54 
 
 		 701 aa  373  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  36.04 
 
 		 729 aa  373  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  39.23 
 
 		 714 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3037  glycogen debranching enzyme GlgX  35.73 
 
 		 730 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13761  putative isoamylase  34.78 
 
 		 689 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  38.06 
 
 		 727 aa  373  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  39.23 
 
 		 714 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5114  glycogen debranching enzyme GlgX  35.44 
 
 		 708 aa  373  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.84007  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  39.23 
 
 		 714 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  37.8 
 
 		 714 aa  375  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  37.9 
 
 		 1537 aa  375  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13830  glycogen debranching enzyme GlgX  37.76 
 
 		 720 aa  369  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.844349  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  39.66 
 
 		 720 aa  372  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  36.46 
 
 		 730 aa  369  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  39.08 
 
 		 722 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  39.86 
 
 		 706 aa  370  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  36.73 
 
 		 722 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  38.68 
 
 		 706 aa  372  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6785  glycogen debranching enzyme GlgX  36.58 
 
 		 718 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  36.86 
 
 		 720 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1471  glycogen debranching enzyme GlgX  37.67 
 
 		 683 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  38.65 
 
 		 1464 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  38.1 
 
 		 720 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  36.86 
 
 		 720 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  39.06 
 
 		 718 aa  371  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1601  glycogen debranching protein GlgX  39.18 
 
 		 701 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2978  glycogen debranching enzyme GlgX  43.1 
 
 		 850 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  37.38 
 
 		 733 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3835  glycogen debranching enzyme GlgX  36.23 
 
 		 673 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.124257  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  36.54 
 
 		 720 aa  367  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  38.34 
 
 		 717 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5729  glycogen debranching enzyme GlgX  38.61 
 
 		 723 aa  369  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>