More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS2542 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  94.8 
 
 
848 aa  1642    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  100 
 
 
852 aa  1750    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  97.54 
 
 
852 aa  1712    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  97.18 
 
 
850 aa  1707    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  41.06 
 
 
841 aa  637    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  42.12 
 
 
899 aa  647    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  100 
 
 
852 aa  1750    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  94.37 
 
 
852 aa  1640    Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  95.15 
 
 
848 aa  1669    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  98.71 
 
 
852 aa  1733    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  94.84 
 
 
852 aa  1649    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  91.94 
 
 
856 aa  1610    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  45.77 
 
 
1043 aa  639    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  41.69 
 
 
842 aa  632  1e-180  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  42.05 
 
 
843 aa  626  1e-178  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  41.58 
 
 
843 aa  624  1e-177  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  40.95 
 
 
2638 aa  616  1e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  48.27 
 
 
647 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  39.7 
 
 
1888 aa  601  1e-170  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  44.21 
 
 
713 aa  593  1e-168  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  44.21 
 
 
713 aa  595  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  44.07 
 
 
713 aa  593  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  44.07 
 
 
713 aa  593  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  43.03 
 
 
928 aa  594  1e-168  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  44.07 
 
 
713 aa  593  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  44.21 
 
 
713 aa  593  1e-168  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  44.07 
 
 
713 aa  592  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  44.51 
 
 
713 aa  593  1e-168  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  44.07 
 
 
713 aa  591  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  45.16 
 
 
718 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  42.54 
 
 
712 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  43.64 
 
 
713 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  47.53 
 
 
655 aa  573  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  47.44 
 
 
655 aa  570  1e-161  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  46.23 
 
 
640 aa  565  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  37.59 
 
 
874 aa  528  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  40.97 
 
 
1136 aa  504  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  44.07 
 
 
601 aa  488  1e-136  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  39.04 
 
 
1064 aa  481  1e-134  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  38.53 
 
 
1064 aa  473  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  40.72 
 
 
766 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  38.37 
 
 
825 aa  414  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  39.83 
 
 
640 aa  411  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  36.6 
 
 
669 aa  390  1e-107  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.81 
 
 
1117 aa  369  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  26.69 
 
 
991 aa  320  9e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  31.57 
 
 
1176 aa  318  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  29.7 
 
 
1942 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  33.54 
 
 
1062 aa  303  6.000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  30.04 
 
 
1432 aa  303  9e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  30.67 
 
 
776 aa  300  8e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  28.6 
 
 
1252 aa  300  1e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  31.8 
 
 
2156 aa  294  6e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.13 
 
 
1035 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.13 
 
 
891 aa  288  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.11 
 
 
1855 aa  283  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  30.83 
 
 
1025 aa  281  5e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  31.52 
 
 
1429 aa  276  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.99 
 
 
1440 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.99 
 
 
1440 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  31.55 
 
 
1472 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  28.64 
 
 
1450 aa  273  7e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  30.92 
 
 
1329 aa  272  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.15 
 
 
946 aa  272  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  28.8 
 
 
1441 aa  270  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  30.37 
 
 
1328 aa  263  8e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.84 
 
 
1331 aa  263  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  29.78 
 
 
998 aa  262  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.15 
 
 
1975 aa  255  3e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.38 
 
 
1248 aa  253  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.43 
 
 
2068 aa  252  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.74 
 
 
1891 aa  247  6e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  33.56 
 
 
1124 aa  213  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3828  glycoside hydrolase family 13 protein  27.76 
 
 
817 aa  194  8e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.535052 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2273  pullulanase  32.77 
 
 
717 aa  172  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  28.3 
 
 
718 aa  171  6e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  28.98 
 
 
729 aa  169  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  25.91 
 
 
706 aa  169  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2859  glycogen debranching enzyme GlgX  25.08 
 
 
690 aa  165  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17491  putative isoamylase  25.81 
 
 
686 aa  165  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  25.43 
 
 
693 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  25.73 
 
 
708 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  25.46 
 
 
724 aa  164  8.000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0893  alpha amylase domain-containing protein  26.02 
 
 
686 aa  161  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0763625  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0312  glycosyl hydrolase family protein  24.05 
 
 
666 aa  161  5e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0426975  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  23.4 
 
 
700 aa  160  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  23.08 
 
 
671 aa  160  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13761  putative isoamylase  25.63 
 
 
689 aa  156  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  26.15 
 
 
706 aa  155  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  26.04 
 
 
721 aa  155  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1471  glycogen debranching enzyme GlgX  26.04 
 
 
683 aa  155  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  24.63 
 
 
701 aa  155  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  24.49 
 
 
696 aa  155  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  25.68 
 
 
697 aa  154  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  26.19 
 
 
774 aa  153  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  26.4 
 
 
701 aa  153  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2413  glycogen debranching enzyme GlgX  24.53 
 
 
771 aa  152  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.246896  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  24.17 
 
 
710 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0733  glycogen debranching enzyme GlgX  26.15 
 
 
704 aa  153  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1812  glycogen debranching enzyme GlgX  24.96 
 
 
718 aa  153  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>