More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3828 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3828  glycoside hydrolase family 13 protein  100 
 
 		 817 aa  1660    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535052 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  29.23 
 
 		 601 aa  220  7.999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  28.11 
 
 		 1043 aa  216  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  30.13 
 
 		 640 aa  214  3.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  29.86 
 
 		 874 aa  214  5.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  26.5 
 
 		 1064 aa  209  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  27.12 
 
 		 1064 aa  205  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0827  glycogen debranching enzyme GlgX  31.25 
 
 		 705 aa  202  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125239  normal  0.0549007 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  28.66 
 
 		 712 aa  201  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  27.55 
 
 		 928 aa  200  7.999999999999999e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  27.38 
 
 		 843 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  28.36 
 
 		 713 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  31.58 
 
 		 718 aa  197  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  26.8 
 
 		 843 aa  196  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1247  glycoside hydrolase family 13 protein  31.2 
 
 		 703 aa  196  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  29.29 
 
 		 724 aa  194  6e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  27.76 
 
 		 852 aa  194  8e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  27.76 
 
 		 852 aa  194  8e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  27.63 
 
 		 1888 aa  194  8e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  24.77 
 
 		 640 aa  193  9e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  28.21 
 
 		 713 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  28.21 
 
 		 713 aa  193  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  27.75 
 
 		 850 aa  193  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  28.11 
 
 		 706 aa  193  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  25.17 
 
 		 825 aa  193  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  27.91 
 
 		 848 aa  192  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  27.76 
 
 		 852 aa  192  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  27.48 
 
 		 856 aa  192  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  28.09 
 
 		 713 aa  192  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  26.48 
 
 		 852 aa  192  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  26.74 
 
 		 655 aa  192  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  27.85 
 
 		 713 aa  191  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  27.59 
 
 		 713 aa  188  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  27.5 
 
 		 713 aa  187  8e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  27.96 
 
 		 852 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  25.59 
 
 		 655 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  27.37 
 
 		 713 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  27.31 
 
 		 848 aa  185  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  26.41 
 
 		 2638 aa  184  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  27.5 
 
 		 713 aa  184  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  27.5 
 
 		 713 aa  184  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4442  glycogen debranching enzyme GlgX  30.03 
 
 		 723 aa  184  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  27.21 
 
 		 647 aa  183  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  30.58 
 
 		 710 aa  181  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  27.85 
 
 		 669 aa  180  9e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  28.52 
 
 		 694 aa  180  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  28.52 
 
 		 694 aa  180  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2859  glycogen debranching enzyme GlgX  29.49 
 
 		 690 aa  179  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  27.45 
 
 		 852 aa  178  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1471  glycogen debranching enzyme GlgX  28.17 
 
 		 683 aa  177  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  27.56 
 
 		 842 aa  177  7e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  28.76 
 
 		 697 aa  177  8e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  30.84 
 
 		 721 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  29.62 
 
 		 708 aa  176  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  29.69 
 
 		 708 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  29.39 
 
 		 706 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2700  glycogen debranching enzyme GlgX  30.05 
 
 		 845 aa  175  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2933  glycogen debranching enzyme GlgX  29.34 
 
 		 752 aa  174  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  26.33 
 
 		 714 aa  174  7.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  30.15 
 
 		 695 aa  174  7.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  29.02 
 
 		 710 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2757  glycogen debranching enzyme GlgX  28.89 
 
 		 752 aa  172  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0312  glycosyl hydrolase family protein  27.6 
 
 		 666 aa  171  4e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0426975  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2795  glycogen debranching enzyme GlgX  30.42 
 
 		 779 aa  171  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0466072  decreased coverage  0.00000490674 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  28.38 
 
 		 708 aa  171  7e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  27.87 
 
 		 729 aa  169  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  30.11 
 
 		 694 aa  170  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2835  glycogen debranching enzyme GlgX  28.73 
 
 		 752 aa  170  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  30.13 
 
 		 726 aa  169  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  29.23 
 
 		 696 aa  169  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  26.06 
 
 		 1136 aa  168  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3835  glycogen debranching enzyme GlgX  31.26 
 
 		 673 aa  168  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.124257  normal  0.0333658 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3784  glycogen debranching enzyme GlgX  27.82 
 
 		 693 aa  168  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.695286 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  27.54 
 
 		 766 aa  167  5e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  25.31 
 
 		 899 aa  167  8e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  28.57 
 
 		 716 aa  166  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  28.41 
 
 		 841 aa  166  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  31.26 
 
 		 701 aa  166  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  28.5 
 
 		 720 aa  164  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  26.59 
 
 		 718 aa  164  5.0000000000000005e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  28.5 
 
 		 722 aa  164  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  28.5 
 
 		 720 aa  164  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  28.89 
 
 		 693 aa  163  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  30.55 
 
 		 715 aa  163  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1495  glycogen operon protein  28.62 
 
 		 750 aa  162  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43578  predicted protein  27.15 
 
 		 765 aa  162  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0789627  normal  0.106596 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  29.84 
 
 		 752 aa  162  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3070  glycogen debranching enzyme GlgX  26.86 
 
 		 686 aa  162  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0162429 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  30.47 
 
 		 700 aa  162  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  28.11 
 
 		 733 aa  161  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  30.84 
 
 		 711 aa  161  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3037  glycogen debranching enzyme GlgX  27.07 
 
 		 730 aa  160  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  29.67 
 
 		 719 aa  160  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  27.16 
 
 		 707 aa  160  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0733  glycogen debranching enzyme GlgX  28.07 
 
 		 704 aa  160  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  29.64 
 
 		 774 aa  160  8e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  30.25 
 
 		 711 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  30.07 
 
 		 719 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_19757  predicted protein  30.88 
 
 		 715 aa  160  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.13703  normal  0.0212411 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3027  glycogen debranching enzyme GlgX  27.95 
 
 		 733 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>