More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3061 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  39.54 
 
 		 1328 aa  662    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  42.42 
 
 		 1035 aa  660    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  46.28 
 
 		 891 aa  749    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  46.04 
 
 		 1248 aa  734    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  41.99 
 
 		 1124 aa  644    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  39.98 
 
 		 1329 aa  665    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  47.36 
 
 		 2068 aa  733    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  40.6 
 
 		 1062 aa  644    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  46.13 
 
 		 991 aa  763    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  61.19 
 
 		 1942 aa  1102    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  49.89 
 
 		 1331 aa  816    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  100 
 
 		 946 aa  1913    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  53.61 
 
 		 1025 aa  913    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  50.11 
 
 		 1891 aa  782    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  53.01 
 
 		 1176 aa  863    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  51.06 
 
 		 1975 aa  810    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  54.1 
 
 		 1855 aa  796    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  49.73 
 
 		 1117 aa  845    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  41.59 
 
 		 2156 aa  598  1e-169  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  38.56 
 
 		 1440 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  38.56 
 
 		 1440 aa  589  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  37.91 
 
 		 1441 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  35.45 
 
 		 998 aa  561  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  36.71 
 
 		 1432 aa  547  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2273  pullulanase  40.78 
 
 		 717 aa  514  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  34.89 
 
 		 1472 aa  511  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  34.67 
 
 		 1450 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  33.74 
 
 		 1429 aa  492  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  28.63 
 
 		 655 aa  287  5.999999999999999e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  29.69 
 
 		 1136 aa  285  3.0000000000000004e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  28.22 
 
 		 655 aa  284  5.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  29.71 
 
 		 647 aa  283  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  30.68 
 
 		 874 aa  280  8e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  28.24 
 
 		 1043 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  28.38 
 
 		 640 aa  275  4.0000000000000004e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  31.87 
 
 		 848 aa  273  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  30.15 
 
 		 852 aa  272  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  32.27 
 
 		 852 aa  272  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  30.15 
 
 		 852 aa  272  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  30.09 
 
 		 852 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  32.1 
 
 		 850 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  27.2 
 
 		 1064 aa  260  7e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  31.99 
 
 		 848 aa  260  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  27.2 
 
 		 1064 aa  259  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  28.51 
 
 		 843 aa  259  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  27.6 
 
 		 2638 aa  259  2e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  28.93 
 
 		 856 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  28.41 
 
 		 843 aa  253  2e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  31.04 
 
 		 852 aa  251  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  30.7 
 
 		 852 aa  249  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  32.27 
 
 		 1888 aa  248  3e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  26.85 
 
 		 842 aa  245  3e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  26.86 
 
 		 713 aa  235  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  29.09 
 
 		 825 aa  235  4.0000000000000004e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  26.72 
 
 		 713 aa  233  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  26.46 
 
 		 713 aa  233  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  26.72 
 
 		 713 aa  232  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  26.72 
 
 		 713 aa  232  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  27.79 
 
 		 899 aa  232  3e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  26.49 
 
 		 713 aa  231  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  29.63 
 
 		 669 aa  230  1e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  30.76 
 
 		 718 aa  229  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  28.1 
 
 		 640 aa  228  3e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  26.35 
 
 		 713 aa  228  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  26.76 
 
 		 713 aa  226  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  28.25 
 
 		 841 aa  225  4e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  26.36 
 
 		 713 aa  224  8e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  26.39 
 
 		 713 aa  219  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  27.31 
 
 		 712 aa  214  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  27.39 
 
 		 928 aa  214  5.999999999999999e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  29.74 
 
 		 766 aa  202  3e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  27.5 
 
 		 601 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  27.08 
 
 		 776 aa  192  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  26.72 
 
 		 1252 aa  184  5.0000000000000004e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2700  glycogen debranching enzyme GlgX  25.24 
 
 		 845 aa  118  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  27.02 
 
 		 721 aa  113  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  25.85 
 
 		 1537 aa  112  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7550  glycogen debranching enzyme GlgX  26.73 
 
 		 702 aa  110  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317676  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0414  glycogen debranching enzyme GlgX  26.48 
 
 		 693 aa  110  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  25.08 
 
 		 701 aa  109  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  28.39 
 
 		 711 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  28.39 
 
 		 711 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  26.81 
 
 		 700 aa  108  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_19757  predicted protein  25.31 
 
 		 715 aa  108  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.13703  normal  0.0212411 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3828  glycoside hydrolase family 13 protein  28.22 
 
 		 817 aa  107  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535052 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2363  glycogen debranching enzyme GlgX  27.37 
 
 		 701 aa  107  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0149674 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  25 
 
 		 707 aa  107  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  27.25 
 
 		 708 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01253  glycogen debranching enzyme GlgX  25.16 
 
 		 695 aa  107  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.358953  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  25.04 
 
 		 706 aa  106  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4097  glycogen debranching enzyme GlgX  28.65 
 
 		 709 aa  106  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  24.89 
 
 		 695 aa  106  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  27.17 
 
 		 755 aa  106  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  24.4 
 
 		 710 aa  106  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  25.16 
 
 		 720 aa  105  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  25.42 
 
 		 711 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  26.71 
 
 		 779 aa  105  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  26.48 
 
 		 694 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  26.48 
 
 		 694 aa  105  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  26.48 
 
 		 758 aa  104  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>