More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2273 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  49.79 
 
 		 1035 aa  686    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2273  pullulanase  100 
 
 		 717 aa  1495    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  49.93 
 
 		 1328 aa  675    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  48.81 
 
 		 1329 aa  677    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  44.65 
 
 		 1124 aa  598  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  44.02 
 
 		 1440 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  44.02 
 
 		 1440 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  44.05 
 
 		 998 aa  576  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  42.25 
 
 		 1441 aa  567  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  44.52 
 
 		 1117 aa  563  1.0000000000000001e-159  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  44.01 
 
 		 1176 aa  554  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  42.45 
 
 		 1432 aa  550  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  44.57 
 
 		 1942 aa  546  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  42.52 
 
 		 1025 aa  531  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  42.48 
 
 		 891 aa  513  1e-144  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.78 
 
 		 946 aa  514  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  40.14 
 
 		 1450 aa  512  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  42.02 
 
 		 1331 aa  503  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  40.62 
 
 		 1429 aa  503  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.44 
 
 		 1975 aa  496  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  39.55 
 
 		 1472 aa  498  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  41.84 
 
 		 2068 aa  486  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  41.62 
 
 		 1855 aa  486  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.39 
 
 		 1248 aa  483  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.58 
 
 		 1891 aa  481  1e-134  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  38.53 
 
 		 1062 aa  473  1e-132  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  38.58 
 
 		 991 aa  474  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  35.07 
 
 		 2156 aa  398  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  29.37 
 
 		 843 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  29.65 
 
 		 874 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  30.36 
 
 		 647 aa  194  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  27.27 
 
 		 843 aa  194  5e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  35.36 
 
 		 1136 aa  192  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  27.59 
 
 		 928 aa  190  8e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  29.93 
 
 		 1043 aa  190  8e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  33.89 
 
 		 640 aa  183  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  29.19 
 
 		 655 aa  182  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  28.96 
 
 		 655 aa  180  9e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  32.77 
 
 		 848 aa  177  7e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  32.77 
 
 		 852 aa  177  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  32.49 
 
 		 856 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  32.49 
 
 		 850 aa  176  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  32.77 
 
 		 852 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  32.49 
 
 		 852 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  32.49 
 
 		 848 aa  175  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  33.8 
 
 		 1888 aa  174  5e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  24.88 
 
 		 1064 aa  174  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  32.49 
 
 		 852 aa  173  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  32.77 
 
 		 852 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  32.77 
 
 		 852 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  33.89 
 
 		 718 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  32.78 
 
 		 825 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  31.48 
 
 		 842 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  26.83 
 
 		 713 aa  162  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  26.22 
 
 		 713 aa  162  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  29.11 
 
 		 601 aa  160  7e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  26.22 
 
 		 713 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  26.22 
 
 		 713 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  28.27 
 
 		 899 aa  158  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  25.84 
 
 		 713 aa  158  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  33.43 
 
 		 766 aa  156  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  25.65 
 
 		 776 aa  156  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  31.44 
 
 		 841 aa  155  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  29.28 
 
 		 640 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  26.03 
 
 		 713 aa  154  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  26.03 
 
 		 713 aa  154  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  27.61 
 
 		 1252 aa  152  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  30.68 
 
 		 2638 aa  150  9e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  30.17 
 
 		 713 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  28.97 
 
 		 713 aa  147  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  26.38 
 
 		 1064 aa  145  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  30.64 
 
 		 712 aa  145  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  28.81 
 
 		 713 aa  140  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  24.64 
 
 		 669 aa  133  9e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  25.88 
 
 		 693 aa  89.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3828  glycoside hydrolase family 13 protein  25.96 
 
 		 817 aa  89  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535052 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  28.69 
 
 		 700 aa  86.7  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  23.71 
 
 		 711 aa  84.7  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_002620  TC0312  glycosyl hydrolase family protein  25.97 
 
 		 666 aa  84.7  0.000000000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0426975  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1695  pullulanase-like glycosidase  40.77 
 
 		 846 aa  82.4  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.195322  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05691  putative isoamylase  24.44 
 
 		 704 aa  81.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  25.42 
 
 		 727 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  26.35 
 
 		 696 aa  80.1  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  37.1 
 
 		 701 aa  79  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7550  glycogen debranching enzyme GlgX  25.71 
 
 		 702 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317676  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  24.93 
 
 		 708 aa  78.2  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  24.61 
 
 		 729 aa  77.8  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  24.11 
 
 		 711 aa  77.8  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1812  glycogen debranching enzyme GlgX  34.19 
 
 		 718 aa  77.8  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  38.81 
 
 		 717 aa  77.8  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  24.11 
 
 		 711 aa  77.4  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  31.28 
 
 		 706 aa  76.6  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1070  glycogen debranching enzyme GlgX  25.23 
 
 		 802 aa  77  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1895  glycogen debranching enzyme GlgX  37.1 
 
 		 705 aa  76.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1726  glycogen debranching enzyme GlgX  30.29 
 
 		 748 aa  76.3  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  29.77 
 
 		 707 aa  76.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  35.48 
 
 		 708 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  35.48 
 
 		 706 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  23.56 
 
 		 721 aa  75.5  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1462  glycogen debranching enzyme GlgX  26.84 
 
 		 679 aa  75.5  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>