More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01253 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1637  glycogen debranching enzyme GlgX  56.53 
 
 		 691 aa  810    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01253  glycogen debranching enzyme GlgX  100 
 
 		 695 aa  1459    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.358953  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2363  glycogen debranching enzyme GlgX  47.17 
 
 		 701 aa  619  1e-176  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0149674 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  43.49 
 
 		 723 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3027  glycogen debranching enzyme GlgX  42.67 
 
 		 733 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1332  glycogen debranching enzyme GlgX  42.53 
 
 		 733 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  43.38 
 
 		 716 aa  566  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1322  glycogen debranching enzyme GlgX  42.39 
 
 		 733 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831141  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  42.39 
 
 		 733 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  42.08 
 
 		 717 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  42.03 
 
 		 717 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  42.86 
 
 		 738 aa  557  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  42.31 
 
 		 717 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  42.63 
 
 		 755 aa  556  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  42.86 
 
 		 738 aa  558  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  42.03 
 
 		 717 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  42.71 
 
 		 756 aa  555  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  41.81 
 
 		 719 aa  555  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  43.45 
 
 		 757 aa  553  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  42.63 
 
 		 779 aa  555  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  42.35 
 
 		 758 aa  549  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  42.35 
 
 		 758 aa  549  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  40.67 
 
 		 727 aa  547  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  42.48 
 
 		 719 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  42.28 
 
 		 715 aa  545  1e-154  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  42.49 
 
 		 720 aa  546  1e-154  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  41.18 
 
 		 710 aa  547  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  41.07 
 
 		 727 aa  542  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  41.14 
 
 		 733 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  41.19 
 
 		 711 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  40.22 
 
 		 716 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  43.13 
 
 		 720 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  42.66 
 
 		 717 aa  540  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  41.88 
 
 		 745 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  40.22 
 
 		 716 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  42.24 
 
 		 707 aa  538  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  40.79 
 
 		 711 aa  537  1e-151  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1136  glycogen debranching enzyme GlgX  40.75 
 
 		 704 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  43.24 
 
 		 691 aa  536  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1249  glycogen debranching enzyme GlgX  41.16 
 
 		 735 aa  538  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2757  glycogen debranching enzyme GlgX  40 
 
 		 752 aa  537  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2835  glycogen debranching enzyme GlgX  40.24 
 
 		 752 aa  538  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  41.11 
 
 		 710 aa  533  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  40.29 
 
 		 729 aa  534  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2933  glycogen debranching enzyme GlgX  39.6 
 
 		 752 aa  533  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1735  glycogen debranching enzyme GlgX  41.97 
 
 		 691 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1672  glycogen debranching enzyme GlgX  41.67 
 
 		 691 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.574762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1785  glycogen debranching enzyme GlgX  41.81 
 
 		 691 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  40.06 
 
 		 704 aa  530  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1495  glycogen operon protein  40.74 
 
 		 750 aa  531  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  41.93 
 
 		 755 aa  531  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  41.38 
 
 		 704 aa  529  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  40.29 
 
 		 721 aa  529  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  41.08 
 
 		 701 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1607  glycogen debranching enzyme GlgX  41.67 
 
 		 691 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  41.13 
 
 		 708 aa  529  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1462  glycogen debranching enzyme GlgX  44.81 
 
 		 679 aa  528  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  40.9 
 
 		 707 aa  527  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7550  glycogen debranching enzyme GlgX  41.18 
 
 		 702 aa  525  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317676  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  39.78 
 
 		 733 aa  523  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  40.31 
 
 		 712 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  39.44 
 
 		 720 aa  525  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4049  glycogen debranching enzyme GlgX  41.06 
 
 		 766 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.928409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3213  glycogen debranching protein GlgX  40.14 
 
 		 728 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0212  glycogen operon protein GlgX  43.85 
 
 		 656 aa  525  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182326  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  42.58 
 
 		 727 aa  522  1e-147  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3936  glycogen debranching enzyme GlgX  41.06 
 
 		 766 aa  524  1e-147  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659462  normal  0.365741 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4425  glycogen debranching enzyme GlgX  42.34 
 
 		 697 aa  524  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  40.54 
 
 		 752 aa  520  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0505  glycogen debranching protein GlgX  41.54 
 
 		 714 aa  519  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299874  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  40.34 
 
 		 712 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1670  glycogen debranching enzyme GlgX  41.38 
 
 		 686 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00650022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  39.91 
 
 		 710 aa  521  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001083  glycogen debranching enzyme  42.43 
 
 		 656 aa  521  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  43.64 
 
 		 727 aa  521  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6811  glycogen debranching enzyme GlgX  41.17 
 
 		 702 aa  521  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  40.54 
 
 		 1464 aa  520  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0232  putative alpha amylase  40.06 
 
 		 659 aa  520  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2700  glycogen debranching enzyme GlgX  41.69 
 
 		 845 aa  516  1.0000000000000001e-145  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  40.17 
 
 		 712 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  41.84 
 
 		 706 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2884  glycogen debranching enzyme  41.85 
 
 		 704 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.499516  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1692  glycogen debranching enzyme GlgX  41.35 
 
 		 697 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3733  glycogen debranching enzyme GlgX  39.54 
 
 		 733 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.635331  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3116  glycogen debranching protein GlgX  43.69 
 
 		 698 aa  516  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1112  glycogen debranching enzyme GlgX  41.83 
 
 		 688 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758297  normal  0.439261 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  41.23 
 
 		 751 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1530  glycogen debranching enzyme GlgX  41.85 
 
 		 704 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376415  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  42 
 
 		 712 aa  517  1.0000000000000001e-145  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  40.2 
 
 		 720 aa  513  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  41.94 
 
 		 701 aa  514  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  40.44 
 
 		 722 aa  514  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2164  glycogen debranching enzyme GlgX  41 
 
 		 708 aa  513  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1782  glycogen debranching enzyme GlgX  41.26 
 
 		 688 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2449  putative glycosyl hydrolase  41.26 
 
 		 688 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3793  glycogen debranching enzyme GlgX  40.45 
 
 		 717 aa  509  1e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97477 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  39.21 
 
 		 719 aa  511  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1189  glycogen debranching protein GlgX  40.54 
 
 		 688 aa  511  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.50354  normal  0.29921 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  40.76 
 
 		 714 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  40.76 
 
 		 714 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>