More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1462 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1462  glycogen debranching enzyme GlgX  100 
 
 		 679 aa  1427    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1322  glycogen debranching enzyme GlgX  42.35 
 
 		 733 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831141  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  42.2 
 
 		 733 aa  538  1e-151  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1332  glycogen debranching enzyme GlgX  42.2 
 
 		 733 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3027  glycogen debranching enzyme GlgX  42.2 
 
 		 733 aa  535  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2363  glycogen debranching enzyme GlgX  43.93 
 
 		 701 aa  535  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0149674 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1637  glycogen debranching enzyme GlgX  42.44 
 
 		 691 aa  531  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01253  glycogen debranching enzyme GlgX  44.81 
 
 		 695 aa  528  1e-148  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.358953  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  41.44 
 
 		 733 aa  525  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2757  glycogen debranching enzyme GlgX  40.37 
 
 		 752 aa  525  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1249  glycogen debranching enzyme GlgX  42.11 
 
 		 735 aa  525  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2835  glycogen debranching enzyme GlgX  40.37 
 
 		 752 aa  521  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  40.48 
 
 		 716 aa  516  1.0000000000000001e-145  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  42.16 
 
 		 723 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2933  glycogen debranching enzyme GlgX  40.67 
 
 		 752 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4425  glycogen debranching enzyme GlgX  43.81 
 
 		 697 aa  516  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3116  glycogen debranching protein GlgX  43.94 
 
 		 698 aa  515  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1189  glycogen debranching protein GlgX  40.45 
 
 		 688 aa  509  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.50354  normal  0.29921 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  42.56 
 
 		 738 aa  511  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  40.63 
 
 		 710 aa  511  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1495  glycogen operon protein  41.42 
 
 		 750 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  42 
 
 		 738 aa  504  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  42.38 
 
 		 710 aa  502  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  42.97 
 
 		 716 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2164  glycogen debranching enzyme GlgX  42.9 
 
 		 708 aa  504  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  43.06 
 
 		 716 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1136  glycogen debranching enzyme GlgX  45.58 
 
 		 704 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2983  glycogen debranching enzyme GlgX  41.83 
 
 		 718 aa  501  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602894  normal  0.0199459 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  42.65 
 
 		 720 aa  496  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  42.45 
 
 		 720 aa  498  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0515  glycogen debranching protein GlgX  41.88 
 
 		 739 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7550  glycogen debranching enzyme GlgX  40.77 
 
 		 702 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317676  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0238  glycogen operon protein GlgX  41.51 
 
 		 754 aa  490  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.137822  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  42.21 
 
 		 727 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  42.07 
 
 		 727 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2884  glycogen debranching enzyme  45.58 
 
 		 704 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.499516  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  40.3 
 
 		 721 aa  491  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  42.86 
 
 		 715 aa  492  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  41.46 
 
 		 691 aa  490  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1530  glycogen debranching enzyme GlgX  45.23 
 
 		 704 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376415  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6824  glycogen debranching enzyme GlgX  41.63 
 
 		 739 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  42.17 
 
 		 779 aa  492  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  42.26 
 
 		 758 aa  488  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  41.68 
 
 		 704 aa  488  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  42.29 
 
 		 727 aa  488  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2864  putative glycogen operon protein GlgX  41.46 
 
 		 739 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  42.33 
 
 		 755 aa  488  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1333  glycogen debranching protein GlgX  39.87 
 
 		 705 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0242466  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  42.26 
 
 		 758 aa  488  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6496  glycogen debranching enzyme GlgX  39.87 
 
 		 705 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0828061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  39.71 
 
 		 756 aa  486  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  40.57 
 
 		 717 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2267  glycogen debranching enzyme GlgX  40.47 
 
 		 691 aa  484  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.138313  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  39.4 
 
 		 729 aa  482  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6085  glycogen debranching enzyme GlgX  39.87 
 
 		 705 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0291933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  42.11 
 
 		 757 aa  483  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  40.57 
 
 		 717 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  40.94 
 
 		 717 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  40.58 
 
 		 710 aa  480  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7031  glycogen debranching protein GlgX  39.75 
 
 		 708 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0902  glycogen debranching enzyme GlgX  42.17 
 
 		 694 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.934485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  40.48 
 
 		 717 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  40.87 
 
 		 717 aa  479  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6811  glycogen debranching enzyme GlgX  41.12 
 
 		 702 aa  481  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4049  glycogen debranching enzyme GlgX  41.32 
 
 		 766 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.928409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1103  glycogen debranching enzyme GlgX  43.23 
 
 		 695 aa  478  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.512458 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1565  glycogen debranching enzyme GlgX  40.7 
 
 		 702 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.122779  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0819  glycogen operon protein GlgX, putative  40.7 
 
 		 702 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0962499  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1736  glycogen debranching enzyme GlgX  40.7 
 
 		 702 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  39.56 
 
 		 706 aa  478  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  41.26 
 
 		 719 aa  478  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2226  glycosidase  41.71 
 
 		 694 aa  475  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1542  glycogen debranching enzyme GlgX  40.7 
 
 		 702 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  40.76 
 
 		 720 aa  478  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1337  glycogen debranching enzyme GlgX  40.7 
 
 		 702 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0537  glycogen debranching enzyme GlgX  40.7 
 
 		 702 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  42.42 
 
 		 745 aa  477  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0618  glycogen debranching enzyme GlgX  40.7 
 
 		 702 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.385691  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  39.04 
 
 		 721 aa  479  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3936  glycogen debranching enzyme GlgX  41.32 
 
 		 766 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659462  normal  0.365741 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  41.79 
 
 		 755 aa  474  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  41.1 
 
 		 707 aa  474  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  39.64 
 
 		 701 aa  474  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0505  glycogen debranching protein GlgX  40.89 
 
 		 714 aa  472  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299874  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  41.2 
 
 		 711 aa  475  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  41.65 
 
 		 712 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  41.22 
 
 		 733 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  40.86 
 
 		 719 aa  473  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  42.04 
 
 		 701 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  42.29 
 
 		 700 aa  474  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5488  glycogen debranching enzyme GlgX  39.39 
 
 		 708 aa  474  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.168137  decreased coverage  0.0000616357 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  40.92 
 
 		 712 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1782  glycogen debranching enzyme GlgX  40.45 
 
 		 688 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  40.26 
 
 		 711 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  40.16 
 
 		 719 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0414  glycogen debranching enzyme GlgX  42.51 
 
 		 693 aa  472  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1112  glycogen debranching enzyme GlgX  40.27 
 
 		 688 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758297  normal  0.439261 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  40.72 
 
 		 722 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  41.31 
 
 		 722 aa  467  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2449  putative glycosyl hydrolase  39.97 
 
 		 688 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>