More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1637 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01253  glycogen debranching enzyme GlgX  56.53 
 
 		 695 aa  810    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.358953  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1637  glycogen debranching enzyme GlgX  100 
 
 		 691 aa  1454    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2363  glycogen debranching enzyme GlgX  51.66 
 
 		 701 aa  697    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0149674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  45.74 
 
 		 757 aa  623  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  45.51 
 
 		 756 aa  621  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  45.83 
 
 		 717 aa  615  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  43.95 
 
 		 738 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  44.23 
 
 		 711 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  45.9 
 
 		 720 aa  612  9.999999999999999e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  43.81 
 
 		 738 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  45.38 
 
 		 779 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  43.55 
 
 		 723 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  43.82 
 
 		 729 aa  610  1e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  44.48 
 
 		 755 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  45.33 
 
 		 721 aa  606  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  44.74 
 
 		 755 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  44.19 
 
 		 758 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  45.4 
 
 		 722 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  43.87 
 
 		 719 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  45.35 
 
 		 715 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  44.05 
 
 		 758 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  44.94 
 
 		 710 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2835  glycogen debranching enzyme GlgX  45.11 
 
 		 752 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1332  glycogen debranching enzyme GlgX  44.82 
 
 		 733 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  44.6 
 
 		 733 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  43.9 
 
 		 716 aa  602  1e-170  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2757  glycogen debranching enzyme GlgX  45.11 
 
 		 752 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1322  glycogen debranching enzyme GlgX  44.46 
 
 		 733 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831141  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3027  glycogen debranching enzyme GlgX  44.6 
 
 		 733 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  45.93 
 
 		 704 aa  598  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1136  glycogen debranching enzyme GlgX  44.48 
 
 		 704 aa  598  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16660  glycogen debranching enzyme GlgX  46.04 
 
 		 720 aa  597  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038626 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1249  glycogen debranching enzyme GlgX  45.79 
 
 		 735 aa  595  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  46.04 
 
 		 751 aa  596  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2933  glycogen debranching enzyme GlgX  44.82 
 
 		 752 aa  598  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  47.58 
 
 		 727 aa  598  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  43.39 
 
 		 716 aa  593  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  42.39 
 
 		 704 aa  592  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  44.21 
 
 		 701 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  43.85 
 
 		 710 aa  594  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  43.23 
 
 		 716 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  45.56 
 
 		 720 aa  594  1e-168  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1495  glycogen operon protein  43.59 
 
 		 750 aa  590  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  42.63 
 
 		 727 aa  591  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  44.98 
 
 		 706 aa  590  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  43.14 
 
 		 733 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  43.88 
 
 		 712 aa  588  1e-167  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  42.2 
 
 		 727 aa  587  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2884  glycogen debranching enzyme  45.51 
 
 		 704 aa  586  1e-166  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.499516  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  43.04 
 
 		 720 aa  586  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  45.15 
 
 		 752 aa  587  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1530  glycogen debranching enzyme GlgX  45.51 
 
 		 704 aa  585  1e-166  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376415  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  43.62 
 
 		 745 aa  587  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  43.36 
 
 		 712 aa  587  1e-166  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4425  glycogen debranching enzyme GlgX  44.92 
 
 		 697 aa  586  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  41.73 
 
 		 717 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  41.58 
 
 		 717 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  42.2 
 
 		 719 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  44.93 
 
 		 712 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3116  glycogen debranching protein GlgX  45.33 
 
 		 698 aa  585  1.0000000000000001e-165  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  44.15 
 
 		 719 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  43.74 
 
 		 712 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  44.82 
 
 		 691 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  41.87 
 
 		 717 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  44.54 
 
 		 707 aa  583  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  42.7 
 
 		 711 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  43.1 
 
 		 708 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  45.23 
 
 		 714 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3097  glycogen debranching enzyme GlgX  44.62 
 
 		 720 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139353  normal  0.0684303 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3073  glycogen debranching enzyme GlgX  44.92 
 
 		 713 aa  579  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3080  glycogen debranching protein GlgX  44.62 
 
 		 722 aa  581  1e-164  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.836331  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  41.28 
 
 		 717 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3140  glycogen debranching enzyme GlgX  44.62 
 
 		 720 aa  580  1e-164  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.257674 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  44.64 
 
 		 722 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  45.87 
 
 		 701 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2449  putative glycosyl hydrolase  44.77 
 
 		 688 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1782  glycogen debranching enzyme GlgX  44.18 
 
 		 688 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  45.52 
 
 		 721 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1692  glycogen debranching enzyme GlgX  44.16 
 
 		 697 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3213  glycogen debranching protein GlgX  42.43 
 
 		 728 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  45.85 
 
 		 703 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  45.23 
 
 		 714 aa  578  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1112  glycogen debranching enzyme GlgX  44.62 
 
 		 688 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758297  normal  0.439261 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2164  glycogen debranching enzyme GlgX  43.85 
 
 		 708 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  43 
 
 		 1464 aa  578  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  45.23 
 
 		 714 aa  578  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  44.23 
 
 		 733 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161033 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  42.57 
 
 		 718 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4409  glycogen debranching enzyme GlgX  46.47 
 
 		 695 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.374964 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3733  glycogen debranching enzyme GlgX  42.84 
 
 		 733 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.635331  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2700  glycogen debranching enzyme GlgX  43.5 
 
 		 845 aa  575  1.0000000000000001e-162  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  43.1 
 
 		 714 aa  575  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5877  glycogen debranching enzyme GlgX  44.7 
 
 		 718 aa  568  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3793  glycogen debranching enzyme GlgX  41.89 
 
 		 717 aa  568  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97477 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  43.96 
 
 		 707 aa  569  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  43.55 
 
 		 711 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  44.66 
 
 		 712 aa  569  1e-161  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  45.67 
 
 		 706 aa  569  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  43.55 
 
 		 711 aa  570  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2983  glycogen debranching enzyme GlgX  42.84 
 
 		 718 aa  570  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602894  normal  0.0199459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>