More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001083 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04820  glycogen operon protein GlgX  89.94 
 
 		 682 aa  1259    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0212  glycogen operon protein GlgX  73.63 
 
 		 656 aa  1036    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182326  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0232  putative alpha amylase  56.79 
 
 		 659 aa  797    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001083  glycogen debranching enzyme  100 
 
 		 656 aa  1378    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1637  glycogen debranching enzyme GlgX  43.74 
 
 		 691 aa  535  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2363  glycogen debranching enzyme GlgX  42.22 
 
 		 701 aa  525  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0149674 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01253  glycogen debranching enzyme GlgX  42.43 
 
 		 695 aa  521  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.358953  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  39.88 
 
 		 717 aa  499  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  40.49 
 
 		 721 aa  498  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  44.01 
 
 		 727 aa  498  1e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2983  glycogen debranching enzyme GlgX  41.17 
 
 		 718 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602894  normal  0.0199459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  41.23 
 
 		 745 aa  491  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  41.65 
 
 		 715 aa  491  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  40.14 
 
 		 712 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  41.26 
 
 		 711 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  40.4 
 
 		 712 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  39.91 
 
 		 712 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  40.73 
 
 		 712 aa  484  1e-135  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  38.91 
 
 		 710 aa  476  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  38.76 
 
 		 710 aa  477  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  39.8 
 
 		 706 aa  476  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  40.03 
 
 		 722 aa  476  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  41.42 
 
 		 720 aa  476  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  39.58 
 
 		 707 aa  473  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3116  glycogen debranching protein GlgX  40.33 
 
 		 698 aa  472  1e-132  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  39.27 
 
 		 719 aa  475  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  39.46 
 
 		 716 aa  472  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  40.84 
 
 		 691 aa  474  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  39.83 
 
 		 708 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  39.83 
 
 		 751 aa  473  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  41.13 
 
 		 712 aa  473  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  39.14 
 
 		 711 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  41.03 
 
 		 703 aa  472  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  40.27 
 
 		 719 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  38.34 
 
 		 738 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  39.51 
 
 		 730 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2757  glycogen debranching enzyme GlgX  42.04 
 
 		 752 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  38.05 
 
 		 733 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1332  glycogen debranching enzyme GlgX  38.2 
 
 		 733 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6824  glycogen debranching enzyme GlgX  38.82 
 
 		 739 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3555  glycogen debranching enzyme GlgX  39.34 
 
 		 755 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0361037 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11596  maltooligosyltrehalose synthase treX  40.24 
 
 		 721 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  39.05 
 
 		 733 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1958  glycogen debranching enzyme GlgX  39.74 
 
 		 704 aa  469  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.182778  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  38.08 
 
 		 704 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2835  glycogen debranching enzyme GlgX  42.04 
 
 		 752 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  40.65 
 
 		 701 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  39.15 
 
 		 738 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1136  glycogen debranching enzyme GlgX  39.44 
 
 		 704 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55158  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  39.85 
 
 		 717 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  39.03 
 
 		 715 aa  462  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  39.91 
 
 		 722 aa  462  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.539207  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  38.56 
 
 		 752 aa  465  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  39.18 
 
 		 709 aa  464  1e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1606  glycogen debranching protein GlgX  41.9 
 
 		 729 aa  464  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1322  glycogen debranching enzyme GlgX  38.22 
 
 		 733 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831141  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  40.66 
 
 		 1537 aa  462  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2864  putative glycogen operon protein GlgX  38.82 
 
 		 739 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3213  glycogen debranching protein GlgX  38.32 
 
 		 728 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  38.37 
 
 		 723 aa  465  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3430  glycogen debranching enzyme GlgX  38.48 
 
 		 707 aa  463  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3733  glycogen debranching enzyme GlgX  38.95 
 
 		 733 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.635331  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3027  glycogen debranching enzyme GlgX  38.05 
 
 		 733 aa  465  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  40 
 
 		 710 aa  463  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  38.87 
 
 		 1464 aa  465  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2933  glycogen debranching enzyme GlgX  41.54 
 
 		 752 aa  462  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  38.2 
 
 		 726 aa  463  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  39 
 
 		 714 aa  464  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6707  glycogen debranching protein GlgX  40.42 
 
 		 706 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171756  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3459  glycogen debranching enzyme GlgX  39.28 
 
 		 758 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  unclonable  0.0095234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  39.56 
 
 		 717 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  39.31 
 
 		 779 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  40.24 
 
 		 757 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  39.56 
 
 		 717 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  38.15 
 
 		 701 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3793  glycogen debranching enzyme GlgX  39.01 
 
 		 717 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97477 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  38.02 
 
 		 733 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2795  glycogen debranching enzyme GlgX  38.75 
 
 		 779 aa  461  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0466072  decreased coverage  0.00000490674 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5114  glycogen debranching enzyme GlgX  40.78 
 
 		 708 aa  459  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.84007  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1495  glycogen operon protein  41.59 
 
 		 750 aa  458  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1112  glycogen debranching enzyme GlgX  40.79 
 
 		 688 aa  458  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758297  normal  0.439261 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  38.44 
 
 		 727 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  39.38 
 
 		 719 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2449  putative glycosyl hydrolase  39.71 
 
 		 688 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2700  glycogen debranching enzyme GlgX  40.39 
 
 		 845 aa  459  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  40.19 
 
 		 727 aa  458  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1151  glycogen debranching enzyme GlgX  39.34 
 
 		 756 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.911208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  41.61 
 
 		 714 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3138  glycogen debranching enzyme GlgX  39.13 
 
 		 758 aa  458  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.157891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  41.61 
 
 		 714 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2937  glycogen debranching enzyme GlgX  42.78 
 
 		 703 aa  456  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4425  glycogen debranching enzyme GlgX  39.97 
 
 		 697 aa  457  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  41.61 
 
 		 714 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1103  glycogen debranching enzyme GlgX  39.33 
 
 		 695 aa  456  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.512458 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  39.14 
 
 		 720 aa  458  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  38.25 
 
 		 727 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3335  glycogen debranching enzyme GlgX  39.16 
 
 		 755 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.242143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7550  glycogen debranching enzyme GlgX  36.55 
 
 		 702 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317676  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  37.64 
 
 		 716 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1350  glycogen debranching protein GlgX  42.31 
 
 		 776 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>