More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0212 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04820  glycogen operon protein GlgX  72.73 
 
 		 682 aa  1025    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001083  glycogen debranching enzyme  73.63 
 
 		 656 aa  1036    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0212  glycogen operon protein GlgX  100 
 
 		 656 aa  1379    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182326  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0232  putative alpha amylase  56.48 
 
 		 659 aa  778    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01253  glycogen debranching enzyme GlgX  43.85 
 
 		 695 aa  525  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.358953  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2363  glycogen debranching enzyme GlgX  44.85 
 
 		 701 aa  522  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0149674 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1637  glycogen debranching enzyme GlgX  42.75 
 
 		 691 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  41.48 
 
 		 721 aa  499  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2983  glycogen debranching enzyme GlgX  43.01 
 
 		 718 aa  500  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602894  normal  0.0199459 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1115  glycogen debranching enzyme GlgX  40.66 
 
 		 712 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1184  glycogen debranching enzyme GlgX  40.37 
 
 		 712 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  40.47 
 
 		 717 aa  488  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1056  glycogen debranching enzyme GlgX  40.8 
 
 		 712 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0317  glycogen debranching protein GlgX  40.9 
 
 		 715 aa  486  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1106  glycogen debranching enzyme GlgX  41.26 
 
 		 711 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.546818  normal  0.380802 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1169  glycogen debranching enzyme GlgX  40.6 
 
 		 733 aa  488  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.161033 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  42.1 
 
 		 727 aa  484  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0735  pullulanase  40.26 
 
 		 706 aa  484  1e-135  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0939598  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2676  glycogen debranching enzyme GlgX  40.69 
 
 		 691 aa  481  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2164  glycogen debranching enzyme GlgX  40.79 
 
 		 708 aa  480  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0567  glycogen debranching enzyme GlgX  39.85 
 
 		 722 aa  478  1e-133  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5335  glycogen debranching enzyme GlgX  40.44 
 
 		 723 aa  478  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0240771 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2757  glycogen debranching enzyme GlgX  39.31 
 
 		 752 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5568  glycosyl hydrolase (glycogen debranching enzyme)  41.19 
 
 		 745 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2997  glycoside hydrolase, family alpha amylase catalytic subunit  39.76 
 
 		 727 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16760  glycogen debranching enzyme GlgX  40.48 
 
 		 709 aa  473  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1227  glycogen debranching protein GlgX  41.78 
 
 		 719 aa  475  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170759 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0541  glycogen debranching protein GlgX  41.92 
 
 		 727 aa  473  1e-132  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2835  glycogen debranching enzyme GlgX  39.17 
 
 		 752 aa  474  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5289  glycogen debranching enzyme GlgX  40.96 
 
 		 738 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3130  glycogen operon protein GlgX  39.61 
 
 		 727 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167727  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  38.21 
 
 		 710 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1740  glycogen debranching protein GlgX  40.29 
 
 		 706 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.152679  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3980  glycogen debranching enzyme GlgX  40 
 
 		 712 aa  469  1.0000000000000001e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524127  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3116  glycogen debranching protein GlgX  40.18 
 
 		 698 aa  471  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0988  glycogen operon protein  40.39 
 
 		 716 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.25479 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1322  glycogen operon protein GlgX  39.97 
 
 		 738 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0099235  normal  0.0986293 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01859  glycogen debranching enzyme GlgX  39.19 
 
 		 710 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  40.7 
 
 		 701 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  39.91 
 
 		 711 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2933  glycogen debranching enzyme GlgX  38.83 
 
 		 752 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4055  glycogen debranching protein GlgX  39.91 
 
 		 717 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1462  glycogen debranching enzyme GlgX  42.12 
 
 		 679 aa  468  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03371  glycogen debranching enzyme GlgX  40.96 
 
 		 720 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.13804  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2254  glycogen debranching protein GlgX  40.35 
 
 		 733 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2158  glycogen debranching protein GlgX  39.31 
 
 		 719 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0345133  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3626  glycogen debranching protein GlgX  40.39 
 
 		 701 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0135941 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1136  glycogen debranching enzyme GlgX  40.48 
 
 		 704 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0619  glycogen debranching enzyme GlgX  39.64 
 
 		 709 aa  468  9.999999999999999e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3654  glycogen debranching enzyme GlgX  39.62 
 
 		 717 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348768 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2544  glycogen debranching protein GlgX  40.15 
 
 		 719 aa  465  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  38.66 
 
 		 726 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3631  glycogen debranching enzyme GlgX  39.59 
 
 		 715 aa  462  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1788  glycogen debranching enzyme GlgX  39.76 
 
 		 717 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  38.9 
 
 		 1537 aa  463  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6824  glycogen debranching enzyme GlgX  38.72 
 
 		 739 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5115  glycogen debranching protein GlgX  40.09 
 
 		 714 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36630  putative glycosyl hydrolase  39.76 
 
 		 716 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0278347  normal  0.953744 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5495  glycogen debranching enzyme GlgX  40.09 
 
 		 714 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1358  glycogen debranching enzyme GlgX  39.05 
 
 		 733 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5204  glycogen debranching enzyme GlgX  40.09 
 
 		 714 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.779499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1322  glycogen debranching enzyme GlgX  38.9 
 
 		 733 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.831141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  40.15 
 
 		 710 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  39.38 
 
 		 720 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3146  glycogen debranching enzyme GlgX  39.31 
 
 		 716 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.371141  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2253  glycogen debranching enzyme GlgX  40.71 
 
 		 703 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.146745 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1819  glycogen debranching enzyme GlgX  39.23 
 
 		 717 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11344  normal  0.553566 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2884  glycogen debranching enzyme  40.7 
 
 		 704 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.499516  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3027  glycogen debranching enzyme GlgX  38.9 
 
 		 733 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1607  glycogen debranching enzyme GlgX  40.87 
 
 		 691 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  41.25 
 
 		 718 aa  462  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.231339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3213  glycogen debranching protein GlgX  40.35 
 
 		 728 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2618  glycogen debranching enzyme GlgX  38.76 
 
 		 752 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0936116 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1785  glycogen debranching enzyme GlgX  40.87 
 
 		 691 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2909  glycogen debranching enzyme GlgX  39.2 
 
 		 751 aa  460  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1530  glycogen debranching enzyme GlgX  40.3 
 
 		 704 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376415  normal  0.0851861 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  39.38 
 
 		 1464 aa  461  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4425  glycogen debranching enzyme GlgX  41.12 
 
 		 697 aa  461  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1332  glycogen debranching enzyme GlgX  38.75 
 
 		 733 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2282  glycogen debranching enzyme GlgX  38.48 
 
 		 704 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0218366  hitchhiker  0.000957469 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2786  glycogen debranching enzyme GlgX  38.52 
 
 		 714 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1735  glycogen debranching enzyme GlgX  40.79 
 
 		 691 aa  459  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1495  glycogen operon protein  39.6 
 
 		 750 aa  457  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1891  glycogen debranching enzyme GlgX  42.19 
 
 		 707 aa  456  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1249  glycogen debranching enzyme GlgX  37.52 
 
 		 735 aa  456  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1672  glycogen debranching enzyme GlgX  40.87 
 
 		 691 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.574762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3793  glycogen debranching enzyme GlgX  39.17 
 
 		 717 aa  457  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.97477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1850  glycogen debranching enzyme GlgX  40.03 
 
 		 779 aa  457  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.369764  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  40.03 
 
 		 708 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24860  glycogen debranching enzyme  41.08 
 
 		 720 aa  457  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.624836  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1189  glycogen debranching protein GlgX  38.66 
 
 		 688 aa  457  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.50354  normal  0.29921 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3936  glycogen debranching enzyme GlgX  40.18 
 
 		 766 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659462  normal  0.365741 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1743  glycogen debranching enzyme GlgX  39.31 
 
 		 730 aa  457  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0589275  normal  0.0171762 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0537  glycogen debranching enzyme GlgX  40.18 
 
 		 695 aa  456  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3752  glycogen debranching enzyme GlgX  40.42 
 
 		 720 aa  456  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.742598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4049  glycogen debranching enzyme GlgX  40.18 
 
 		 766 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.928409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1112  glycogen debranching enzyme GlgX  40.96 
 
 		 688 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758297  normal  0.439261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3733  glycogen debranching enzyme GlgX  40.72 
 
 		 733 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.635331  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2864  putative glycogen operon protein GlgX  37.85 
 
 		 739 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1372  glycogen debranching enzyme GlgX  39.73 
 
 		 712 aa  455  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.296905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>