More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1087 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  100 
 
 		 2638 aa  5319    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  96.75 
 
 		 752 aa  1207    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  40.2 
 
 		 843 aa  624  1e-176  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  40.09 
 
 		 843 aa  623  1e-176  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  40.95 
 
 		 852 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  40.95 
 
 		 852 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  48.46 
 
 		 640 aa  615  9.999999999999999e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  40.47 
 
 		 848 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  40.82 
 
 		 850 aa  612  1e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  40.84 
 
 		 852 aa  613  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  40.54 
 
 		 852 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  39.87 
 
 		 899 aa  602  1e-170  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  36.99 
 
 		 1064 aa  598  1e-169  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  37.04 
 
 		 1064 aa  599  1e-169  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  39.51 
 
 		 848 aa  587  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  40.05 
 
 		 856 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  38.49 
 
 		 841 aa  583  1e-164  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  40.14 
 
 		 852 aa  584  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  40.02 
 
 		 852 aa  583  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  39.28 
 
 		 842 aa  581  1e-164  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  38.04 
 
 		 1043 aa  572  1e-161  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  42.7 
 
 		 1136 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  32.46 
 
 		 1888 aa  508  9.999999999999999e-143  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  42.82 
 
 		 655 aa  505  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  42.22 
 
 		 655 aa  498  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  41.55 
 
 		 647 aa  492  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  36.15 
 
 		 713 aa  464  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  35.86 
 
 		 713 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  37.03 
 
 		 712 aa  463  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  35.86 
 
 		 713 aa  457  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  35.71 
 
 		 713 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  35.86 
 
 		 713 aa  461  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  35.86 
 
 		 713 aa  458  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  35.71 
 
 		 713 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  35.71 
 
 		 713 aa  458  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  34.98 
 
 		 713 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  35.57 
 
 		 713 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  39.77 
 
 		 825 aa  457  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  34.87 
 
 		 928 aa  447  1e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  34.16 
 
 		 874 aa  444  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  34.78 
 
 		 718 aa  440  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  35.33 
 
 		 601 aa  395  1e-108  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  37.12 
 
 		 640 aa  377  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  35.7 
 
 		 766 aa  353  3e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.71 
 
 		 1117 aa  342  5.9999999999999996e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  32.49 
 
 		 669 aa  333  2e-89  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.68 
 
 		 1176 aa  315  7.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  28.73 
 
 		 991 aa  307  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  31.43 
 
 		 2156 aa  302  6e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.27 
 
 		 891 aa  295  7e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  30.26 
 
 		 776 aa  291  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  30.78 
 
 		 1062 aa  291  1e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  27.41 
 
 		 1942 aa  289  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.64 
 
 		 1855 aa  285  7.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  28.78 
 
 		 1252 aa  270  2e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.82 
 
 		 1331 aa  269  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  30.54 
 
 		 1025 aa  260  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.6 
 
 		 946 aa  258  9e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.86 
 
 		 1035 aa  253  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  31.03 
 
 		 1975 aa  251  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  27.17 
 
 		 1329 aa  250  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  31 
 
 		 1891 aa  250  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.59 
 
 		 2068 aa  244  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  26.02 
 
 		 1328 aa  242  5.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.85 
 
 		 1248 aa  241  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  27.76 
 
 		 998 aa  234  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.85 
 
 		 1440 aa  232  6e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.73 
 
 		 1440 aa  232  7e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  29.76 
 
 		 1441 aa  232  7e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  27.67 
 
 		 1432 aa  231  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  30.85 
 
 		 528 aa  228  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  30.65 
 
 		 528 aa  226  6e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  25.15 
 
 		 1429 aa  210  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  32.73 
 
 		 533 aa  211  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  25.25 
 
 		 1472 aa  207  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  27.3 
 
 		 1450 aa  206  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  28.36 
 
 		 706 aa  206  6e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  28.14 
 
 		 718 aa  204  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  28.48 
 
 		 729 aa  199  6e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3520  alpha amylase catalytic region  29.38 
 
 		 671 aa  197  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2265  glycogen debranching enzyme GlgX  28.03 
 
 		 708 aa  197  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00202669 
 
 
-
 
NC_002620  TC0312  glycosyl hydrolase family protein  27.11 
 
 		 666 aa  196  4e-48  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0426975  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  27.71 
 
 		 721 aa  194  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1471  glycogen debranching enzyme GlgX  26.82 
 
 		 683 aa  190  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  27.49 
 
 		 700 aa  189  6e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  28.26 
 
 		 727 aa  188  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2576  glycogen debranching enzyme GlgX  26.72 
 
 		 710 aa  188  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  normal  0.165671 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1812  glycogen debranching enzyme GlgX  27.17 
 
 		 718 aa  187  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0893  alpha amylase domain-containing protein  28.71 
 
 		 686 aa  186  6e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0763625  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  31.6 
 
 		 774 aa  185  9.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5164  glycogen debranching enzyme GlgX  27.54 
 
 		 1537 aa  184  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0685376 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  33.59 
 
 		 1021 aa  184  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3828  glycoside hydrolase family 13 protein  26.41 
 
 		 817 aa  184  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535052 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17491  putative isoamylase  28.71 
 
 		 686 aa  183  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  30.58 
 
 		 511 aa  182  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  26.94 
 
 		 724 aa  182  9e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0396  glycogen debranching enzyme GlgX  27.39 
 
 		 726 aa  182  9e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.153348  normal  0.926984 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  32.23 
 
 		 510 aa  181  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0827  glycogen debranching enzyme GlgX  27.99 
 
 		 705 aa  181  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000125239  normal  0.0549007 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1247  glycoside hydrolase family 13 protein  27.87 
 
 		 703 aa  181  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>