More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1683 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  57.47 
 
 		 814 aa  987    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  42.32 
 
 		 838 aa  687    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 836 aa  1714    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  36.99 
 
 		 885 aa  556  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  33.27 
 
 		 510 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  32.06 
 
 		 511 aa  220  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  30.4 
 
 		 526 aa  207  7e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.98 
 
 		 1891 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  27.17 
 
 		 609 aa  197  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  27.93 
 
 		 614 aa  197  9e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  33.12 
 
 		 649 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  27.03 
 
 		 610 aa  196  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  29.31 
 
 		 1942 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  31.58 
 
 		 524 aa  188  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  27.94 
 
 		 620 aa  187  6e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  28.68 
 
 		 642 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  27.31 
 
 		 600 aa  183  9.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  26.53 
 
 		 622 aa  181  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  26.48 
 
 		 1005 aa  181  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  27.79 
 
 		 2638 aa  179  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  27.16 
 
 		 1017 aa  177  5e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  29.25 
 
 		 767 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  29.96 
 
 		 703 aa  172  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  30.08 
 
 		 739 aa  171  3e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  27.55 
 
 		 925 aa  171  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  27.7 
 
 		 484 aa  168  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  29.42 
 
 		 564 aa  166  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  26.89 
 
 		 752 aa  166  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  30.77 
 
 		 1021 aa  163  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  29.34 
 
 		 593 aa  163  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.68 
 
 		 1855 aa  163  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  27.39 
 
 		 599 aa  161  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  27.63 
 
 		 462 aa  160  9e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.97 
 
 		 1975 aa  160  9e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  27.39 
 
 		 624 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  27.42 
 
 		 490 aa  154  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  26.1 
 
 		 619 aa  154  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  27.11 
 
 		 604 aa  153  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  27.63 
 
 		 723 aa  153  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0210  alpha amylase catalytic region  24.68 
 
 		 741 aa  152  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0538024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2636  alpha-amylase family protein  28.14 
 
 		 617 aa  151  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  27.05 
 
 		 631 aa  150  9e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  30.04 
 
 		 532 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.86 
 
 		 2068 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  28.3 
 
 		 623 aa  148  5e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  26.44 
 
 		 559 aa  147  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  27.22 
 
 		 742 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0833  Alpha amylase, catalytic region  27.35 
 
 		 617 aa  146  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05090  putative alpha-amylase  27.2 
 
 		 609 aa  146  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  26.58 
 
 		 574 aa  144  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03660  alpha-amylase AmyA, putative  28.97 
 
 		 606 aa  144  9e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03660  alpha-amylase AmyA, putative  28.97 
 
 		 606 aa  144  9e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  26.68 
 
 		 686 aa  142  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0362  alpha amylase catalytic region  25.43 
 
 		 623 aa  141  3.9999999999999997e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000617875  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  25.63 
 
 		 528 aa  141  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1399  alpha amylase, catalytic region  24.91 
 
 		 620 aa  141  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  27.08 
 
 		 686 aa  140  7.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  25.43 
 
 		 528 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0377  periplasmic alpha-amylase precursor  25.63 
 
 		 690 aa  139  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03308  conserved hypothetical protein. (Eurofung)  25.93 
 
 		 552 aa  137  8e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1887  alpha amylase catalytic region  23.14 
 
 		 659 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114905  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  26.09 
 
 		 654 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02760  Alpha-amylase A precursor, putative  25.77 
 
 		 572 aa  135  3e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  27.41 
 
 		 589 aa  135  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  26.58 
 
 		 515 aa  135  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  30.18 
 
 		 561 aa  134  6e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0150  periplasmic alpha-amylase precursor  24.39 
 
 		 676 aa  134  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  26.32 
 
 		 630 aa  134  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  26.74 
 
 		 665 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002001  periplasmic alpha-amylase  27.27 
 
 		 694 aa  134  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2313  alpha amylase, catalytic region  26.92 
 
 		 686 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  26.79 
 
 		 583 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0104  alpha amylase catalytic region  25.32 
 
 		 653 aa  131  5.0000000000000004e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04507  conserved hypothetical protein  29.97 
 
 		 521 aa  130  7.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  25.93 
 
 		 762 aa  130  7.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0139  alpha amylase catalytic region  24.17 
 
 		 676 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0143  periplasmic alpha-amylase precursor  24.17 
 
 		 676 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2211  alpha amylase, catalytic region  27.23 
 
 		 665 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  27.15 
 
 		 571 aa  130  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0834  alpha amylase catalytic region  22.17 
 
 		 650 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3774  periplasmic alpha-amylase precursor  24.17 
 
 		 676 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  25.04 
 
 		 654 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3951  periplasmic alpha-amylase precursor  24.14 
 
 		 676 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3894  periplasmic alpha-amylase precursor  24.71 
 
 		 676 aa  129  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  25.47 
 
 		 639 aa  129  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  26 
 
 		 574 aa  128  3e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03423  periplasmic alpha-amylase precursor  24.55 
 
 		 676 aa  128  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4068  periplasmic alpha-amylase precursor  24.51 
 
 		 676 aa  128  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  26 
 
 		 641 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0959  a-glucosidase  26.04 
 
 		 527 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.766487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  27.12 
 
 		 610 aa  128  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03374  hypothetical protein  24.55 
 
 		 676 aa  128  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1743  alpha amylase, catalytic region  26.39 
 
 		 619 aa  128  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4947  periplasmic alpha-amylase precursor  23.95 
 
 		 676 aa  127  7e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876495  normal  0.214816 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0951  alpha amylase, catalytic region  25.43 
 
 		 655 aa  127  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0016  periplasmic alpha-amylase precursor  23.33 
 
 		 687 aa  127  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.24938  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4138  periplasmic alpha-amylase precursor  23.33 
 
 		 687 aa  127  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3790  periplasmic alpha-amylase precursor  24.06 
 
 		 687 aa  126  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  26.48 
 
 		 588 aa  126  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2289  alpha amylase, catalytic region  26.98 
 
 		 765 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>