More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0700 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 767 aa  1574    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0210  alpha amylase catalytic region  63.56 
 
 		 741 aa  971    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0538024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  37.86 
 
 		 703 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  35.05 
 
 		 739 aa  376  1e-102  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  33.89 
 
 		 742 aa  372  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  36.28 
 
 		 526 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  30.65 
 
 		 642 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  30.9 
 
 		 649 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  29.33 
 
 		 620 aa  195  3e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  29.06 
 
 		 836 aa  182  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  27.94 
 
 		 571 aa  157  9e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  26.76 
 
 		 510 aa  154  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  28.05 
 
 		 814 aa  150  8e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  28.63 
 
 		 630 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  29.26 
 
 		 564 aa  141  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  27.22 
 
 		 838 aa  140  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  24.71 
 
 		 511 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  27.24 
 
 		 610 aa  133  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.04 
 
 		 1891 aa  132  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  28.05 
 
 		 609 aa  130  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  27.55 
 
 		 600 aa  130  7.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  25.95 
 
 		 885 aa  130  8.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2186  alpha amylase, catalytic region  26.82 
 
 		 576 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  26.49 
 
 		 619 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0362  alpha amylase catalytic region  26.26 
 
 		 623 aa  127  6e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000617875  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  25.26 
 
 		 484 aa  126  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  26.01 
 
 		 1942 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  27.77 
 
 		 524 aa  120  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2667  alpha amylase catalytic region  26.42 
 
 		 853 aa  120  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.749886 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  27.97 
 
 		 490 aa  119  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05090  putative alpha-amylase  24.44 
 
 		 609 aa  119  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0104  alpha amylase catalytic region  26.17 
 
 		 653 aa  118  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  25.75 
 
 		 1005 aa  117  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  27.69 
 
 		 593 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3337  Glycosidase-like protein  25.42 
 
 		 679 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.543706  normal  0.14646 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  26.22 
 
 		 487 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  24.7 
 
 		 762 aa  113  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  27.58 
 
 		 1021 aa  113  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06324  alpha-amylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13460)  26.73 
 
 		 559 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.639353  normal  0.112793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.54 
 
 		 1855 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  27.68 
 
 		 599 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.66 
 
 		 1975 aa  112  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  24.75 
 
 		 639 aa  111  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  26.03 
 
 		 604 aa  110  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2274  alpha amylase catalytic region  23.65 
 
 		 614 aa  110  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0525857 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01888  putative alpha-amylase  25.79 
 
 		 644 aa  110  8.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  24.57 
 
 		 477 aa  110  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  29.75 
 
 		 2638 aa  110  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0148  alpha amylase catalytic region  24.65 
 
 		 878 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0174055 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03402  Alpha-amylasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV09]  27.13 
 
 		 623 aa  108  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.91072 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  24.61 
 
 		 1017 aa  108  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  24.6 
 
 		 493 aa  108  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  30 
 
 		 752 aa  107  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01120  conserved hypothetical protein  25.87 
 
 		 561 aa  107  9e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0180752  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  23.45 
 
 		 528 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  24.83 
 
 		 614 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1049  maltodextrin glucosidase  22.92 
 
 		 607 aa  106  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0895639 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2636  alpha-amylase family protein  24.6 
 
 		 617 aa  105  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  26 
 
 		 481 aa  105  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  23.36 
 
 		 528 aa  104  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  24.37 
 
 		 622 aa  104  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  24.78 
 
 		 925 aa  104  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  25.63 
 
 		 605 aa  104  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  23.61 
 
 		 644 aa  104  7e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0473  maltodextrin glucosidase  25.1 
 
 		 605 aa  103  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00351  maltodextrin glucosidase  25.1 
 
 		 605 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3206  alpha amylase catalytic region  25.1 
 
 		 605 aa  102  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.608393  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  25.29 
 
 		 663 aa  103  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0433  maltodextrin glucosidase  25.1 
 
 		 605 aa  103  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  25.18 
 
 		 481 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00355  hypothetical protein  25.1 
 
 		 605 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3230  maltodextrin glucosidase  25.1 
 
 		 605 aa  102  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1399  alpha amylase, catalytic region  24.09 
 
 		 620 aa  102  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0434  maltodextrin glucosidase  25.1 
 
 		 605 aa  102  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  26.04 
 
 		 558 aa  102  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  24.71 
 
 		 641 aa  101  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3336  Glycosidase-like protein  24.2 
 
 		 997 aa  100  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.310456  normal  0.29304 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  25.43 
 
 		 462 aa  100  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_006681  CNL03660  alpha-amylase AmyA, putative  25.77 
 
 		 606 aa  100  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03660  alpha-amylase AmyA, putative  25.77 
 
 		 606 aa  100  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  22.72 
 
 		 631 aa  99.8  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  24.65 
 
 		 481 aa  100  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  24.31 
 
 		 481 aa  99  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2001  Alpha-amylase  39.6 
 
 		 589 aa  98.6  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.357099  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  24.05 
 
 		 488 aa  98.2  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0480  maltodextrin glucosidase  24.71 
 
 		 604 aa  98.2  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  24.62 
 
 		 582 aa  98.2  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  27.4 
 
 		 454 aa  97.8  7e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  23.88 
 
 		 533 aa  97.4  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3131  maltodextrin glucosidase  23.2 
 
 		 609 aa  97.4  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  23.92 
 
 		 610 aa  97.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  24.68 
 
 		 610 aa  97.1  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  24.51 
 
 		 665 aa  97.1  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  24.44 
 
 		 654 aa  97.4  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  22.75 
 
 		 481 aa  95.9  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  24.95 
 
 		 479 aa  96.7  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3271  maltodextrin glucosidase  23.2 
 
 		 609 aa  96.3  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  25.47 
 
 		 455 aa  96.3  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03480  Alpha-amylase precursor, putative  25.35 
 
 		 532 aa  94.4  8e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389023  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0501  maltodextrin glucosidase  24.66 
 
 		 605 aa  93.6  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524518  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>