More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2289 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2083  alpha amylase catalytic region  92.82 
 
 		 778 aa  1424    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2302  alpha amylase catalytic region  92.37 
 
 		 786 aa  1395    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.073428 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  55.84 
 
 		 641 aa  739    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2135  alpha amylase, catalytic region  67.47 
 
 		 665 aa  964    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.269478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2211  alpha amylase, catalytic region  68.09 
 
 		 665 aa  960    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1785  alpha amylase, catalytic region  54.01 
 
 		 639 aa  729    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.48062  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2313  alpha amylase, catalytic region  67.33 
 
 		 686 aa  955    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.638219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2207  alpha amylase catalytic region  57.37 
 
 		 631 aa  787    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.247913  hitchhiker  0.0000287119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2289  alpha amylase, catalytic region  100 
 
 		 765 aa  1585    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  54.48 
 
 		 654 aa  763    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2036  cyclomaltodextrinase  92.7 
 
 		 774 aa  1419    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.47115  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1660  alpha amylase, catalytic region  47.86 
 
 		 683 aa  623  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01888  putative alpha-amylase  42.11 
 
 		 644 aa  537  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05090  putative alpha-amylase  39.14 
 
 		 609 aa  487  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1399  alpha amylase, catalytic region  36.5 
 
 		 620 aa  464  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0362  alpha amylase catalytic region  37.54 
 
 		 623 aa  444  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000617875  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5089  alpha amylase catalytic region  36.96 
 
 		 619 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000712833  normal  0.235138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2883  alpha amylase catalytic region  35.59 
 
 		 630 aa  419  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.917662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  30.39 
 
 		 610 aa  296  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  29.32 
 
 		 510 aa  190  9e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  28.9 
 
 		 511 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  27.5 
 
 		 600 aa  149  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  28.05 
 
 		 838 aa  139  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  26.9 
 
 		 593 aa  138  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  28.09 
 
 		 1021 aa  136  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  25.36 
 
 		 599 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  26.84 
 
 		 609 aa  134  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  28.57 
 
 		 620 aa  134  6e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  26.13 
 
 		 614 aa  131  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  26.72 
 
 		 584 aa  131  5.0000000000000004e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  24.57 
 
 		 533 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  25.59 
 
 		 583 aa  129  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  28.05 
 
 		 589 aa  128  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  24.89 
 
 		 885 aa  127  9e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  26.98 
 
 		 836 aa  125  4e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.49 
 
 		 1855 aa  124  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  24.74 
 
 		 528 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  28.5 
 
 		 574 aa  124  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  25.62 
 
 		 526 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  24.95 
 
 		 528 aa  122  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  25.16 
 
 		 562 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  27.45 
 
 		 484 aa  119  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  24.84 
 
 		 574 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  25.11 
 
 		 588 aa  118  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  25.58 
 
 		 586 aa  118  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2158  hypothetical protein  65.17 
 
 		 108 aa  118  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  26.11 
 
 		 522 aa  117  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1022  alpha amylase catalytic region  23.31 
 
 		 571 aa  116  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  25.81 
 
 		 814 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  25.54 
 
 		 589 aa  115  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  27.27 
 
 		 610 aa  115  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  26.33 
 
 		 583 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01890  cyclomaltodextrin glucanotransferase  23.67 
 
 		 564 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.773956  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.22 
 
 		 1891 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  24.81 
 
 		 582 aa  113  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  27.64 
 
 		 610 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  24.86 
 
 		 1942 aa  112  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  26.77 
 
 		 586 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  27.23 
 
 		 586 aa  111  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  26.77 
 
 		 586 aa  111  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  22.87 
 
 		 481 aa  111  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2907  alpha amylase catalytic subunit  28.72 
 
 		 715 aa  110  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.245602 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03388  alpha-amylase (Eurofung)  25.19 
 
 		 462 aa  110  9.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.792359 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  24.36 
 
 		 477 aa  110  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  25.4 
 
 		 604 aa  109  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  24.4 
 
 		 515 aa  109  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  25.61 
 
 		 499 aa  109  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  26.76 
 
 		 588 aa  108  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  24.65 
 
 		 649 aa  108  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  28.86 
 
 		 587 aa  107  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1887  alpha amylase catalytic region  24.47 
 
 		 659 aa  107  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114905  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  23.25 
 
 		 509 aa  107  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  22.1 
 
 		 654 aa  107  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  23.92 
 
 		 635 aa  107  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  26.96 
 
 		 524 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  24.71 
 
 		 1975 aa  106  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3416  alpha amylase catalytic region  25.47 
 
 		 703 aa  105  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  25.97 
 
 		 586 aa  104  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  25.94 
 
 		 545 aa  104  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  27.16 
 
 		 586 aa  104  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  25.96 
 
 		 541 aa  104  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  24.95 
 
 		 624 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  22.96 
 
 		 2638 aa  103  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0951  alpha amylase, catalytic region  23.89 
 
 		 655 aa  103  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05100  alpha-amylase  23.85 
 
 		 762 aa  103  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.443393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  25.75 
 
 		 586 aa  103  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  25.75 
 
 		 586 aa  103  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  25.75 
 
 		 586 aa  103  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  27.12 
 
 		 575 aa  102  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  28.78 
 
 		 739 aa  102  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  25.75 
 
 		 586 aa  103  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  25.16 
 
 		 558 aa  102  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  26.98 
 
 		 742 aa  102  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  26.9 
 
 		 586 aa  102  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1046  4-alpha-glucanotransferase  24.67 
 
 		 1145 aa  101  5e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1849  alpha-amylase  26.81 
 
 		 524 aa  100  7e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  25.06 
 
 		 593 aa  100  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  32.8 
 
 		 2068 aa  100  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  25.51 
 
 		 541 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  24.19 
 
 		 578 aa  100  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>